Ubiquitin and Protein Degradation

Ubiquitin and Protein Degradation pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Deshaies, Raymond 编
出品人:
页数:952
译者:
出版时间:2005-9
价格:$ 224.87
装帧:
isbn号码:9780121828042
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质降解
  • 泛素
  • 泛素化
  • 蛋白质酶体
  • 分子生物学
  • 细胞生物学
  • 生物化学
  • 信号转导
  • 疾病机制
  • 蛋白质稳态
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具体描述

"Ubiquitin and Protein Degradation, Part B" will cover chemical biology, ubiquitin derivatives and ubiquitin-like proteins, deubiquitinating enzymes, proteomics as well as techniques to monitor protein degradation. The chapters are highly methodological and focus on application of techniques. It is the second part of the "Ubiquitin and Protein Degration" series. Topics include: E1 Enzymes, E2 Enzymes, E3 Enzymes, Proteasomes, and Isopeptidases.

细胞信号转导的精微调控:聚焦磷酸化与去磷酸化在生命活动中的核心角色 图书名称:细胞信号转导的精微调控:聚焦磷酸化与去磷酸化在生命活动中的核心角色 ISBN: 待定 出版社: 科学前沿出版社 装帧: 精装/平装 页数: 约850页 --- 内容简介 本书深入探讨了细胞信号转导领域最基本也最关键的分子机制——蛋白质磷酸化与去磷酸化(统称为磷酸化修饰)在生命活动的各个层面所扮演的中心角色。在当今生命科学的研究前沿,磷酸化已不再仅仅被视为一个简单的“开关”,而是被公认为细胞信息处理、记忆、代谢调控乃至疾病发生发展过程中的核心信息载体和精密调控元件。 本书汇集了当前最前沿的研究成果,系统性地梳理了激酶(Kinases)和磷酸酶(Phosphatases)两大类酶家族的结构、功能、底物特异性以及它们如何协同工作,构建出复杂而精细的信号网络。我们致力于为生物学、生物化学、分子生物学、药理学以及生物信息学等领域的科研人员、研究生和资深本科生提供一本全面、深入且具有高度实践指导意义的参考著作。 第一部分:磷酸化修饰的分子基础与生化原理 (Foundational Principles) 本部分首先奠定了理解磷酸化调控所需的基础知识。 第一章:蛋白质磷酸化的化学与酶学基础 本章详细阐述了丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)残基上磷酸基团的化学反应机制,包括ATP的供体作用、磷酸键的能量状态及其稳定性。随后,我们对激酶的催化结构域进行了详尽的分类介绍,包括丝/苏氨酸激酶(如AGC、CMGC、CaMK家族)和酪氨酸激酶(RTKs和非受体酪氨酸激酶),强调了其底物识别的特异性密码。 第二章:磷酸酶的结构、分类与反向调控 与激酶的“开启”功能相对应,磷酸酶负责“关闭”或“重置”信号。本章聚焦于磷酸酶的结构生物学,特别是对丝/苏氨酸磷酸酶(如PP1、PP2A、PP5)和酪氨酸磷酸酶(如PTPs、STEP)的结构域进行解析。着重探讨了磷酸酶如何通过调节亚基的组合来获得对特定底物的高亲和力,以及它们如何被信号通路本身所抑制或激活,形成精密的负反馈或前馈回路。 第三章:磷酸化修饰组学与位点识别 随着质谱技术的飞速发展,大规模鉴定磷酸化位点成为可能。本章系统回顾了从体外到体内(in vivo)磷酸化蛋白质组学研究的技术路线,包括富集策略(如TiO2、IMAC)、肽段纯化和高分辨率质谱分析。更重要的是,我们详细介绍了利用生物信息学方法预测新的磷酸化位点和识别激酶-底物对的算法模型,为实验设计提供理论支持。 第二部分:信号网络中的磷酸化整合 (Integration in Signaling Networks) 磷酸化修饰的真正威力在于它们如何构建起相互交织的信号网络,实现对细胞环境变化的快速响应。 第四章:受体酪氨酸激酶(RTKs)与经典通路 本章聚焦于细胞表面受体酪氨酸激酶(RTKs)在生长因子、细胞因子和激素信号传导中的核心作用。详细分析了EGFR、Insulin Receptor、VEGFR等关键RTKs的激活机制、自身磷酸化(Autophosphorylation)的信号起始作用,以及招募下游信号分子(如Grb2、PI3K)的SH2/PTB结构域结合事件。重点讨论了经典的MAPK/ERK通路和PI3K/AKT/mTOR通路如何通过多层级的磷酸化传递信号,调控细胞增殖与生存。 第五章:G蛋白偶联受体(GPCRs)与跨膜信号的放大 GPCRs是最大的受体家族,其信号转导高度依赖磷酸化。本章详细描述了GPCRs被激活后G蛋白的解离、第二信使(cAMP, Ca2+)的产生,以及下游的PKA/PKC/PKG家族激酶如何将信号放大并延伸至核内。此外,我们深入探讨了GPCR激酶(GRKs)在受体脱敏(Desensitization)中的关键作用,这是信号转导中一个重要的负反馈机制。 第六章:细胞骨架与粘附的动态调控 细胞的形态变化、运动和细胞间连接的建立与解体,无不依赖于细胞骨架蛋白的快速修饰。本章探讨了肌球蛋白轻链激酶(MLCK)、Rho家族GTPases(如RhoA, Rac1, Cdc42)激活的激酶(如ROCK)如何通过磷酸化肌动蛋白和微管相关蛋白,实现细胞迁移和形态可塑性。这部分内容与细胞生物学和发育生物学紧密结合。 第三部分:磷酸化在生理与病理状态下的调控 (Physiology and Pathology) 本部分将理论知识应用于具体的生命过程和疾病状态中。 第七章:免疫应答与炎症反应中的磷酸化开关 免疫系统的激活是一系列快速、精确的磷酸化事件序列。本章重点分析了T细胞受体(TCR)和B细胞受体(BCR)信号通路,特别是Lck、ZAP-70等关键激酶的激活和信号集成。此外,NF-$kappa$B信号通路中I$kappa$B激酶复合体(IKK)对I$kappa$B的磷酸化,如何实现转录因子入核,是炎症反应的核心机制。 第八章:代谢稳态的磷酸化调控:胰岛素与能量感应 能量代谢,如糖酵解、糖异生和脂肪酸氧化,是体内最受磷酸化控制的生化过程。本章详细阐述了AMPK(能量感受器)和AKT(营养状态感受器)如何通过磷酸化关键代谢酶(如糖原合酶、HMG-CoA还原酶)来协调细胞的能量摄取和储存。胰岛素信号通路中IRS蛋白的复杂磷酸化模式及其对葡萄糖代谢的影响,将作为核心案例进行剖析。 第九章:细胞周期调控与DNA损伤修复 细胞周期的精确推进依赖于周期蛋白依赖性激酶(CDKs)的精确激活和抑制。本章详述了CDK-周期蛋白复合物如何通过磷酸化靶点(如Rb蛋白、Cdc25磷酸酶)来驱动细胞从一个阶段进入下一个阶段。同时,我们还将磷酸化在DNA损伤反应(DDR)中的作用独立成章,解析ATM/ATR/Chk激酶如何快速响应双链断裂,通过磷酸化修饰激活检查点和修复机制。 第十章:磷酸化失调与重大疾病 本章聚焦于磷酸化调控失常在人类疾病中的体现。重点分析了癌症中激酶的持续激活(如BCR-ABL激酶的融合)、信号通路(如Ras/Raf/MEK/ERK)的过度活跃如何驱动肿瘤的生长和转移。同时,对神经退行性疾病(如阿尔茨海默病中Tau蛋白的过度磷酸化)和糖尿病中胰岛素受体信号的缺陷,进行了深入的分子病理学探讨。 第四部分:药物开发与前沿技术 (Therapeutic Avenues and Future Directions) 第十一章:激酶与磷酸酶抑制剂的药物设计策略 本章将理论与转化医学相结合,系统回顾了目前已上市的或处于临床试验阶段的激酶抑制剂(Kinase Inhibitors)的分子结构特点,包括ATP竞争性抑制剂和变构抑制剂。同时,讨论了磷酸酶(特别是作为“难成药靶点”的磷酸酶)的激活剂或抑制剂的设计挑战与最新进展。 第十二章:光遗传学与化学遗传学在磷酸化研究中的应用 为克服传统信号转导研究中时空分辨率的限制,本章介绍了新兴的“活体”研究工具。详细阐述了如何利用光敏结构域(如LOV结构域)实现对特定激酶或磷酸酶的瞬时、光控激活或失活,以及使用化学诱导二聚化系统(CID)来精准地重建或阻断体内信号传导,以期在时间和空间上精准解析磷酸化事件的生理学意义。 --- 本书特色: 深度与广度兼具: 内容覆盖基础生化原理到复杂的系统生物学应用。 视觉化呈现: 包含大量高质量的、原创绘制的信号通路图谱和结构模型。 面向未来: 尤其关注磷酸化组学技术和新型分子工具的应用。 本书不仅是科研工作者的案头工具书,更是激发下一代生命科学家对细胞“信息语言”深入理解的催化剂。通过对磷酸化这一基本修饰的全面解析,读者将能更好地把握生命体如何应对复杂多变的环境挑战。

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这本书在章节组织上的逻辑性,体现了作者极高的学术素养和教学经验。它采取了一种“自下而上,再到宏观系统”的构建方式,从最基本的化学键和氨基酸残基的相互作用开始,逐步搭建起复杂的分子机器,最终上升到对整个细胞周期调控网络的阐释。这种递进式的结构安排,使得跨专业背景的读者也能相对顺畅地跟上节奏。比如,对于那些对生物物理学不甚熟悉的读者,作者在引入热力学和动力学概念时,总是先用一个简单的生物学例子来做铺垫,而不是直接抛出复杂的公式,这种“情景引入”的方式,极大地降低了学习的畏难情绪。而且,书中对实验方法的描述也十分到位,它没有停留在简单介绍“我们做了什么实验”,而是深入探讨了“为什么选择这种方法,以及这种方法的局限性在哪里”,这种对方法论的深刻反思,对于培养严谨的科学精神至关重要。

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我必须指出,这本书在某些方面确实展现出一种近乎“百科全书式”的详尽,但同时也带来了一个挑战,那就是检索效率的问题。虽然总体的章节结构清晰,但在查找某个特定的小分子相互作用的具体细节时,由于内容过于密集,有时候需要花费比预期更多的时间在索引和目录上来回翻找。不过,这或许也是详尽的代价吧,毕竟,它试图在一个相对有限的篇幅内,囊括如此广阔的研究领域。另外,我对书中关于新兴技术应用的讨论非常感兴趣,它没有固步自封于已有的成熟技术,而是大胆地预测和讨论了未来几年内可能会突破的关键领域,比如某些先进的活细胞成像技术如何应用于验证书中所述的静态模型,这为我们未来的研究方向提供了非常及时的灵感。总的来说,它更像是一部需要长期置于案头,随时翻阅的工具书兼理论指南,而非一次性的快速阅读材料。

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这本书的装帧设计真是让人眼前一亮,封面那深邃的蓝色调,配上简洁的白色字体,散发着一种专业而又沉稳的气息。刚拿到手的时候,我就被它厚实的质感所吸引,翻开扉页,油墨的清香混合着纸张特有的微涩感,让人立刻进入了一种专注阅读的状态。虽然我主要关注的是分子生物学中关于信号转导的部分,这本书的排版却出乎意料地友好。图表的清晰度和复杂性掌握得恰到好处,那些复杂的分子结构图,即使用肉眼去看,细节也毫不出错,这对于需要在实验室与理论知识之间进行频繁切换的研究人员来说,是极大的便利。作者在章节之间的过渡处理得非常流畅,没有那种生硬的拼接感,仿佛在讲述一个层层递进的宏大故事,让人读起来丝毫不觉得枯燥,反而有一种强烈的探索欲被激发出来的感觉。我尤其欣赏它在关键概念引入时所采用的类比方式,能迅速将晦涩的生物化学过程转化为更易于理解的图像,这对于快速掌握新领域的核心机制非常有帮助。总而言之,这本书在视觉和触觉上的体验,为后续深入的学习打下了非常积极的心理基础。

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从文献回顾的角度来看,这本书的参考价值简直无可估量,它不像某些教材那样,只引用最新的、最热门的研究,而是以一种历史的眼光,梳理了某一领域从萌芽到成熟的全过程。作者在每一部分末尾的“延伸阅读”建议,都极其精准地指出了那些奠基性的、里程碑式的论文,这对于想要深入追踪某个研究方向的学者来说,节省了无数在数据库中筛选噪音信息的时间。我发现,通过追溯这些经典的引文,我能更好地理解当前研究热点背后的逻辑和限制。更难能可贵的是,作者在总结不同学派观点冲突时,采取了一种非常中立且批判性的态度,既肯定了A学派在实验设计上的精妙,也指出了B学派理论模型上的局限性,这种平衡的叙事方式,极大地锻炼了读者独立思考和判断的能力,避免了盲目崇拜权威的倾向。

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这本书的内容深度,坦白说,远远超出了我原先的预期,尤其是在涉及那些高度专业化且交叉性极强的领域时,表现得尤为突出。我本来以为它会更偏向于基础介绍,但很快就发现我错了,作者对每一个关键步骤的论述都深入到了晶体结构和动力学模型的层面。例如,在讨论某个酶活性的调控机制时,书中不仅列举了已知的调控因子,还详细剖析了它们作用位点的空间几何关系,这对于我们进行结构生物学研究来说,简直就是一份宝藏。我花了好大力气才啃完其中关于蛋白质折叠错误的清除机制那一章,它以一种近乎哲学的深度探讨了细胞内质量控制系统的精妙平衡,观点独到且逻辑严密,让我对细胞维持稳态的能力有了全新的认识。这本书不是那种可以快速翻阅的入门读物,它需要你带着笔记和咖啡,沉下心来,反复咀嚼每一个论断,因为它所提供的知识密度实在太高了,任何一个细节的缺失都可能导致对后续章节理解的偏差。

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