DNA和蛋白質序列數據分析工具 在線電子書 圖書標籤: 生物信息學 生物 Bioinformatics 軟件應用指導 蛋白質組學 進化分析 蛋白質 2009
發表於2024-11-05
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《DNA和蛋白質序列數據分析工具》全書共分9章。第1章,闡述序列比較的核心方法,即運用BLAST和ClustalX等工具做序列比對。第2章,重點介紹核苷酸序列分析工具,主要包括:基因可讀框的識彆,CpG島、轉錄終止信號和啓動子區域的預測分析,用mRNA序列預測基因等。第3章,介紹電子剋隆的概念和具體操作方法。第4章,用MEGA4做分子進化遺傳分析,繪製係統進化樹,為研究基因進化打好基礎。第5章,對蛋白質基本理化性質、二級結構、結構域和三維空間結構、預測目標蛋白的生物學功能等工具做逐一介紹。第6章,通過Gene Ontology和KEGG兩個數據庫,挖掘基因和蛋白質的功能並做代謝途徑分析。第7章,利用X!Tandem軟件鑒定蛋白質的串聯質譜數據,進而預測蛋白質;同時藉助TPP軟件包進行蛋白質組學數據統計學分析,優化檢索結果。第8章,使用TqVl4軟件實現芯片的數據采集和標準化處理,並藉助GenMAPP軟件挖掘芯片數據的生物學意義。第9章,通過Cytoscape軟件演示,介紹係統生物學分析概況,展示蛋白質-蛋白質相互作用,應用插件做網絡結構分析。書後附有專業詞中英文對照。
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