The Handbook of Metabonomics and Metabolomics

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出版者:Elsevier Science
作者:Lindon, John C. (EDT)/ Nicholson, Jeremy K. (EDT)/ Holmes, Elaine (EDT)
出品人:
页数:572
译者:
出版时间:2007-1-11
价格:USD 275.00
装帧:Hardcover
isbn号码:9780444528414
丛书系列:
图书标签:
  • Bioinformatics
  • Metabolomics
  • Metabonomics
  • Biochemistry
  • Analytical Chemistry
  • Systems Biology
  • Bioinformatics
  • Drug Discovery
  • Biomarkers
  • Disease Diagnosis
  • Clinical Chemistry
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具体描述

Molecular biology operates at three levels: genes, proteins and metabolites. This book is unique in that it provides a comprehensive description of an approach (metabonomics) to characterise the endogenous metabolites in a living system, complementing gene and protein studies (genomics and proteomics). These "omics" methods form the basis for understanding biology at a systems level. "The Handbook of Metabonomics and Metabolomics" aims to be the definitive work on the rapidly expanding subjects of metabolic profiling, metabolite and biomarker identification, encompassing the fields of metabonomics and metabolomics. It covers the principles of the subject, the analytical and statistical techniques used and the wide variety of applications. It offers a comprehensive description of an approach (metabonomics) to characterise the endogenous metabolites in a living system, complementing gene and protein studies; aims to be the definitive work on the rapidly expanding subjects of metabolic profiling, metabolite and biomarker identification; and, covers the principles of the subject, the analytical and statistical techniques used and the wide variety of applications.

深入探索生命奥秘:现代生物学研究前沿 本书旨在为生命科学领域的研究人员、高级学生以及对生物化学和生理学交叉领域抱有浓厚兴趣的专业人士,提供一个全面、深入且极具前瞻性的视角,聚焦于当前生命科学研究中最活跃、最具影响力的几个核心方向。我们摒弃了对特定分析技术流程的详尽罗列,转而深入探讨驱动当代生物学理解进步的基础理论、实验范式革新以及跨学科整合的必要性。 全书结构围绕理解生命体复杂性、动态调控机制以及系统性疾病机理三大主线展开,力求构建一个清晰的知识框架,使读者能够超越单一学科的局限,把握宏观生物学图景。 --- 第一部分:生命系统与动态平衡:从分子到细胞的调控网络 本部分聚焦于生命体内部持续进行的分子交互作用及其对整体稳态的维护机制。我们详细阐述了细胞如何通过复杂的反馈回路和信号传导级联反应,对内外部环境变化做出精准响应。 第一章:基因表达调控的精细化景观 本章超越了经典的转录因子与启动子结合模型,深入探讨了表观遗传学在塑造细胞身份和环境适应性中的核心作用。我们分析了DNA甲基化、组蛋白修饰(如乙酰化、甲基化、磷酸化)的动态变化如何构建可塑性的染色质结构,并实时调控基因组的可及性。此外,非编码RNA(ncRNA),特别是长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA),作为精密的分子开关和支架蛋白,如何在转录后和转录水平上精细调控靶基因的表达,被置于核心地位进行剖析。我们探讨了调控网络中的“噪音”——随机性波动——如何被生物系统利用,而非仅仅视为干扰,甚至可能在细胞分化过程中发挥关键的“随机游走”作用。 第二章:细胞间通讯与组织形态发生 细胞并非孤立的实体,它们依赖于高效且多样的通讯网络来协调复杂的生命活动,如胚胎发育、免疫应答和组织修复。本章细致考察了旁分泌、自分泌、内分泌等经典模式,并着重介绍了新兴的研究热点:细胞外囊泡(Extracellular Vesicles, EVs)介导的远距离信息传递。微囊泡、外泌体携带的蛋白质、脂质和核酸如何重编程接收细胞的生理状态,以及这些机制在肿瘤微环境重塑中的应用潜力,将作为案例进行深入分析。此外,我们还讨论了细胞黏附分子(CAMs)和细胞外基质(ECM)如何协同作用,不仅提供结构支撑,更作为重要的信号整合平台,指导细胞迁移和组织结构的形成。 第三章:能量代谢的整合调控 本部分将能量代谢视为一个高度整合的系统,而非孤立的生化路径集合。我们剖析了线粒体在ATP生成之外,作为信号分子枢纽的角色。重点探讨了AMPK、mTORC1/2等关键感知通路如何集成营养状态、氧气水平和生长因子信号,从而对糖酵解、氧化磷酸化、脂肪酸氧化和蛋白质合成等过程进行全局性调控。特别关注了营养素感应如何通过代谢中间产物(如琥珀酸盐、果糖二磷酸)直接影响表观遗传酶的活性,从而实现代谢与遗传信息的双向反馈,揭示代谢重编程在细胞命运决定中的深刻意义。 --- 第二部分:系统生物学方法论与复杂性解析 本部分着眼于现代生物学研究范式的转变,强调从还原论走向整体论,运用数学建模和大数据整合来解析生命系统的涌现特性。 第四章:数据驱动的生物学发现 随着高通量技术的发展,生物学研究正经历一场由“假设驱动”向“数据驱动”的范式迁移。本章系统回顾了多组学(Omics)数据的整合策略。重点讨论了如何利用基因组学、转录组学、蛋白质组学和脂质组学的数据集成分析,构建生物分子网络的相互作用图谱。我们探讨了网络拓扑学分析(如中心性度量、模块识别)在识别关键调控节点(Hub Genes/Proteins)中的效用,以及如何通过这些网络模型来预测生物过程中的动态变化。数据标准化、偏差校正和生物学可解释性是本章强调的重点。 第五章:生物系统建模与动力学仿真 理解生命系统的关键在于捕捉其动态行为。本章介绍了基于数学和计算的建模方法,用于描述生物过程的时间演化和状态转换。我们比较了代谢通量分析(MFA)、约束优化建模(COM)和基于微分方程的动力学建模(ODEs)的优劣。特别关注了如何利用随机过程模型来模拟细胞内的低分子数量事件,并探讨了如何将这些模型与实验观察相结合,进行参数估计和不确定性量化,从而提升模型对生物学现象的预测能力。 --- 第三部分:疾病的系统性视角与新型干预靶点 本部分应用前述的系统性理解框架,聚焦于复杂疾病,如代谢紊乱性疾病和癌症,如何体现系统失衡,并探索跨层面的干预策略。 第六章:代谢失衡与慢性疾病的系统根源 本章将非传染性慢性疾病(如2型糖尿病、非酒精性脂肪肝病等)视为系统性稳态失调的体现。我们不再将重点局限于单一分子通路,而是分析多个关键代谢网络(如葡萄糖代谢、脂质代谢、胆汁酸循环)之间如何相互耦合,当某个环节出现功能障碍时,如何通过交叉对话(Cross-talk)将压力传递至其他系统,最终导致疾病的发生和进展。重点分析了肠道微生物群作为关键的“外部器官”,如何通过其代谢产物(短链脂肪酸、细菌脂多糖等)影响宿主的能量平衡和免疫炎症状态。 第七章:肿瘤的生物学异质性与生态位研究 癌症的研究正在从寻找“通用靶点”转向理解肿瘤微环境(TME)的复杂生态系统。本章深入探讨了肿瘤细胞内部的代谢重编程(Warburg效应的深化理解)如何为其快速增殖提供动力。更重要的是,我们强调了肿瘤细胞与其周围基质细胞、免疫细胞、血管内皮细胞之间的动态竞争与共生关系。通过分析TME中氧气梯度、营养物质匮乏如何塑造细胞的表型可塑性,以及如何利用这些异质性信息来设计更具抵抗性的联合疗法,提供前沿见解。 第八章:干预靶点的多尺度验证与转化 最后,本章探讨了如何将从细胞或系统层面发现的潜在靶点,有效地转化为具有临床价值的干预手段。这涉及从体外模型(如类器官、器官芯片)到体内动物模型的验证流程,强调了跨尺度实验设计的严谨性。我们讨论了新型生物制剂、精准营养干预以及靶向特定代谢节点的药物分子,如何通过调节已识别的关键网络节点或模块,实现对疾病状态的逆转或控制,从而指导未来个体化精准医学的发展方向。 本书的宗旨是激发读者从更宏大的视角审视生命现象,鼓励在基础研究中融合计算思维与多组学技术,最终推动对生命系统复杂性更深刻的理解和更有效的生物医学转化。

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读后感

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用户评价

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读完《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》这本书,我感到自己的知识体系得到了极大的拓展和升华。这本书的内容之丰富,覆盖面之广,让我为之折服。我尤其被书中关于环境代谢组学部分的论述所吸引。在当今全球环境问题日益严峻的背景下,了解环境因素如何影响生物体的代谢,以及生物体如何通过代谢来适应环境变化,具有极其重要的现实意义。书中详细介绍了代谢组学在评估环境污染物对生物体的影响、研究生态系统健康状况、以及开发环境修复技术等方面的应用。这些内容不仅让我对环境科学有了全新的认识,也让我看到了代谢组学在解决全球性环境挑战方面的巨大潜力。此外,书中对生物标志物的发现和验证过程的细致讲解,也让我对如何利用代谢组学来寻找疾病的早期诊断标志物有了更深入的理解。作者并没有简单地给出结论,而是深入剖析了从数据挖掘到实验验证的整个过程,让读者能够清晰地了解其中的挑战与机遇。这本书让我深刻地认识到,代谢组学绝不仅仅是某个学科的附属,而是一门能够跨越多个领域、解决复杂问题的核心技术。它像一座桥梁,连接了生物学、化学、医学、环境科学等众多学科,为我们理解生命体的运作机制提供了前所未有的视角。

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翻开《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》这本书,我仿佛置身于一个微观的生物化学宇宙,而这本书则是我的星际导航仪。其编排的精心程度令人赞叹,从最基础的概念阐述,到最尖端的研究进展,无不涵盖其中。我尤其欣赏作者在介绍代谢组学与人类健康之间联系时所展现出的深刻洞察力。书中详细列举了代谢组学如何帮助我们理解癌症、糖尿病、心血管疾病等复杂疾病的发病机制,以及如何通过分析代谢物的变化来早期诊断疾病、监测治疗效果,甚至预测疾病的复发风险。这些真实世界的案例,让我深切体会到代谢组学在提升人类健康水平方面的巨大潜力。而且,书中对于不同研究场景下代谢组学数据解读的指导,也为我解决实际科研问题提供了宝贵的思路。例如,在解释如何区分正常生理状态下的代谢变化与病理状态下的代谢异常时,作者引用了大量的实例,并提供了详细的分析流程,这对于我进行相关的研究工作极具参考价值。另外,这本书在阐述代谢组学研究伦理和数据共享问题时,也显得十分前瞻和负责任。在当前大数据和人工智能飞速发展的时代,这些议题的重要性不言而喻。《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》不仅是一本知识的宝库,更是一本能够启迪思考、指引方向的航灯。它让我意识到,在我们身体的每一个角落,都隐藏着无数与健康息息相关的代谢信息,而代谢组学正是解锁这些信息的神奇钥匙。

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这本书给我带来了太多意想不到的惊喜,仿佛打开了一扇通往未知科学世界的大门。我本以为“代谢组学”这样一个听起来颇为专业和抽象的领域,会是一堆枯燥乏味的理论和复杂的图谱,但《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》却以一种极其引人入胜的方式,将这个领域的前沿知识娓娓道来。从一开始,作者就用生动形象的比喻,将复杂的生物化学过程解释得浅显易懂,让我这个非专业背景的读者也能迅速抓住核心概念。书中对于代谢组学在疾病诊断、药物研发、营养学乃至环境科学等多个领域的应用案例的详尽阐述,更是让我惊叹于这项技术强大的潜力和广阔的前景。我尤其喜欢书中对不同代谢组学技术平台(如质谱、核磁共振)的原理、优缺点以及适用范围的深入剖析,这让我对如何选择合适的技术来解决具体科学问题有了更清晰的认识。而且,作者在介绍这些技术时,并没有停留在理论层面,而是结合了大量的实际研究数据和图表,使得整个阅读过程既有理论的深度,又不乏实践的指导意义。最让我印象深刻的是,书中对于数据分析和生物信息学在代谢组学研究中的重要性的强调。过去我总是觉得这些部分是统计学家的事,但这本书让我意识到,理解和解读海量代谢组学数据,离不开强大的生物信息学工具和严谨的统计学方法。书中对这些方法的介绍,尽管涉及一定的数学和编程知识,但作者的讲解逻辑清晰,循序渐进,即使是初学者也能从中受益匪浅。总而言之,《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》是一本集理论性、实践性、前沿性于一体的杰出著作,它不仅为我这个门外汉打开了代谢组学的大门,更激发了我深入探索这个迷人领域的浓厚兴趣。我强烈推荐给任何对生命科学、生物化学、医学研究以及数据科学感兴趣的读者,这本书绝对会成为你宝贵的知识财富。

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《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》这本书的专业性与通俗性的完美结合,给我留下了深刻的印象。虽然内容涉及复杂的生物化学和数据分析,但作者的讲解清晰流畅,逻辑性强,使得非专业人士也能轻松理解。我特别喜欢书中关于代谢组学在个性化医疗领域的应用探讨。书中详细阐述了如何利用个体的代谢组学信息,来为患者制定最适合的治疗方案,从而提高疗效并降低副作用。例如,在癌症治疗中,通过分析肿瘤细胞的代谢特征,我们可以选择最有效的靶向药物;在药物代谢研究中,通过分析个体对药物的代谢差异,我们可以预测药物的疗效和毒性。这些个性化的医疗策略,无疑是未来医学发展的重要方向。书中还介绍了如何利用代谢组学来监测患者对治疗的反应,并及时调整治疗方案,这对于提高治疗的精准度和效率具有重要意义。这本书让我看到了代谢组学在推动医学从“一人一方”向“一人千方”的转变过程中所扮演的关键角色。它不仅仅是一本教科书,更是一本关于未来医疗模式的愿景书。

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这本书给我带来的最大收获,是它彻底颠覆了我对“生物标记物”的固有认知。《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》以一种极其系统和全面的方式,阐述了代谢组学在发现和验证生物标志物方面的独特优势。书中详细介绍了从高通量代谢组学数据中筛选潜在生物标志物的策略,以及如何利用不同类型的生物样本(如血液、尿液、唾液)来发现针对特定疾病或生理状态的标志物。我特别欣赏书中对于生物标志物验证流程的严谨性描述,它强调了独立验证、临床前研究和临床试验的各个阶段的重要性。这一点对于确保生物标志物的可靠性和临床应用价值至关重要。书中通过大量的案例分析,生动地展示了代谢组学如何帮助科学家们找到早期癌症筛查的标志物、预测药物疗效的标志物,甚至评估环境暴露风险的标志物。这些信息对于医学诊断、药物研发以及公共卫生事业的发展具有极其重要的意义。这本书让我意识到,生物标志物不仅仅是某个数字或数值,而是一个复杂的代谢网络在特定状态下的“签名”。而代谢组学,正是解读这个“签名”最强大的工具。

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这本书的出现,对于我深入理解生命体的复杂性起到了关键性的作用。《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》以其全面性和前瞻性,为我打开了新的研究视野。我尤其关注书中关于代谢组学在药物发现和开发过程中的应用。新药的研发是一个耗时耗资巨大的过程,而代谢组学为这一过程提供了强大的支持。书中详细介绍了如何利用代谢组学来识别新的药物靶点,评估候选药物的疗效和安全性,以及研究药物在体内的代谢途径和作用机制。我特别欣赏书中对“代谢组学驱动的药物发现”的详细论述,它展示了如何通过分析疾病状态下的代谢变化,来寻找能够纠正这些异常代谢的药物分子。此外,书中对药物联用和药物相互作用的代谢组学研究的介绍,也让我看到了在优化药物治疗方案方面的潜力。这本书让我意识到,代谢组学不仅仅是研究生命现象的工具,更是推动新药研发、提高用药安全性和有效性的核心力量。它为我提供了理解药物作用机制和发现新疗法的全新视角。

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《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》这本书,就像一位循循善诱的导师,带领我一步步探索代谢组学的奇妙世界。书中对于不同类型代谢组学研究设计的详细指导,让我受益匪浅。无论是目标性还是非目标性代谢组学研究,书中都提供了详尽的实验设计原则、样本采集注意事项以及潜在的陷阱分析。这对于我将来开展相关的研究工作,无疑是宝贵的实践指南。我特别喜欢书中关于代谢组学数据质量控制的章节,它强调了从样本处理到仪器校准的每一个环节都至关重要,并且提供了具体的解决方案。这一点非常实用,因为很多时候,数据的可靠性直接影响到研究的最终结论。此外,书中对于如何利用代谢组学来研究肠道微生物群与宿主健康之间相互作用的论述,也让我耳目一新。肠道微生物群在人体健康中的作用越来越受到关注,而代谢组学正是研究这一复杂相互作用的有力工具。书中结合大量最新的研究成果,生动地展示了代谢组学如何在揭示肠道微生物的代谢功能、调控宿主代谢以及影响多种疾病方面发挥关键作用。这本书不仅仅是知识的罗列,更是一种思维方式的引导,它教会我如何从海量数据中提取有价值的信息,如何构建合理的科学模型,以及如何以批判性的眼光审视研究结果。

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《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》这本书的阅读过程,是一次知识的密集注入,也是一次思维的深刻启迪。书中对于代谢组学在不同生命阶段(如胚胎发育、衰老)的研究,让我对生命周期的奥秘有了更深的理解。我被书中关于如何利用代谢组学来研究胚胎发育过程中关键代谢事件的阐述所吸引。胚胎发育是一个极其精细和复杂的过程,而代谢活动在其中起着至关重要的作用。通过分析胚胎在不同发育阶段的代谢组学特征,我们可以识别影响发育的关键基因和信号通路,从而为治疗先天性发育异常提供新的思路。同时,书中对衰老过程中代谢变化的探讨,也让我对如何延缓衰老、提高老年生活质量有了更深刻的认识。它让我意识到,衰老并非简单的细胞衰亡,而是复杂的代谢失调过程。书中详细介绍了代谢组学如何帮助我们理解衰老相关的疾病,并寻找延缓衰老的代谢干预策略。这本书让我对接下来的生命科学研究充满了期待,它不仅提供了丰富的知识,更激发了我探索生命更深层次奥秘的热情。

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《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》的阅读体验,可以用“引人入胜”来形容。书中对代谢组学在神经科学领域的应用,给我的触动尤为深刻。我们的大脑是一个极其复杂的器官,而代谢活动是维持其正常功能的基础。书中详细阐述了代谢组学如何帮助我们理解神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)的发病机制,探索精神疾病(如抑郁症、精神分裂症)的代谢特征,以及研究脑损伤和脑卒中的代谢变化。这些内容不仅具有重要的科学价值,更蕴含着改善人类神经系统疾病治疗前景的希望。我特别注意到书中关于“脑代谢组学”的介绍,它展示了如何利用先进的成像技术和分析方法,来实时监测大脑的代谢活动,从而为疾病的早期诊断和治疗提供新的途径。此外,书中对于代谢组学在睡眠科学、运动科学以及老年医学等领域的应用案例的呈现,也让我看到了这项技术在提升人类生活质量方面的巨大潜力。它让我意识到,我们的身体是一个动态的代谢系统,而代谢组学正是解读这个系统秘密的金钥匙。这本书不仅仅是知识的传递,更是对生命奥秘的探索,让我对接下来的研究和学习充满了期待。

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这本书的深度和广度都超出了我的预期。《The Handbook of Metabonomics and Metabolomics》仿佛一本百科全书,将代谢组学领域的核心知识和前沿动态一网打尽。我被书中关于代谢组学在食品科学和营养学领域的应用所深深吸引。食品的营养成分、风味物质、以及加工过程中产生的代谢产物,都可以通过代谢组学技术进行全面分析。这本书详细介绍了如何利用代谢组学来评估食品的质量和安全性,优化食品加工工艺,以及研究不同饮食习惯对人体健康的影响。这些内容不仅对于食品科学家和营养学家来说是宝贵的参考,对于普通消费者理解食物的本质和健康饮食的重要性也大有裨益。我尤其欣赏书中关于个性化营养的探讨,它预示着未来我们将能够根据个体的代谢特征来制定最优化的饮食方案,从而最大程度地促进健康和预防疾病。书中对于代谢组学技术在动物科学和农业领域的应用介绍,也让我看到了这项技术更广阔的应用前景。它能够帮助我们研究家畜的生长发育、疾病防控,以及作物育种和产量提升。这本书让我深刻地认识到,代谢组学不仅仅是一门学科,更是一种解决问题的强大工具,它正在悄然改变着我们对生命科学的认知,并为人类社会的可持续发展贡献着重要的力量。

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