《生物信息学词汇双语通解》共分为三部分，一部分是生物专业词汇，一部分是该词汇的英文释义，最后一部分为词汇的中文释义。这种结构方便读者查阅，即使中文解释不到位，亦可与英文解释对照理解词义。《生物信息学词汇双语通解》还可以作为EMBOSS应用程序的说明文档之用，所有应用程序以斜体字区别表示。
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