《现代临床药物大典》的指导思想在于突出“全、新、用”三字。所谓全，一是收载品种全，书中收载了我国遴选的基本药物和我国药典和发达国家药典收载的药物以及近几年来国内外上市且疗效好的新药、化学实体药物品种达4000多个，加上制剂共2万多个品种；二是内容丰富全面，每个药物按正名、中外别名、药效学、临床应用、药动学、毒副作用、相互作用、配伍变化、禁忌症、用法用量、制剂、国内外厂商、附注等项进行介绍，条理清晰，层次分明。所谓新，一是收载品种新，近年来国内外上市的新药尽量收载；二是引用资料新，以反映现代药学发展水平，使《现代临床药物大典》在一个相当长的时期内不失新颖性。所谓用，就是实用、好用，一是不仅对临床医师和药师很实用，对教学、科研、生产、营销等部门的药学人员亦适用；力图语言简炼，阐述精辟，简繁适度，以最小的篇幅蕴含最大量的有用信息，二是《现代临床药物大典》目录以药物治疗分类排列，并收载有价值的附录31个；书末附有中、英文索引，便于查阅，使用方便。
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