Mass Spectrometry Analysis for Protein-Protein Interactions and Dynamics

Mass Spectrometry Analysis for Protein-Protein Interactions and Dynamics pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Chance, M.
出品人:
页数:288
译者:
出版时间:2008-9
价格:759.00元
装帧:
isbn号码:9780470258866
丛书系列:
图书标签:
  • 质谱
  • 蛋白质相互作用
  • 蛋白质动力学
  • 生物化学
  • 分子生物学
  • 蛋白质组学
  • 分析化学
  • 生物物理学
  • 实验技术
  • 蛋白质分析
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具体描述

Presents a wide variety of mass spectrometry methods used to explore structural mechanisms, protein dynamics and interactions between proteins. Preliminary chapters cover mass spectrometry methods for examining proteins and are then followed by chapters devoted to presenting very practical, how-to methods in a detailed way. Includes footprinting and plistex specifically, setting this book apart from the competition.

新锐视角:分子结构、功能与生命过程的深度探索 本书聚焦于现代生物化学与分析化学的前沿交汇点,旨在为研究人员、高级学生以及对生命科学基础原理感兴趣的专业人士提供一个系统而深入的知识框架。我们不关注蛋白质相互作用的特定分析技术,而是将视角投向更广阔的领域:分子层面的结构变异、代谢通路的调控机制,以及这些微观事件如何驱动宏观的细胞生理学变化。 --- 第一部分:生命构建块的精微结构与动态演化 本部分奠定了理解复杂生命系统的基础,重点探讨了构成生命的三大核心分子——核酸、蛋白质与脂质——在原子尺度上的构象复杂性和功能适应性。 第一章:核酸的拓扑学与表观遗传调控 本章深入剖析了DNA和RNA在三维空间中的折叠和组织方式。我们超越了经典的双螺旋模型,着重讨论了非标准核酸结构(如G-四链体、i-拟迹)在基因表达调控中的新兴作用。详细阐述了染色质高级结构——从核小体到拓扑相关结构域(TADs)——的形成机制,以及组蛋白的共价修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化)如何创建“表观遗传密码”。讨论了这些修饰如何协同作用,精确控制基因的开启与关闭,尤其是在发育重编程和肿瘤发生过程中的失调现象。 第二章:蛋白质折叠的能量景观与伴侣系统 本章的核心在于理解蛋白质如何从一维氨基酸序列精确地折叠成具有特定功能的活性三维结构。我们将详细介绍折叠过程中的热力学驱动力,包括疏水效应、氢键网络和范德华力的综合贡献。重点分析了分子伴侣蛋白(如Hsp70和伴侣素系统)在协助正确折叠、逆转错误折叠以及降解不可挽回的错误折叠蛋白中的关键角色。此外,还将讨论折叠疾病(如阿尔茨海默病和朊病毒病)的分子机制,强调错误折叠与聚集体形成对细胞稳态的破坏性影响。 第三章:膜脂质组学:结构、相变与信号转导平台 本部分将脂质视为超越能量储存的结构和信息分子。详细考察了不同脂质分子(磷脂、鞘脂、胆固醇)如何共同构建细胞膜的异质性微区,如脂筏(lipid rafts)。分析了温度、pH值和特定蛋白质结合如何诱导脂质双层发生相变(如从Ld到Lo相),以及这些相变如何影响膜蛋白的活性和信号分子的捕获。重点探讨了磷脂酰肌醇激酶通路在细胞内信号转导中的核心地位。 --- 第二部分:代谢网络:耦合、调控与环境响应 本部分将视角从单一分子转向相互关联的分子网络,探讨细胞如何通过精密的代谢调控来适应不断变化的环境压力和营养状态。 第四章:核心代谢流的节点控制与反馈抑制 本章系统梳理了糖酵解、三羧酸循环(TCA)和氧化磷酸化这三大核心代谢路径。重点分析了关键限速酶(如己糖激酶、磷酸果糖激酶-1、异柠檬酸脱氢酶)是如何受到腺苷酸(ATP/AMP)比率、还原当量(NADH/NAD+)以及下游产物的直接调控的。引入了代谢“流量”(Flux)的概念,解释了细胞如何实时优化资源分配以满足能量需求或生物合成需求,并讨论了缺氧和营养剥夺如何触发代谢重编程(如Warburg效应)。 第五章:氨基酸与核苷酸的合成与分解代谢 本章关注合成代谢的复杂性。详细解析了必需氨基酸和非必需氨基酸的生物合成路径,特别是氮的固定与转运机制。针对核苷酸代谢,重点描述了从头合成途径与补救途径的平衡,以及嘌呤和嘧啶的分解代谢如何产生尿酸等废物产物及其相关疾病(如痛风)。特别探讨了在快速增殖细胞中,代谢中间产物如何被“分流”至生物合成途径,支持DNA和蛋白质的快速积累。 第六章:线粒体:能量工厂的自给自足与跨细胞通讯 本章将线粒体视为一个半自主性细胞器。深入探讨了其独特的双膜结构、克氏循环的细节,以及电子传递链的效率调控。重点关注线粒体基因组的表达机制,以及线粒体动态(融合与分裂)对细胞活力和凋亡的决定性影响。此外,讨论了线粒体产生的活性氧物种(ROS)的双重角色:作为信号分子和氧化应激源头。 --- 第三部分:系统整合与生物学功能实现 本部分将前两部分的知识进行整合,探讨分子和网络层面的变化如何转化为可观察的细胞功能和生理状态。 第七章:细胞骨架的动态重塑与细胞运动学 本章聚焦于驱动细胞形态变化和内部物质运输的分子马达和支架蛋白。详细描述了肌动蛋白、微管和中间纤维的聚合与解聚的动态平衡,以及驱动蛋白(如驱动蛋白和动力蛋白)和肌球蛋白如何利用ATP水解驱动细胞内物质的定向运输。重点分析了细胞迁移过程中,如在胚胎发育和伤口愈合中,信号通路如何精确调控局部细胞骨架的重组。 第八章:细胞器间的物质交换与细胞凋亡的分子开关 本章探讨了细胞内膜系统(内质网、高尔基体、溶酶体)之间复杂的囊泡转运机制,包括信号肽介导的靶向、穿梭蛋白复合物(如SNAREs)的装载与融合。在功能方面,本章深入剖析了凋亡(Apoptosis)的内在和外在途径,详细描述了Bcl-2家族蛋白在维持或破坏线粒体外膜完整性方面的对立作用,以及半胱天冬酶级联反应(Caspase Cascade)的激活与执行。 第九章:环境信号转导的精确性与抗药性机制 本章总结了外部信号(如生长因子、激素、细胞因子)如何通过细胞膜受体被捕获并转化为细胞内的生物化学响应。重点讨论了酪氨酸激酶受体、G蛋白偶联受体(GPCRs)以及核受体信号通路的核心级联反应。最后,本章以前沿视角讨论了细胞如何通过代谢重编程、逃逸凋亡信号以及激活旁路通路来产生对治疗药物的抵抗性,从而加深对复杂疾病生物学的理解。

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