譯者序前言第一部分 Sanger DNA測序1 SangerDNA測序 1.1 Sanger測序的基礎 1.2 人類基因組計劃的未來 1.3 局限性以及未來的機會 1.4 生物信息學是關鍵 1.5 下一步將往哪裏走第二部分 新一代測序：通往個性化醫療2 lllumina基因組分析儀Ⅱ係統 2.1 文庫的製備 2.2 簇的創建 2.3 測序 2.4 配對末端讀序列 2.5 數據分析 2.6 應用 2.7 結論3 應用係統生物公司（ABI）SOLIDTM係統：基於連接的測序 3.1 引言 3.2 SOLID係統概述 3.3 SOLID係統應用 3.4 結論4 新一代基因組測序：454／Roche GSFLX 4.1 引言 4.2 技術概述 4.3 軟件和生物信息學 4.4 研究應用5 聚閤酶剋隆測序：曆史、技術及應用 5.1 介紹 5.2 聚閤酶剋隆測序的曆史 5.3 聚閤酶剋隆測序 5.4 應用 5.5 結論第三部分 瓶頸：序列數據分析6 新一代測序（NGS）數據分析 6.1 為什麼新一代序列分析有所不同？ 6.2 序列搜索策略 6.3 什麼是擊中，為什麼它對NGS十分重要？ 6.4 記分：為什麼NGS的記分不同？ 6.5 NGS序列分析的策略 6.6 後續數據分析7 DNASTAR的新一代軟件 7.1 個人基因組及個性化醫療 7.2 新一代DNA測序——作為個性化基因組學的方法 7.3 不同平颱的優勢 7.4 計算機挑戰 7.5 DNASTAR的新一代軟件解決方案 7.6 結論第四部分 新興測序技術8 實時DNA測序 8.1 全基因組分析 8.2 個性化醫療和藥物基因組學 8.3 生物防禦、法醫、DNA測試和基礎研究 8.4 簡單精巧：實時DNA測序9 使用Z型DNA分子替換的TEM直接測序 9.1 引言 9.2 方法的邏輯性 9.3 優化改良核苷酸鑒定技術進行DNA序列單獨聚閤的TEM目力分辨率 9.4 TEM基闆和可視化 9.5 利用聚閤酶進行Z-標簽核苷酸整閤 9.6 當前和新的測序技術 9.7 精度 9.8 zs遺傳學公司提齣的DNA測序技術的優勢 9.9 更長讀序列的優勢lO 單分子DNA條形碼方法及其在DNA圖譜和分子單體型中的應用 10.1 引言 10.2 單分子DNA條形碼方法中的關鍵技術 10.3 單分子DNA圖譜 10.4 分子單體型 10.5 討論11 光學測序：從圖像化的單分子模闆采集 11.1 引言 11.2 光學測序循環 11.3 光學測序的展望12 基於微芯片的Sanger DNA測序 12.1 基因組學分析的集成微流體裝置 12.2 Sanger測序微流體器件上網絡聚閤物的改進 12.3 結論第五部分 新一代測序：真實地整閤基因組分析13 應用配對末端雙標簽多重測序進行轉錄組和基因組分析 13.1 引言 13.2 配對末端雙標簽(PET)分析的發展 13.3 利用GIS-PET進行轉錄組分析 13.4 利用CHIP-PET在全基因組上定位轉錄因子結閤位點和錶觀遺幣修飾 13.5 利用ChlA-PET在全基因組上鑒定長距離互作 13.6 展望14 利用454測序平颱研究古基因組學 14.1 引言 14.2 DNA降解的挑戰 14.3 DNA降解對古基因組學研究的影響 14.4 降解與測序的準確性 14.5 樣品汙染 14.6 解決DNA損傷的方法 14.7 解決汙染的方法 14.8 還存在哪些基本問題，將來的前景如何15 ChIP-seq：蛋白質-DNA 作作圖 15.1 引言 15.2 曆史 15.3 染色質免疫沉澱測序(ChlP-seq)方法 15.4 基於雙脫氧標簽Sanger測序 15.5 基於雜交的標簽測序 15.6 邊閤成邊測序的應用 15.7 ChlP-seq的醫學應用 15.8 挑戰 15.9 ChlP-seq方法的展望16 新一代測序技術在MicroRNA的發現和錶達譜研究中的應用 16.1 miRNA的背景介紹 16.2 miRNA的鑒定 16.3 實驗方法 16.4 驗證 16.5 展望17 基於標簽的轉錄組學分析DeepSAGE。優於微陣列 17.1 引言 17.2 DeepSAGE 17.3 數據分析 17.4 基於標簽的轉錄組錶達譜的比較 17.5 錶達譜未來的展望18 新基因組學和個人基因組信息：倫理學問題 18.1 新基因組學和個人基因組信息：倫理學問題 18.2 新基因組學：它的特點是什麼? 18.3 倫理學的革新：為什麼我們需要它? 18.4 限製條款：全基因組學和本地倫理學觀 18.5 醫學倫理學和希波剋拉底保密性 18.6 生物醫學倫理學的原則 18.7 臨床研究和知後同意 18.8 大規模研究倫理學：新觀念 18.9 個人基因組 18.10 個人基因組計劃：允許信息公開英漢對照詞匯彩圖
· · · · · · (收起)