Testing Methods for Seed-transmitted Viruses

Testing Methods for Seed-transmitted Viruses pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Oxford Univ Pr
作者:Albrechtsen, S. E.
出品人:
页数:268
译者:
出版时间:2006-1
价格:$ 141.25
装帧:Pap
isbn号码:9780851990163
丛书系列:
图书标签:
  • Seed-transmitted viruses
  • Virus detection
  • Seed health
  • Plant virology
  • Diagnostic methods
  • Plant pathology
  • Seed testing
  • Laboratory techniques
  • Molecular diagnostics
  • Virus transmission
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具体描述

This practical guide covers the commonly used detection methods for seed-transmitted viruses and viroids that affect both tropical and temperate crops. It contains 25 complete step-by-step procedures for biological, serological and molecular techniques to detect and identify such viruses. Combining helpful practical notes with more detailed explanations of the principles behind the techniques, the book describes the general characteristics of seed-transmitted viral diseases and discusses outlines for the organization and interpretation of seed health assays. The techniques reviewed are also applicable to non-seed-transmitted viral agents.

生物分子诊断技术前沿:从宏基因组学到单细胞分析 内容简介 本书深入探讨了当前生物医学研究和临床诊断领域最前沿的分子检测技术,聚焦于那些在《Testing Methods for Seed-transmitted Viruses》一书中未曾涉及的、更广泛的生命科学应用场景。全书结构严谨,内容涵盖了从高通量测序技术的新发展到革命性的空间生物学工具,旨在为生物技术研究人员、临床实验室专家以及对现代诊断学感兴趣的学者提供一个全面而深入的参考框架。 第一部分:高通量测序技术的新浪潮与数据解析 第一章:宏基因组学在复杂微生物群落解析中的应用 本章详细剖析了新一代宏基因组学(Metagenomics)技术如何超越传统的基于培养的方法,用于描绘环境样本(如土壤、海洋水体、人类肠道)中所有遗传物质的总和。我们将重点介绍从样本采集、DNA提取优化到高通量测序平台选择的整个流程。特别地,本章将深入讨论: Shotgun Metagenomics vs. 16S rRNA Amplicon Sequencing: 比较两者在物种多样性鉴定、功能基因预测及定量分析上的优势与局限。 生物信息学管道构建: 详细介绍从原始数据(Raw Reads)到可解释结果的完整流程,包括去噪、组装(Assembly)、基因组分箱(Binning)技术,以及如何利用功能基因数据库(如KEGG、COG)进行代谢通路重建。 案例研究: 探讨宏基因组学在揭示抗生素耐药性基因(ARGs)传播网络中的关键作用。 第二章:单细胞组学技术:分辨率的飞跃 随着对细胞异质性理解的加深,单细胞分析已成为现代生物学研究的核心驱动力。本章聚焦于单细胞测序技术(Single-Cell Sequencing)的原理和实践。 单细胞RNA测序 (scRNA-seq): 阐述从液滴微流控(如10x Genomics平台)到基于孔板的方法中,如何实现数千个细胞的转录组捕获。重点分析降维与聚类算法(如t-SNE, UMAP)在识别罕见细胞亚群中的应用。 单细胞ATAC测序 (scATAC-seq): 探讨如何研究染色质可及性,以理解基因调控网络的动态变化,以及如何将scRNA-seq与scATAC-seq数据进行整合分析(Multi-omics Integration)。 单细胞蛋白质组学与表观遗传学: 简要介绍新兴的单细胞蛋白质检测技术及其在肿瘤微环境研究中的潜力。 第二部分:分子检测平台的演进与临床转化 第三章:数字PCR (dPCR) 在高灵敏度检测中的地位 数字PCR以其绝对定量和对PCR效率不敏感的特性,在痕量核酸检测中展现出无与伦比的优势。 dPCR 的基本原理与分区技术: 详细介绍基于微流控液滴(Droplet Digital PCR, ddPCR)和基于隔室板(Chip-based Digital PCR)的技术平台,对比其适用范围。 定量准确性与应用: 重点讨论dPCR在循环肿瘤DNA(ctDNA)的微小残留病灶(MRD)监测、稀有突变检测以及病毒载量精确测定中的核心地位,区别于传统qPCR的相对定量模式。 第四章:基于纳米孔测序的即时诊断(PoC Diagnostics) 第三代测序技术,特别是牛津纳米孔(Oxford Nanopore Technologies, ONT)的实时、便携式测序能力,正在重塑现场诊断的格局。 纳米孔技术机理: 阐述DNA/RNA分子通过纳米孔时产生的电流信号变化,以及如何实现超长读长测序。 便携式设备在非中心化环境的应用: 探讨MinION和Flongle等设备在资源受限地区或快速响应流行病学调查中的优势,包括直接RNA测序和表观遗传信息捕获。 数据实时分析挑战: 讨论如何构建能在现场快速运行的生物信息学流程,以支持即时决策。 第三部分:空间生物学与成像技术 第五章:空间转录组学:解析组织中的基因表达地理 理解细胞在组织微环境中的空间位置及其相互作用,是理解复杂疾病如癌症和神经退行性疾病的关键。空间转录组学技术应运而生。 基于成像的解码技术(Imaging-based Decoding): 详细介绍如MERFISH、seqFISH+等原位测序技术,它们如何实现对数千个基因在单细胞分辨率上的空间定位。 基于捕获组学的空间方法: 阐述Slide-based spatial methods(如Visium),如何通过空间条形码捕获组织切片上的转录组信息,并进行高度依赖空间坐标的生物学解释。 多模态空间整合: 讨论如何将空间蛋白质组学数据与空间转录组学数据进行融合分析,以构建更全面的组织功能图谱。 第六章:新兴的活体成像技术与生物传感器 本章关注那些允许研究人员在非破坏性条件下实时监测生物过程的技术。 荧光蛋白与报告基因系统: 探讨更稳定、光漂白更低的荧光染料和环境敏感型报告基因(如pH敏感、钙离子敏感探针)在细胞行为追踪中的应用。 光遗传学与化学遗传学工具: 介绍如何利用这些工具精准调控特定细胞群的活动,并结合高性能显微镜(如双光子显微镜)进行功能验证。 基于核酸适配体的生物传感器: 探讨适用于体内或即时检测的、高特异性的DNA/RNA适体传感器设计原理及其在环境监测和临床前研究中的潜力。 结论与展望 本书最后一部分将总结当前分子诊断和生物学研究中面临的共同挑战,包括数据标准化、生物信息学工具的互操作性,以及如何将实验室的突破性技术有效地转化为可负担、可及的临床诊断工具。重点展望下一代仪器平台在精度、速度和成本效益方面的预期发展方向。

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