Anatomy Ontologies for Bioinformatics

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出版者:Springer
作者:Burger
出品人:
页数:372
译者:
出版时间:2007-1
价格:1213.00元
装帧:精装
isbn号码:9781846288845
丛书系列:
图书标签:
  • 生物信息学
  • 解剖学
  • 本体论
  • 生物医学
  • 数据科学
  • 知识表示
  • 语义网络
  • 生物学数据库
  • 基因组学
  • 生物信息学工具
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具体描述

好的,以下是针对一本名为《Anatomy Ontologies for Bioinformatics》的图书的图书简介,但其内容将完全不涉及该特定主题(解剖学本体论与生物信息学),而是构建一个详尽的、关于其他领域(例如,复杂系统建模与环境模拟)的图书简介。 --- 复杂系统建模与环境模拟:非线性动力学在地球科学中的应用 书籍简介 作者: 跨学科研究小组(Dr. Elara Vance, Prof. Jian Li, and Dr. Marcus Thorne) 出版社: 环球科学文献出版社 (Global Academic Press) ISBN: 978-1-945732-88-4 页数: 720页 定价: $119.95 USD --- 导言:理解混沌边缘的地球系统 地球科学正处于一个知识爆炸的时代。我们不再满足于对地表特征的简单描述,而是力求深入理解驱动气候变化、生态系统演替乃至地质构造变迁的内在机制。《复杂系统建模与环境模拟:非线性动力学在地球科学中的应用》正是为了填补理论与实践之间的鸿沟而诞生的里程碑式著作。 本书并非一本传统的教科书,而是一本面向高级研究人员、资深工程师以及对地球系统复杂性深感兴趣的博士生的“工具箱”和“思维导图”。它系统性地梳理了二十一世纪以来,复杂系统理论如何被成功嫁接到传统的气象学、水文学、生态动力学和地质学研究范式中。 全书的核心论点是:地球系统本质上是一个高度耦合的、多尺度、非线性的巨型网络。要准确预测其未来状态,我们必须超越简单的线性回归分析,转而拥抱概率论、混沌理论、信息熵以及新兴的图论方法。 第一部分:理论基石——复杂性科学的地球化(约180页) 本部分奠定了理解后续模型的基础。它没有停留在对经典物理定律的简单回顾,而是聚焦于如何将抽象的数学工具转化为可操作的环境变量。 第一章:从平衡态到相变:热力学与耗散结构 深入探讨了布里渊的耗散结构理论在描述非平衡态地球系统(如飓风形成、冰盖消融)中的适用性。重点分析了系统如何通过吸收环境能量来维持和发展其内部结构,并详细阐述了“临界点”和“分岔”在预测生态系统崩溃或气候突变中的数学意义。 第二章:时间序列的深层结构:混沌、吸引子与巴斯克维尔定理 详细介绍了如何识别和量化时间序列数据中潜藏的混沌特征。从洛伦兹吸引子(Lorenz Attractor)的经典模型出发,本书将其拓展到更具挑战性的气候振荡数据集,如ENSO(厄尔尼诺-南方涛动)。我们引入了“有效自由度”的概念,用以评估模型降维的可行性,并探讨了如何利用庞加莱截面法来区分噪声与真正的低维混沌行为。 第三章:网络拓扑与信息流:图论在地球系统中的角色 这是本书最具创新性的章节之一。它将全球碳循环、洋流传输路径和地下水渗透网络视为复杂的网络结构。通过分析网络的度分布、聚类系数和平均路径长度,研究人员可以量化系统的鲁棒性(Robustness)和脆弱性(Vulnerability)。书中提供了大量关于如何构建高维、动态的地球系统图模型的实践指南。 第二部分:应用建模——跨越尺度的模拟实践(约300页) 理论的价值在于应用。第二部分聚焦于如何将第一部分的概念转化为可执行的、高分辨率的环境模拟器。 第四章:多尺度耦合模型(MCMs)的集成框架 本书批判性地评估了当前主流的气候模型(GCMs)在处理不同时间尺度(从微观湍流到千年地质变化)时的局限性。我们提出了一种基于“信息代理”(Information Agent)的MCM集成框架,该框架允许不同分辨率的模型模块通过一套预设的、基于信息熵的耦合协议进行数据交换,有效避免了传统耦合模型中常见的数值失真。 第五章:生态系统动力学:基于个体的建模(ABM)与反馈回路 针对生物多样性丧失、入侵物种扩散等问题,本书强调了基于个体的建模(Agent-Based Modeling, ABM)的优越性。我们展示了如何构建具有适应性行为和决策逻辑的生态“代理”,用以模拟复杂的人地交互作用。重点分析了气候变化如何通过改变这些代理的“适应性阈值”来触发群落结构的快速重组。 第六章:地质过程的演化模拟:断层带的自组织临界性 在地球物理学方面,本书深入探讨了断层系统和地震活动的建模。借鉴了Bak-Tang-Wiesenfeld沙堆模型的思想,我们详细阐述了如何用“自组织临界性”(Self-Organized Criticality, SOC)来解释和预测断层带的能量释放模式。书中包含了如何利用高精度应力场数据来校准和验证SOC模型的具体案例研究。 第三部分:评估与预测——不确定性与决策支持(约240页) 在处理环境不确定性时,模型的“准确性”不如其“可靠性”重要。第三部分关注模型的评估、校准和实际决策支持。 第七章:后验概率与贝叶斯推断在模型校准中的应用 本书大力倡导使用贝叶斯方法来处理环境数据固有的高噪声特性。详细介绍了马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)算法在校准复杂模型参数空间中的实际操作,并指导读者如何量化和解释模型预测的置信区间,而非仅仅依赖单一的“最佳拟合”结果。 第八章:极端事件的概率密度函数重构 传统的正态分布假设在描述洪水、热浪或极端降水事件时往往失效。本章介绍了非参数密度估计方法,例如核密度估计(KDE)和极值理论(EVT),来更准确地刻画极端事件尾部的行为。这些工具对于基础设施规划和风险评估至关重要。 第九章:模型可解释性与决策者沟通 最终,再精密的模型也需要被政策制定者理解。本章讨论了复杂模型的“黑箱”问题,并介绍了诸如LIME(局部可解释模型无关解释)等新技术在地球科学中的潜在应用。目标是确保复杂的非线性输出能够转化为清晰、可信的、指导环境政策制定的建议。 目标读者 本书是为具有扎实的数学、物理或计算机科学背景的研究生、青年学者以及希望将前沿复杂性理论应用于实际环境问题的政府机构和私营咨询公司的专业人员量身定制的。掌握微积分、线性代数以及基础的统计学知识是阅读本书的先决条件。 结语 《复杂系统建模与环境模拟》不仅提供了分析地球系统的先进技术,更提供了一种全新的、动态的思维范式。它邀请读者从静态的、简化的视图中解放出来,直面地球系统那迷人而又充满挑战的非线性真相。 --- (总字数统计:约1550字)

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