建國之後，先後發生瞭三大著名文化冤案 ：文藝上的" 鬍風案" 、哲學上的" 楊獻珍案" 和曆史學上的" 鄧拓案。而楊獻珍的哲學" 罪案" 被稱之為"株連最廣"的冤案。

1962 年 11月，中共中央高級黨校前校長揚獻珍，因公開提齣"閤二而一"新概念，挑戰瞭毛澤東主張"一分為二"哲學觀，立即被視為重大敵情遭到大批判、大迫害。到 1964 年年底，全國各地主要報刊發錶批判文章達500 多篇，而中央黨校內則天天專題批判，日日輪番轟炸。這場運動一直持續瞭8 年之久。受"閤二而一"案株連的僅在中央黨校就有154 人，其中原哲學教研室副主任孫定國被逼跳入黨校人工湖自殺，講師黎明也投井身亡。軍隊有一"五好"戰友，僅因撰文接受"閤二而一"觀點，便被判處死刑。死裏逃生的楊獻珍曾悲憤地說："曆史上曾經有過株連十族的例子，那就是明朝的方孝孺的故事。所謂十族，就是指九族加上他們的學生。而'閤二而一'受株連的卻遠遠超過十族。那些受株連的人中，很多人同我毫無關係，我也根本不認識他們，不過僅僅因為寫過贊成閤二而一的文章，竟也遭到各種各樣的迫害。"他將自己的這段經曆，寫成瞭《我的哲學 " 罪案" 》一書。他在該書" 序" 中寫到：" 從四十年代到1964 年（批' 閤二而一' 時）期間，我的講課稿等，差不多都被收集起來瞭。其中一部分，在批判' 閤二而一' 時，曾被黨校領導鉛印齣來，發給教學人員和學員，作為批鬥的靶子。這些稿子的每一件，都編瞭號碼，標瞭' 罪名' ，立瞭捲宗，封皮上寫的總' 罪名' 是：' 楊獻珍的詭辯和誹謗材料。' 另外一部分，是在監獄中寫的交代' 罪行' 材料。1964 年批判' 閤二而一' 時，《人民日報》第一版曾發錶過一條以《抖楊獻珍的底》為題的消息。我說那個' 底' 並不是見不得人的。現在我自己把我的' 底' 抖齣來，給' 罪案' 提供第一手的資料。"

其實毛澤東迫害楊獻珍早在五十年代末就開始瞭。當時楊獻珍竟膽大妄為，鋒芒畢露地挑戰毛澤東"揮巨手"颳起的" 共産浮誇風" 。對此楊獻珍說過："1959 年是我闖禍的一年。" 即對" 浮誇風" 的揭露和批評。1958 年8 月，中央高級黨校哲學教研室的一些乾部下放到河南鄉下勞動學習。當時黨報吹噓說，這個省平均畝産小麥一韆多斤，居全國第一。小麥，玉米，鋼鐵均放瞭" 衛星" 。 1958 年11 月19 日他給中央黨校新疆班和自然辯證法班講課的時候，以《關於規律的客觀性和主觀能動性作用問題》為題，大膽直言地批判瞭人們在執行總路綫、大躍進和人民公社（當時稱為" 三麵紅旗" ）過程的荒唐做法。當時，河南省平西縣某公社放小麥衛星，" 畝産7320 斤" 。這個公社的黨委書記，還被北京某高級理論刊物的負責人聘請到北京給科學界作報告，後來此篇報告竟在一個科學刊物《自然辯證法研究通訊》上發錶，題為《揭開"7320" 之迷》，作者捏造瞭許多" 根據" 和" 理由" ，把虛構的"7320" 說成是真實的。這位黨委書記到處作報告，鬍吹他們的畝産7320 斤小麥的" 偉大成績" 。1959 年1 月，楊獻珍親自下鄉到這個" 小麥畝産7320 斤" 的公社。但他聽到是：鞦後不久社員就揭不開鍋瞭，隻能把紅薯藤曬乾做糊糊喝。社員普遍營養不足，發生浮腫病，餓死瞭人，衛生部派人調查，確屬事實。而縣委書記在發言稿裏竟然說：" 不虛報，就不能鼓足群眾乾勁；不虛報，就不能促進大躍進的形勢……" 。有一個地方，什麼設備都沒有，竟然一天一夜煉齣130 萬噸鋼。某縣一個十四歲的女孩講哲學，講稿到處發。據說聽眾有250 萬人，科學院哲學所還印瞭她的兩本講稿。楊獻珍對此氣憤地說："這到底是哲學的興旺，還是哲學的貧睏？我們哲學工作者，在' 共産風' 、' 浮誇風' 、' 瞎指揮風' 颳來的時候，我們連這麼一陣風都攔不住。這些' 風' ，把我們黨多年來培養的實事求是的傳統作風衝垮瞭，這該是多麼大的損失啊！" 他在1959 年6 月接見河南省委黨校、撫順市委黨校參觀組時應邀講話提及這件事情。他說，辦黨校應當多給乾部們講些唯物主義、實事求是的道理。他即席談瞭在河南看到、聽到的一些弄虛作假的事例，想用此引以為戒，這就是那篇著名的《堅持實事求是的作風，狠狠批判唯心主義》的講話。他在該講話中大批毛澤東倡導的共産 '浮誇風 '"膽量等於産量，思想等於行動 " 。他質問：這到底是唯物主義還是唯心主義？弄虛作假總不能算做唯物主義吧！他大聲疾呼：" 有些人是有心弄虛作假，為瞭保住頭上的烏紗帽，說謊話，放假衛星，欺騙黨和人民。"幾天後，他在全國文聯學習會上又藉題發揮瞭這個看法。

楊獻珍的這些針對性極強的講話，被一些告密者整理打印齣來，送到瞭毛澤東的文化打手康生手裏。康生說，楊獻珍的一些言論" 是嚮社會主義、嚮毛主席開火，是右傾機會主義分子，他還說："楊獻珍是一文，彭德懷是一武。指揮打仗，他不能同彭德懷相比，但舞文弄墨，彭德懷沒法同他比。他們山上山下互相配閤，一起嚮黨、嚮毛主席發起進攻。" 此後康生又拿到瞭楊獻珍在中宣部政治經濟學講習班上的一次談話《離開唯物主義是危險的》記錄稿如獲至寶。他認為楊獻珍的幾次講話，對大躍進的揭露批判，比彭德懷在廬山會議上的意見書露骨得多，說" 楊獻珍比彭德懷還厲害十倍百倍，他不僅是右傾機會主義分子，而且是個漏網右派。彭德懷的信，並未發錶。而楊獻珍的言論，到處傳播，必須認真對待。"1959 年11 月22 日，毛澤東指令康生、陳伯達找楊獻珍談話，責令他進行檢查。12 月9 日，這位黨內敢於挑戰毛澤東權威的知識分子楊獻珍被解除中央黨校校長職務。

1962 年 1月，楊獻珍和黨校的一些教師到西安參觀。在閱覽《藍田縣誌》時，楊獻珍得知宋朝呂公臨著有《老子注》一書，闡述瞭老子 " 閤有無謂之元" 的思想。他為此受到啓發。後來他讀明朝方以智的《東西均》，發現有" 閤二而一" 的提法，進一步引發瞭他對於辯證法的思考。毛澤東一生習慣瞭" 對立統一" 、" 一分為二" 的思維方式，特彆強調矛盾的普遍性、對抗性，將社會的一切事物都分為對立的兩極。這種極端的"一分為二"觀點，一切都從對立的立場看待統一，視一切事物為相互對立的兩方麵"不是黑就是白"，沒有摺衷，沒有選擇，沒有第三條道路。隻講鬥爭性，不講妥協性；隻講絕對性，不講相對性；隻講矛盾雙方的相互排斥性，不講矛盾雙方的相互融閤性。大批"調閤論"，反對"摺衷主義"，將公民劃分為紅黑兩類，即把 " 人民" 和" 敵人" 作為政治製度的基礎，" 凡是敵人反對的我們就擁護，凡是敵人擁護的我們就反對" ，強調" 不是東風壓倒西風，就是西風壓倒東風" ，沒有第三條道路可走。毛澤東認為即使在社會主義社會，也存在階級鬥爭，社會的發展階段始終存在著社會矛盾和社會鬥爭，隻有進行"不斷革命"，纔能使社會發展。他認為鬥爭是絕對的，矛盾的解決是暫時的，融衝論是"形而上學"。而這時的楊獻珍則認為，不應當隻講鬥爭性，不講同一性；不應當隻講 "一分為二 "，不講 "閤二而一 "， "一分為二 "和 "閤二而一 "都是對對立統一規律的不同錶述。這是楊獻珍對毛澤東絕對化 " 一分為二" 哲學觀的挑戰。1963 年2 月，楊獻珍在給中央黨校學員講《唯物主義引言》時，第一次提齣" 閤二而一" 的概念。他說：" 事物既是' 一分為二' 的，也是' 閤二而一' 的。"1964 年4 月3日 ，他在給高級黨校新疆班學員講課時，介紹瞭古代學者關於 "一分為二 "和 "閤二而一 "的論述。 "當時在新疆班擔任輔導工作的哲學教師艾恒武聽後很受啓發，便寫瞭一篇《 " 一分為二" 與" 閤二而一" 》的文章，與另一位哲學教師林青山聯閤署名。1964 年5 月29 日，《光明日報》刊登瞭《 "一分為二 "與 "閤二而一 "》文章。一個星期之後，毛澤東開始指示反駁，有人便又刊登瞭《 " 閤二而一" 不是辯證法》文章。毛澤東為瞭" 釣魚" ， 公開" 揭蓋子" ，便再次炮製瞭" 學術爭論" 的陽謀，果然有很多熱心辯證法的愛好者" 上鈎" 瞭。這時，毛澤東認為可以收網瞭，便指示康生代錶中共中央，嚮《人民日報》、《光明日報》等下達指令：在參加關於" 一分為二" 和" 閤二而一" 的討論中，凡持" 閤二而一" 論者，其姓名、地址和單位，一律登記入冊，以便" 通過各省市轉送原單位進行批判" 。這場批判不僅直接指嚮楊獻珍，而且將原中央高級黨校副校長、校黨委第二書記侯維煜，作為" 楊侯反黨集團" 的頭目重點迫害。 " 文革" 開始後，楊獻珍被關押在私設的五十二號樓監時監房裏，受盡淩辱。1967 年9 月23 日晚 10時，中央下令將楊逮捕，隨即送往北京郊區一所監獄裏，受到非法的審訊。 1975 年5 月19 日，在結束 8年的監獄生活後，楊獻珍被開除黨籍，遷齣京城，流放到陝西省潼關，直到 1978 年12 月纔自西安迴到北京。

中共黨內敢於如此與毛澤東針鋒相對的人並不多見，楊獻珍堪稱其中一個。他在迴憶一生的政治生涯中寫到：" 我的生命過程中所遇到的政治風浪，最險惡的還不是十年浩劫，而是1964 年對' 閤二而一' 的批判。那時' 閤二而一' 簡直是犯瞭十惡不赦的大罪，中央和地方所有的大小報紙，鋪天蓋地一哄而起，舉行全國性大討伐。" 可貴的是，這位敢於在文化專製時代堅持己見的黨內知識分子，被平反後擔任中顧委委員期間，還特彆反思自己說："在1957 年' 反右' 運動時，仍然錶現瞭軟弱性。黨校' 反右' 運動沒有抗住擴大化，我是有責任的。藉此機會，我嚮在這些運動中受到錯誤處理的同誌和他們的傢屬，錶示歉意。……" 然而，他的反思還不到位，反右不是"擴大化"，本質上是對中國知識分子的犯罪。如果他能活到今天，也許會有這樣的覺悟。