1、對深層物質結構的探索
2、協調相對論和量子論的睏難
3、引力波探測
4、質子自鏇“危機”及其實驗探索
5、力學的世紀難題――湍流
6、金屬微粒中的量子尺寸效應和超導電性
7、高溫超導電性
8、固體的破壞
9、宇宙結構的形成與星係的起源
10、太陽中微子之謎
11、活動星核的能源和演化
12、星際分子去和恒星的形成
13、宇宙常數問題
14、太陽活動的起源
15、磁元的爭辯
16、黑洞的證認
17、宇宙論中的暗物質問題
18、地外文明與太空移居
19、尋找地外理性生命
20、星係演化的途徑
21、最終解決人類能源問題的課題
22、未來的空間太陽能發電
23、太陽風的起源及其加速機製
24、日冕加熱和太陽風加速
25、錶麵張力梯度驅動對流
26、磁層亞暴和磁暴的整體過程
27、富勒烯化學
28、單原子識彆與分子設計和閤成
29、室溫有機超導體
30、催化的高選擇性閤成
31、原子簇物質
32、非綫性光學聚閤物實用化的若乾問題
33、分子工程學
34、分子元件的單原子加工和自組裝
35、可持續發展對化學的挑戰
36、地球科學中的非綫性和復雜性
37、地球構造運動驅動機製的反演
38、人類對全球環境變化影響的預測
39、氣候係統動力學
40、自然控製論
41、地震成因與地球內部流體
42、地球的自轉運動及其與地球各圈層的相互作用
43、現今岩石圈構造解析中的若乾難題
44、生物多樣性保護
45、細胞凋亡
46、生物學的理論大綜閤：遺傳、發育和進化的統一
47、分子識彆、化學信息學和化學反應智能化問題
48、人能否在地球以外長期生存
49、腦神經係統動力學
50、生命、人的思維、意識、目的等的物理學基礎
51、探索生命和遺傳語言
52、瘋牛病――中心法則――Affinsen原理
53、分子進貨的驅動力與分子進化理論
54、腦的諸模型能帶我們走多遠
55、如何控製化學反應的方嚮（反應通道）
56、未來的認知神經科學能束給意識以新的解釋
57、地球深化的統一理論：“兩均論”與“兩非論”
58、有機體信息係統的深化在物種生存、適應過程中的作用
59、腦的選擇性自適應
60、腦的行為的自組織
61、思維與智能的本質
62、人腦如何組織其信息存貯
63、腦與免疫功能
64、生命起源、細胞的起源和進化研究
65、生命的起源與蛋白質
66、RNAgn 與生命起源
67、注意的腦機製
68、智力的起源
69、細胞如何調控基因組的有序活動
70、人腦是怎樣認知外界視覺世界的
71、策略的植物細胞生理學問題
72、中心法則的空白――從新生肽到蛋白質
73、“JUNK”DNA有什麼功能
74、統一醫學
75、意識和思維動力學
76、人類疾病與基因
77、生命起源中的對稱性破缺
78、精神與免疫
79、改善老年性認知功能障礙的心理藥物學策略
80、解析全套細胞蛋白質結構與功能，展現生命活動全景
81、心思的神經生物學機理
82、細胞三維生長和組織培養
83、重返海洋
84、客觀世界的自組織
85、全信息理論與高等智能
86、關於“意識”問題
87、植物光閤作用吸、傳、轉能的分子機理及其調控
88、係統科學的睏惑
89、復雜經濟係統的演化分析
90、路徑積分
91、朗蘭茲綱領
92、球堆積問題
93、相變的數學理論
94、P－NP問題
95、超級計算理論
96、龐加菜猜想及低維拓撲
97、黎曼猜想
98、中華民族及現代人類的起源
99、人類基因組研究中的社會學、倫理學和法律問題
100、物質和精神的關係問題
· · · · · · (收起)