《中国中医药学术年鉴》由纸质（文字版）和光盘（版）两大载体部分组成。
文字版部分设有特载、专论、中医药管理、校院长论坛、学术进展、索引等板块。根据21世纪中医药学术发展的方向和实际情况，本书对原学术进展部分作了较大的调整：譬如。
新增的“院校长论坛”，既可以反映过去一年里中医药教育事业和院校发展的实践与体会，又能体现出院校长们对中医药教学、科研和医疗改革的新思路、新举措。
在“临床各科”板块里，于报道各科临床证治进展之前，特地新设“名医经验”栏目，以便将各地报道的中医名学术经验、临证特色及其用药经验等得以充分反映，更有利于中医药学术经验的继承和发扬。
在“中药”板块中，将原中药理论方面的内容，与“中医基础理论研究”栏目等一起归并在“理论研究”板块中；将“开发利有”栏目分化为“中药资源”、“中药药剂”、“中药营销”栏目，保留原先的“药材鉴定”、“中药化学”、“中药炮制”、“中药药理”、“方剂研究”等栏目，使之能全面准确地反映该学科在新世纪研究和发展的情况。
光盘版设有2002年中医药学术期刊论文目录索引、统计资料、重要会议和文件、中医药科研获奖项目、出版新书目、机构、广告视听等栏目。
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