Biomolecular EPR Spectroscopy

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出版者:
作者:Hagen, Wilfred Raymond
出品人:
页数:248
译者:
出版时间:
价格:1308.00元
装帧:
isbn号码:9781420059571
丛书系列:
图书标签:
  • EPR spectroscopy
  • Biomolecules
  • Electron paramagnetic resonance
  • Spectroscopy
  • Biophysics
  • Chemistry
  • Molecular biology
  • Protein structure
  • Free radicals
  • Oxidation-reduction reaction
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具体描述

深入探索生命科学的前沿:核磁共振波谱技术在生物分子结构解析中的应用 书籍名称: 《核磁共振波谱学在生物分子结构解析中的应用前沿》 书籍简介: 本书旨在为生物物理学、结构生物学、生物化学以及相关交叉学科的研究人员和高年级学生提供一本全面、深入且聚焦于尖端技术的参考指南。本书的重点在于阐述核磁共振(NMR)波谱学,尤其是高场和超高场NMR技术,如何被应用于解析复杂生物大分子——包括蛋白质、核酸、膜蛋白以及它们在溶液或固态中的动态机制和相互作用界面。 我们深知,在生命科学领域,理解分子在生理相关环境下的结构和动态行为是解锁生命过程奥秘的关键。本书将传统NMR理论与现代实验方法的创新完美结合,构建了一个从基础原理到最前沿应用的完整知识体系。 第一部分:理论基石与仪器优化 本部分将系统回顾NMR波谱学的基本物理原理,但重点将放在如何将这些原理应用于复杂的生物体系。 第一章:NMR物理基础的生物学视角 我们将超越基础的拉莫尔进动理论,深入探讨生物分子特有的弛豫机制($T_1, T_2$ 弛豫),以及它们如何影响光谱的线宽和灵敏度。重点讨论核的性质(如$^{1} ext{H}, ^{13} ext{C}, ^{15} ext{N}, ^{31} ext{P}$)在研究不同分子结构特征中的相对优势和挑战。特别关注化学位移的各项异性对结构解析的贡献。 第二章:高场NMR仪器与样品制备的工程学挑战 现代生物分子NMR依赖于极高磁场强度(如800 MHz以上)。本章将详细介绍超导磁体技术、射频线圈(特别是CryoProbes)的最新发展及其如何显著提高信噪比。样品制备方面,我们将聚焦于重水标记、同位素选择性标记技术(如$^{13} ext{C}$-选择性标记),以及如何有效地使大分子(如超过40 kDa的蛋白质)保持稳定和高可溶性,这是获得高质量光谱的前提。 第二部分:从一维到多维:高分辨率解析技术 本部分是本书的核心,详细阐述了构建三维乃至四维结构所需的多维NMR实验序列。 第三章:一维谱分析与基础参数提取 尽管多维谱是主流,但对一维$^{1} ext{H}$谱和去耦后的$^{13} ext{C}/ ext{}^{15} ext{N}$谱的精细分析仍然至关重要。本章探讨如何利用化学位移解析(Chemical Shift Index, CSI)初步判断二级结构,并介绍线宽分析在评估分子聚集状态和动态性方面的应用。 第四章:基于交叉峰的距离和角度约束 这是结构解析的基石。我们将深入剖析各种二维和三维实验,包括: COSY/TOCSY/NOESY 家族: 详细介绍如何通过梯度场辅助的脉冲序列,获得高质量的COSY和TOCSY谱,用于确定连接性。重点分析NOESY谱中交叉峰的强度与核间距之间的关系($R^{-6}$依赖性),以及如何区分短程、中程和长程NOE信号。 基于偏振的实验(TROSY/CCR): 针对大分子克服快速横向弛豫的挑战,本书将详细介绍TROSY(Transverse Relaxation Optimized SpectroscopY)技术在提高信号强度和解析度方面的革命性作用,尤其适用于膜蛋白和核糖体等巨型复合物。 第五章:精确确定空间定位:距离与二面角的约束 本章侧重于如何从实验数据中精确提取结构信息: 远程NOE的解析: 探讨如何识别和解读长距离的NOE信号,这对于确定蛋白质的整体折叠拓扑结构至关重要。 结构相关参数(RDCs): 详细介绍所取向度约束(Residual Dipolar Couplings, RDCs)的采集方法,包括使用胶体或致密液晶介质。解释RDCs如何提供相对于分子平均取向的精确角度信息,从而极大地限制结构搜索空间。 第三部分:分子动态学与功能研究 结构是静态的,但生物功能是动态的。本部分关注NMR如何揭示分子在不同时间尺度上的运动。 第六章:时间尺度跨越:从皮秒到秒的分子运动分析 生物大分子的功能(如酶催化、信号转导)依赖于其构象变化的灵活度。本书系统介绍如何利用弛豫测量($T_1, T_2, ^{15} ext{N}$ HSQC 弛豫)来量化皮秒到纳秒尺度的局部运动($ ext{S}^2$ 参数)。更进一步,我们将讨论如何通过$T_1 ho$测量和交叉弛豫实验(如CPMG)来探测微秒到毫秒尺度的“功能相关”的构象转换,这通常是活性位点或变构调控的关键。 第七章:固态NMR:膜蛋白与细胞器研究 对于无法结晶或在溶液中不稳定的大分子(如膜蛋白、纤维蛋白),固态NMR(ssNMR)是不可替代的工具。本章着重介绍: 魔角旋转(MAS): 讲解其原理及如何消除各向异性带来的线宽展宽。 相分隔与动力学平均: 讨论如何使用高阶转子加速(如50 kHz MAS)和特定的多维脉冲序列(如RFDR, DARR)来重建膜蛋白的关键结构单元,以及如何通过温度和转速扫描来研究蛋白质的动力学过程。 第四部分:特定生物体系的应用前沿 本部分将实际案例与方法论相结合,展示NMR在解决复杂生物学问题中的前沿应用。 第八章:蛋白质-配体相互作用与药物发现 NMR在小分子药物筛选和机制研究中具有无可比拟的优势。本书详述如何利用: STD(Saturation Transfer Difference) 和 HSQC/DHMQC 筛选技术快速识别结合位点。 定量NOE/ROE 确定配体与蛋白质的相对取向。 $K_d$和结合速率 的精确测定,为基于结构的药物设计提供定量依据。 第九章:核酸结构与RNA机器 随着对RNA功能理解的深化,解析复杂的非编码RNA(如tRNA、rRNA、mRNA发夹结构)变得尤为重要。本章探讨了针对核酸体系的特有实验,例如如何解析碱基堆积和糖环构象,以及如何利用$^{31} ext{P}$ NMR来监测磷酸骨架的化学修饰和酶促反应。 结论与展望: 本书最后将总结当前NMR技术面临的挑战(如对高浓度样品的依赖性、大分子分辨率限制)以及未来方向,包括人工智能辅助的结构解析、新的超低温检测技术,以及与冷冻电镜(Cryo-EM)数据整合的策略。 本书为读者提供了一个全面、精炼且高度实用的工具箱,使他们能够自信地设计实验、解析复杂光谱,并将最尖端的NMR波谱学技术应用于推进生命科学的研究。

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