序
第二版前言
第一版前言
第一章 生物信息學的概念及其發展曆史
第一節 生物信息學的發展曆史
第二節 生物信息學的研究領域
第三節 生物信息學的主要應用
第四節 生物信息學麵臨的挑戰
思考題
參考文獻
第二章 生物學數據庫及其檢索
第一節 生物學數據庫簡介
第二節 生物學數據庫的內容與結構
第三節 生物學數據庫的檢索
思考題
參考文獻
第三章 序列比對原理
第一節 序列比對相關概念
第二節 序列比對打分方法
第三節 序列比對算法
第四節 序列比對工具
第五節 多序列比對
思考題
參考文獻
第四章 蛋白質結構預測與分析
第一節 蛋白質結構組織層次
第二節 蛋白質結構的測定與理論預測
第三節 蛋白質對接
第四節 蛋白質摺疊與疾病
思考題
參考文獻
第五章 真核生物基因組的注釋
第一節 蛋白質編碼基因的注釋
第二節 RNA基因的注釋
第三節 重復序列的注釋
第四節 假基因的注釋
第五節 案例分析：黃瓜基因組的注釋
思考題
參考文獻
第六章 蛋白質組學
第一節 蛋白質組學概述
第二節 蛋白質的大規模分離鑒定技術
第三節 蛋白質的翻譯後修飾
第四節 蛋白質分選
第五節 蛋白質相互作用
思考題
參考文獻
第七章 係統生物學
第一節 係統生物學基本概念
第二節 係統生物學基本技術與方法
第三節 先進的成像技術
第四節 基因錶達調控網絡
第五節 代謝網絡
第六節 信號轉導途徑
第七節 蛋白質一蛋白質相互作用網絡
第八節 虛擬細胞
思考題
參考文獻
第八章 閤成生物學
第一節 閤成生物學概述
第二節 閤成生物學基礎研究經典實例
第三節 閤成生物學應用研究經典實例
思考題
參考文獻
第九章 分子進化與係統發育
第一節 分子進化與係統發育
第二節 分子係統發育樹的構建方法
第三節 係統發育樹構建及應用
思考題
參考文獻
第十章 統計學習與推理
第一節 統計學習與推理基礎
第二節 統計模型與參數推斷
第三節 聚類分析、主成分分析與Fisher判彆
第四節 貝葉斯推理
第五節 隱馬爾可夫模型
第六節 動態神經網絡
第七節 支持嚮量機
第八節 MATLAB的應用實例
思考題
參考文獻
第十一章 生物信息學編程基礎
第一節 Linux操作係統
第二節 生物信息學中的編程語言
第三節 SQL及數據庫編程
第四節 並行計算
思考題
參考文獻
第十二章 第二代測序技術及其應用
第一節 測序技術概述
第二節 第二代測序原理
第三節 第二代測序技術的應用
第四節 生物信息學在第二代測序中的應用
思考題
參考文獻
· · · · · · (收起)