Analytical Tools for DNA, Genes and Genomes pdf epub mobi txt 电子书下载 2026

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出版者:Paul & Co Pub Consortium

作者:Markoff, Arseni

出品人:

页数:264

译者:

出版时间:2005-6

价格:$ 50.79

装帧:Pap

isbn号码:9780974876511

丛书系列:

图书标签:

DNA分析
基因组学
分子生物学
生物技术
遗传学
基因工程
生物信息学
基因检测
分析化学
生命科学

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具体描述

An exhaustive guide to the handling, interpretation, and application of information contained in the sequence of DNA, this resource is an essential tool for academic, industrial, and private researchers in the field of life sciences. Information on applying DNA sequence information in genetics, using DNA sequence analysis and recognition software for DNA structural elements, and predicting and modeling higher order DNA structures is provided along with links to relevant web sites and an explanation of their corresponding interfaces. Chapters are formatted as frequently asked questions regarding structure, function, regulation, and the evolution of coding and non-coding DNA sequences, and reflects previously probed and published strategies for data mining and interpretation.

好的，这是一本名为《Advanced Omics Technologies: From Sequence to Function》的图书简介。 --- 图书名称：《Advanced Omics Technologies: From Sequence to Function》 ISBN： 978-1-23456-789-0 图书简介在二十一世纪的生命科学领域，高通量“组学”技术（Omics Technologies）已经彻底改变了我们对生物系统的理解。从基因组学到蛋白质组学，再到代谢组学，这些前沿技术为研究者提供了前所未有的视角，用以解析生命活动在分子层面的复杂性。然而，仅仅获得海量数据是不够的；真正的挑战在于如何有效地整合、解释这些异构数据，并将其转化为具有生物学意义的知识。《Advanced Omics Technologies: From Sequence to Function》旨在为生命科学、生物信息学以及相关领域的专业人士和高级研究生，提供一个全面、深入且高度实践导向的指南，聚焦于如何利用最尖端的组学技术，从分子序列信息出发，系统地探究其在细胞、组织乃至整个生物体中的功能实现。本书的结构设计遵循了从基础技术平台到复杂数据整合分析的逻辑链条。我们摒弃了对基础分子生物学概念的冗长回顾，而是直接切入当代研究的核心工具和策略。核心内容板块：第一部分：前沿测序平台与单细胞组学革命本部分首先探讨了下一代测序（NGS）技术的发展前沿，特别关注长读长测序技术（如PacBio HiFi和Oxford Nanopore）在解决基因组结构变异和重复区域解析中的关键作用。随后，我们将深入解析单细胞组学（Single-Cell Omics）的原理、技术瓶颈及解决方案。具体章节将涵盖：单细胞转录组测序（scRNA-seq）的文库构建策略、数据稀疏性处理与细胞类型注释的自动化流程。单细胞表观遗传学的突破性进展，重点介绍scATAC-seq和scBS-seq在解析染色质可及性和DNA甲基化图谱中的应用。空间组学（Spatial Omics）技术概述，如何将分子信息与组织结构重新关联，包括基于成像的捕获方法和微切割技术。第二部分：蛋白质组学与代谢组学的深度融合数据不再局限于核酸层面。本部分将详细阐述如何通过高分辨率质谱技术，对蛋白质组和代谢组进行精确量化和功能鉴定。深度蛋白质组学：内容聚焦于基于肽段的高通量定量方法（如TMT和SILAC），以及如何应对蛋白质翻译后修饰（PTMs）的复杂性分析。特别强调了非标记定量方法在处理临床样本中的优势与局限。靶向与非靶向代谢组学：讨论如何利用高分辨质谱（HRMS）平台进行代谢物的高效分离与鉴定。内容将深入到代谢通路重构和体内稳态调节的生物学诠释。数据互操作性：探讨如何将蛋白质组数据与基因表达数据进行交叉验证，以识别关键的功能性调控环路。第三部分：多组学数据整合与计算方法论这是本书的核心价值所在，旨在弥合“数据生成”与“知识发现”之间的鸿沟。本部分详细介绍整合不同组学数据的先进计算框架。降维与可视化技术：回顾并比较了t-SNE, UMAP, 以及更先进的流形学习技术在处理高维组学数据集中的表现。因果推断与网络构建：重点介绍基于概率图模型（PGM）和动态贝叶斯网络（DBN）的方法，用于从关联性数据中推断潜在的调控关系和因果路径。机器学习在组学中的应用：深入探讨监督学习（分类和预后模型构建）和无监督学习（表型聚类和新亚型发现）在临床转化中的实际案例。我们将提供关于如何评估模型泛化能力和避免过拟合的实用建议。功能注释与生物学解释：介绍如何利用基因本体论（GO）、通路富集分析（GSEA）的升级版工具，将统计学显著性转化为具有生物学意义的叙述。第四部分：转化医学与新兴应用案例本部分将视角转向组学技术的实际应用，特别是其在疾病诊断、药物开发和个性化医疗中的潜力。液体活检与循环组学：分析循环肿瘤DNA（ctDNA）、循环RNA和外泌体蛋白质组在早期癌症筛查和治疗监测中的最新进展。微生物组与宿主互作：探讨宏基因组学（Metagenomics）和宏转录组学（Metatranscriptomics）如何揭示微生物群落结构与宿主生理状态之间的复杂互作。技术验证与可重复性：探讨组学研究中标准操作流程（SOP）的重要性，以及如何设计具有高度可重复性的实验和分析流程，以满足临床验证的要求。本书特色：本书的每一个章节都配有详细的方法学讨论和代码示例片段（使用R/Python），旨在确保读者不仅理解理论，还能立即将所学知识应用于自己的数据分析流程中。我们侧重于批判性评估现有工具的优势与限制，鼓励读者根据具体研究问题选择最合适的分析策略，而非盲目遵循“标准流程”。《Advanced Omics Technologies: From Sequence to Function》是科研人员深入掌握现代高通量生物学工具箱，并推动下一代生命科学发现的必备参考书。