计算科学 - ICCS 2006 /会议录 第II部分/Computational science - ICCS 2006

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出版者:
作者:Alexandrov, V. N.; Alexandrov, Vassil N.; Van Albada, G. Dick
出品人:
页数:1122
译者:
出版时间:2006-12
价格:1175.20元
装帧:
isbn号码:9783540343813
丛书系列:
图书标签:
  • 计算科学
  • ICCS 2006
  • 会议录
  • 计算方法
  • 数值分析
  • 科学计算
  • 计算机应用
  • 算法
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  • 建模
  • 高性能计算
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具体描述

This is Volume II of the four-volume set LNCS 3991-3994 constituting the refereed proceedings of the 6th International Conference on Computational Science, ICCS 2006. The 98 revised full papers and 29 revised poster papers of the main track presented together with 500 accepted workshop papers were carefully reviewed and selected for inclusion in the four volumes. The coverage spans the whole range of computational science.

计算机科学与高性能计算前沿探索:精选论文集(2007-2010年精选) 本书简介 本书精选了2007年至2010年间,在计算机科学和高性能计算(HPC)领域具有代表性和影响力的学术研究成果。该时期的计算科学正处于一个重要的转型阶段,一方面,传统的科学计算方法在面对更大规模数据和更复杂模型时持续深化;另一方面,新兴的并行计算架构、网格计算的普及以及对计算效率与可扩展性的极致追求,为该领域注入了新的活力。本书旨在为研究人员、工程师和高级学生提供一个高质量的知识窗口,聚焦于该关键发展阶段的技术突破与理论创新。 本书的内容结构围绕高性能计算的核心挑战、新兴的计算范式以及特定应用领域的计算建模展开,共分为五个主要部分,涵盖了从底层硬件优化到上层应用算法的广泛议题。 --- 第一部分:大规模并行计算架构与优化 本部分深入探讨了2000年代后期至2010年初,主流高性能计算硬件平台的发展趋势及其对软件优化的影响。重点关注了多核处理器(Many-Core Processors)的崛起,以及图形处理器(GPU)开始作为通用计算加速器(GPGPU)的初步探索与应用。 1. 多核与众核架构的编程模型: 随着传统单核性能提升的瓶颈日益明显,多核CPU成为主流。本部分收录的论文详细分析了OpenMP、MPI在应对核数剧增时的局限性,并重点讨论了新兴的编程模型,如Cilk Plus和Factorization-based并行化策略。研究对象包括如何有效利用共享内存层次结构(L1, L2缓存一致性协议)以最小化内存访问延迟,以及在异构计算环境中实现负载均衡的调度算法。 2. GPU计算的早期实践与性能分析: 在2007年至2010年间,NVIDIA CUDA平台的成熟标志着GPGPU计算进入了实用的早期阶段。本部分精选了多篇将传统密集矩阵运算、分子动力学模拟(MD)和傅里叶变换(FFT)移植到GPU上的案例研究。论文不仅展示了显著的加速比,更重要的是,探讨了数据在CPU内存和GPU显存之间高效迁移的策略(如Zero-Copy技术和流(Streams)管理),以及如何将高度并行化的算法结构映射到GPU的SIMT(Single Instruction, Multiple Thread)执行模型上。 3. 集群互连网络与可扩展性挑战: 本书收录的论文也关注了大规模超级计算机集群中的通信瓶颈。研究了Infiniband和高带宽网络(如Cray Seastar架构的早期概念)的性能特征,并提出了针对更复杂拓扑结构(如Fat-Tree和Torus网络)的鲁棒性路由算法。特别是,针对大规模MPI作业中的“同步点”效应和“通信隐藏”技术进行了深入分析。 --- 第二部分:数值线性代数与稀疏计算 稀疏矩阵运算是支撑工程仿真和数据分析的基石。本部分聚焦于该时期针对超大规模稀疏系统求解器的新进展。 1. 超大规模稀疏矩阵存储与操作: 随着有限元方法(FEM)和有限体积方法(FVM)模型尺寸的爆炸式增长,对内存效率提出了极高要求。论文探讨了基于压缩稀疏格式(如CSR、BSR)的变体,特别关注了具有高度不规则性或非结构化网格数据的存储优化。 2. 预条件子设计与迭代求解器: 本部分的核心内容是新型预条件子的开发,以加速共轭梯度法(CG)、广义最小残量法(GMRES)等迭代求解器的收敛速度。重点研究了代数多重网格法(AMG)的改进,特别是针对各向异性问题和高度非结构化网格的鲁棒性AMG构造算法。此外,还包括了基于不完全LU分解(ILU)和Schur补方法在并行环境下的高效实现。 3. 特征值问题的并行求解: 针对大型电子结构计算和模态分析,本部分展示了Lanczos方法和Davidson方法在分布式内存环境下的优化,着重于如何高效地管理大规模Ritz向量子空间并减少全局同步需求。 --- 第三部分:科学计算中的数据管理与中间件 计算科学的瓶颈逐渐从单纯的计算速度转向I/O和数据管理。本部分反映了这一时期的中间件层面的努力。 1. 并行文件系统与I/O性能: 对Lustre和GPFS等主流并行文件系统的I/O模式进行了基准测试与性能瓶颈分析。研究提出了针对写入密集型(Write-Intensive)科学工作负载的元数据优化策略,以及如何利用持久性内存(当时新兴的NVM概念的早期探索)来缓存关键元数据。 2. 容错与计算恢复: 在数百万核时数的计算任务中,节点故障的概率显著增加。本部分收录了关于计算过程中的增量式检查点(Checkpointing)技术,特别是基于异步通信的无阻塞检查点算法,旨在将恢复机制对前向计算进度的影响降到最低。 3. 计算网格与服务导向架构(SOA): 虽然云计算的趋势尚未完全主导HPC,但网格计算(Grid Computing)在分布式资源调度方面仍是研究热点。论文探讨了如何使用OGSA(Open Grid Services Architecture)框架来抽象和管理异构资源池,为大规模科学实验提供中间件服务。 --- 第四部分:高级应用模型与模拟技术 本部分展示了高性能计算在具体科学领域中的前沿应用和方法论创新。 1. 复杂流体动力学(CFD)的高精度模拟: 针对可压缩和不可压缩流体,本部分涉及基于网格自适应细化(Adaptive Mesh Refinement, AMR)的并行实现。重点讨论了涉及激波捕捉的高分辨率格式(如WENO、DG方法)在异构架构上的优化。 2. 计算化学与分子动力学(MD): MD模拟的系统尺寸不断增大。本部分包含了针对长程相互作用(如库仑力)的并行快速多极展开方法(FMM)的最新进展,以及如何高效地在多GPU系统上划分和管理粒子集合。 3. 数据密集型科学发现: 随着模拟结果规模的增大,后处理和可视化成为新的挑战。本部分展示了如何将数据降维技术(如主成分分析PCA的并行实现)直接嵌入到模拟运行过程中,以实现“在模拟中发现”的范式。 --- 第五部分:领域特定语言与工具链 为应对异构性带来的编程复杂性,该时期对领域特定语言(DSL)和编译技术给予了高度关注。 1. 领域特定语言的设计: 收录了针对偏微分方程求解和张量代数的DSL案例,这些语言旨在将高层数学表达与底层的并行性细节解耦。分析了这些DSL如何通过静态分析来指导自动并行化。 2. 性能分析与调试工具: 本部分介绍了当时主流的性能剖析工具(如TAU、Scalasca)的最新版本,以及它们如何扩展以支持对MPI与OpenMP混合编程模型中通信与计算重叠效率的精确测量。此外,还探讨了面向大规模系统的轻量级调试和验证框架。 --- 总结 本书所汇集的这些研究成果,清晰地描绘了2007年至2010年间计算科学界如何应对计算需求的指数级增长。它不仅记录了从传统HPC向异构并行计算过渡的关键技术路径,也体现了科学家们在软件工程、算法创新和硬件适应性方面所付出的巨大努力。对于希望了解现代高性能计算发展根源的研究人员而言,本书提供了宝贵的历史和技术参考。

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读后感

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用户评价

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当试图用现代的眼光去审视2006年的计算科学进展时,这本书提供了一个清晰的“时间胶囊”。我花费了大量时间去理解那些关于“领域分解法”(Domain Decomposition Methods)的优化策略,特别是针对当时的主流CPU架构所做的内存访问模式调整。这些内容在当时无疑是尖端课题,它们体现了研究人员如何将有限的计算资源榨取到极致的智慧。然而,随着GPU计算的兴起和异构计算范式的确立,这些为特定CPU流水线量身定制的优化技巧,其普适性和有效性已经大打折扣。书中充斥着大量的性能对比图表,但这些性能的“绝对值”在今天看来是微不足道的,甚至有些可笑。这迫使我不断地进行心理上的“折算”:把当时最好的性能基准,与今天普通笔记本电脑的默认运行速度进行对比。这种阅读体验,与其说是学习知识,不如说是在进行一次关于技术迭代速度的哲学沉思。这本书是历史的见证者,但对于寻求“当前最佳实践”的读者来说,它提供的“实践”已经成为了“历史教训”。

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说实话,阅读这本《计算科学 - ICCS 2006》的过程,更像是一次穿越时空的田野考察,而非一场知识的“速成班”。我注意到书中对计算资源管理的讨论,它们详细描述了当时超级计算机的用户如何与作业调度系统进行“搏斗”,以及如何通过精巧的程序设计来最小化I/O等待时间。这部分内容,对于理解现代云计算的出现是如何解决了历史遗留的痛点,提供了极佳的对比视角。比如,书中详细描述了如何手动分区数据以适配有限的内存带宽,以及为了避免死锁而采用的复杂同步机制。这些细节,今天我们只需在配置文件里简单勾选一个选项就能自动完成。因此,这本书的价值更多地体现在“历史参照”上——它让我们直观地感受到了计算科学工作者在资源极度受限的环境下所展现出的惊人创造力。但从实际应用的角度看,它像是一份保存完好的古董地图,能告诉你一百年前的路是怎么修的,却不能为你规划今天的环球航线。对于想要快速提升当前项目性能的工程师来说,翻阅这本书的效率,远低于查阅最新的并行编程库文档。

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这本厚重的会晤实录,名为《计算科学 - ICCS 2006 /会议录 第II部分》,光是封面上的那一串数字和缩写,就足以让一个初涉计算领域的研究者望而生畏。我手里捧着它,感觉沉甸甸的,不仅仅是纸张的重量,更像是承载着2006年全球计算科学前沿思想的密度。我原本期待能从中找到一些关于并行计算架构优化的最新突破,或者至少是关于网格计算在当时如何向云计算过渡的关键讨论。然而,当我翻阅目录和随机抽取章节时,那种强烈的“时代感”扑面而来,让我意识到,这更像是一份详实的“历史文献”,而非我所期望的“未来指南”。书中的很多讨论,比如关于特定HPC集群的基准测试,或者针对某一特定数值方法的改进,在今天看来,许多技术路径都已经发生了根本性的转变。我花了相当时间试图从那些关于早期高性能计算软件栈的描述中,捕捉到一些底层逻辑的共性,但坦白说,这种努力是挫败的。很多篇幅似乎聚焦于解决当时特定硬件和软件环境下的“燃眉之急”,这些“急”的问题,在如今的通用框架下已经不值一提了。它无疑是对那一年学术成果的忠实记录,但对于一个急需解决当前实际工程问题的读者而言,它更像是一座需要仔细考据和“翻译”才能使用的博物馆。

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初次接触这套会议论文集时,我更倾向于将其视为一份硬核的学术“食谱”,希望能从中挖掘出新鲜的烹饪技巧。我原本对智能计算和数据挖掘在科学领域的应用抱有极高期望,特别是考虑到2006年正是许多机器学习算法开始大规模商业化应用的前夜。我期待看到,诸如支持向量机(SVM)在复杂物理模拟中的早期尝试,或是早期神经网络在处理大规模非结构化科学数据时的性能评估。然而,书中的论述明显更偏向于经典的数值分析和计算物理。那些关于有限元方法(FEM)的收敛性证明、迭代解算器的误差分析,占据了相当大的篇幅。这些内容固然是计算科学的基石,但对于一个专注于利用新一代计算范式解决问题的学者来说,感觉像是听了一场关于蒸汽机原理的深入讲座,而不是关于喷气式发动机的最新进展。整本书的论调是严谨、保守且高度数学化的,缺乏那种让人眼前一亮的、跨学科的“化学反应”。它像是一个专业领域内部的深度对话,而我作为一个试图将外部新工具引入的“访客”,发现自己手中的工具箱与现场需要的工具大相径庭,阅读过程成了一种对纯粹数学逻辑的耐力考验。

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我对这本会议录的整体印象是:它是一份扎实的、但略显孤立的学术记录。我原本希望能看到更多关于跨领域应用的报道,例如计算生物学、计算金融或是地球系统模拟中,不同计算模型是如何互相借鉴和融合的。然而,书中的各个部分似乎都被牢牢地锁在了各自的学科“筒仓”内。一篇论文可能深入探讨了某个特定偏微分方程的数值稳定性,而下一篇可能完全聚焦于如何优化特定硬件上的矩阵乘法。两者之间鲜有明显的桥梁或引言,更别提那种将不同领域方法论融会贯通的综合性论述了。这种“垂直钻探”式的深度固然可敬,但对于追求系统性、整体性解决方案的读者来说,会感到一种知识碎片化的疲惫。它似乎没有承载“计算科学”作为一个综合性学科的愿景,而是更像是一个由众多独立且高精尖的“小科学”组成的集合体,各自在自己的轨道上运行,互不干扰。想从中找到指导未来研究方向的宏大叙事,几乎是不可能的任务。

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