《中國海洋微生物菌種目錄》在科技部自然科技資源平颱項目“海洋微生物菌種資源整理整閤與共享試點”(No．2005DKA21209)項目的基礎上，首次將我國的海洋微生物菌種研究成果匯編成冊。體現瞭下列特色： 收入的海洋菌種多數是近年來分離得到的，共9756株。其中，細菌319個屬、1128個種、8378株；酵母32個屬、114個種、1065株；絲狀真菌，61個屬、115個種、313株。根據來源地分，大洋微生物3600餘株、極地微生物1000餘株、近海微生物4800餘株。引進及鑒定的模式菌株220株。
在編寫過程中，作者將所有細菌的16S rRNA序列在模式菌數據庫中進行比對分析，並根據同源性的高低與理化特徵，對菌名進行瞭修訂。
本目錄適閤於從事微生物研發工作的高校院所及相關企業單位收藏，也可供從事微生物研發的相關研究人員參考。
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