生物信息学教程

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出版者:化学工业
作者:蔡禄
出品人:
页数:305
译者:
出版时间:2007-3
价格:30.00元
装帧:
isbn号码:9787502596064
丛书系列:
图书标签:
  • 科学
  • 生物信息学
  • 计算生物学
  • 基因组学
  • 蛋白质组学
  • 序列分析
  • 数据库
  • 算法
  • Python
  • R语言
  • 生物统计学
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具体描述

伴随着人类及其他生物基因组计划的实施,生物信息学迅速成为生命科学的前沿领域。生物信息学是生物学与物理学、化学、数学、信息科学及计算机科学交叉的学科。各种生物信息数据呈指数式增长趋势,运用计算机管理数据、控制误差、加速分析过程势在必行。在此基础上解释实验现象,认识导致实验现象发生的本质,在“整合”、“系统”等全新理念下探索生物学规律,进而了解和掌握生命的物质基础和生命的本质成为当今生物学发展的趋势。

本书从生物信息学研究对象及主要研究内容、生物信息学资源、序列分析、序列比对、系统发生分析、基因组生物信息学、生物芯片、后基因组生物信息学几个方面进行了详细的介绍。

本书内容新颖、简明扼要、内容深浅适度。可作为生物信息学、分子生物学、遗传学、细胞生物学、医学及其他相关专业高年级本科生、研究生的教材,也可供教师和研究人员学习、参阅使用。

《计算生物学导论:解锁生命密码的工具与方法》 这是一本面向广泛读者,旨在揭示计算生物学这一蓬勃发展领域奥秘的入门读物。本书并非直接传授生物信息学特定技术或操作指南,而是着重于勾勒计算生物学的宏大图景,介绍其核心概念、基本原理以及在现代生命科学研究中扮演的关键角色。我们将一起探索如何运用计算思维和工具来理解和分析海量的生物数据,从而在分子层面揭示生命的运作机制。 本书内容梗概: 第一部分:计算思维与生命科学的融合 何为计算生物学? 我们将从根本上界定计算生物学,阐释它如何作为一门跨学科领域,融合了生物学、计算机科学、统计学和数学。本书会深入剖析这种融合的必要性和革命性影响,展示计算工具如何成为现代生物学家不可或缺的伙伴。 生物数据的爆炸性增长: 详细介绍基因测序技术(如二代、三代测序)、蛋白质组学、代谢组学、单细胞技术等前沿领域所产生的海量、高维度生物数据。我们将探讨这些数据的特点、挑战以及它们为我们理解生命提供的巨大潜力。 计算生物学在科学发现中的驱动作用: 通过生动案例,展示计算生物学如何加速了疾病机理的阐明、新药研发、个性化医疗的进步,以及对生命演化和多样性的深刻洞察。 第二部分:核心概念与理论基石 生物序列的表达与分析: 介绍DNA、RNA和蛋白质序列的基本结构和信息编码方式。我们将探讨序列比对的基本思想(如Needleman-Wunsch、Smith-Waterman算法的原理性介绍,而非具体编程实现),理解同源性、功能保守性等概念,以及它们如何帮助我们推断生物分子之间的关系。 基因组学概览: 探索基因组测序、组装、基因预测和功能注释的基本流程。本书将介绍宏基因组学、转录组学等概念,并阐释如何从庞大的基因组数据中提取有价值的信息,理解基因的功能和调控网络。 蛋白质结构与功能预测: 介绍蛋白质三维结构对其功能的重要性。我们将概述预测蛋白质结构的基本方法(如同源建模、Ab initio预测的原理性讲解),以及如何利用已知的结构信息来推断蛋白质的功能、相互作用和药物靶点。 系统生物学导论: 阐述系统生物学如何将生物体视为一个相互关联的复杂系统。我们将介绍建模和仿真在理解基因调控网络、信号转导通路等方面的作用,以及如何通过计算方法来分析和预测生物系统的行为。 第三部分:数据分析的思维框架 统计学在生物数据分析中的应用: 强调统计学原理在处理生物数据中的核心地位,介绍假设检验、回归分析、聚类分析等基础统计概念,并说明它们如何帮助我们从噪声中提取信号,做出可靠的生物学推断。 机器学习与生物学: 探讨机器学习算法如何被应用于生物数据分析。我们将介绍监督学习、无监督学习等基本范畴,并举例说明其在模式识别、分类、预测等生物学问题中的应用,例如识别疾病相关的基因标记物。 可视化在理解生物数据中的力量: 强调数据可视化在揭示生物模式、趋势和异常方面的重要性。我们将讨论不同类型的生物数据可视化方法,以及如何选择合适的可视化工具来有效地传达复杂信息。 第四部分:前沿探索与未来展望 生物信息学工具的生态系统: 简要介绍构成生物信息学研究的庞大工具库,包括数据库(如NCBI、Ensembl)、分析软件和编程语言(如Python、R在生物学领域的应用方向)。本书将侧重于介绍这些工具解决问题的能力,而非详细教授使用方法。 计算生物学伦理与挑战: 探讨在使用生物数据和计算技术时可能遇到的伦理问题,如数据隐私、算法偏见等,并提出应对策略。 计算生物学的未来方向: 展望计算生物学在人工智能、大数据集成、合成生物学等领域的发展趋势,以及它将如何继续引领生命科学的革命。 本书旨在为读者建立起计算生物学领域的知识框架,培养分析和解决生物学问题的计算思维。无论您是生物学领域的学生、研究人员,还是对生命科学的未来充满好奇的任何一位,都能从中获得启发,理解计算的力量如何帮助我们更深入地探索生命的奥秘。本书的重点在于“理解”和“概念”,而非“操作”和“实现”,期望读者能在阅读后,对如何运用计算方法研究生命产生浓厚的兴趣,并找到进一步学习和探索的方向。

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目录信息

读后感

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用户评价

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这是一次令人惊喜的探险,我感觉自己像一个走入迷宫的旅行者,每一步都充满了未知与刺激。作者的叙事方式犹如一条蜿蜒的小溪,时而潺潺流淌,时而奔腾向前,将我带入一个又一个意想不到的场景。我曾在一个宁静的夜晚,伴着皎洁的月光,沉醉于那些描绘细腻的情感纠葛,仿佛自己也成为了故事中的一员,体验着喜怒哀乐。又在某个阳光明媚的午后,我被那些激荡人心的情节深深吸引,仿佛置身于一场史诗般的战斗之中,热血沸腾。

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这是一次精神上的洗礼,仿佛置身于一个庄严而宁静的殿堂。作者的文字具有一种抚慰人心的力量,那些朴实无华的语言,却蕴含着深刻的智慧。我曾在一个失意的夜晚,通过阅读这本书,找到了内心的平静与慰藉。那些关于人生困境的描绘,让我意识到自己并非孤单一人。它没有刻意去宣扬某种道理,而是通过一个个生动的故事,引导我去领悟生命的真谛。我感觉自己如同一个饥渴的学生,贪婪地吸收着其中的养分。

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阅读这本书的过程,就像在品尝一道精心烹制的菜肴,每一口都层次丰富,回味无穷。它并非直接灌输知识,而是通过引人入胜的故事,巧妙地将某种深刻的哲理融入其中。我从中感受到了作者对生活独到的见解,那些看似平凡的场景,在他的笔下却充满了诗意与哲思。我曾为一个角色在困境中的挣扎而揪心,也为一个峰回路转的情节而欣喜若狂。这本书让我开始思考,那些我们习以为常的生活,是否隐藏着更深层次的意义。

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这本书仿佛是一扇通往另一个维度的窗口,让我得以窥探那些我从未想象过的世界。作者的想象力如同脱缰的野马,在文字的海洋中自由驰骋,构建出一个个奇幻瑰丽的场景。我曾跟随主角在浩瀚的星空中遨游,与未知的生物进行着奇妙的交流,也曾潜入深邃的海洋,探寻古老的秘密。那些描绘是如此生动逼真,让我仿佛亲身经历了一般,每一次翻页都充满了期待。

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这本书就像一本陈旧的日记,泛黄的书页散发出淡淡的墨香,仿佛承载着一段被遗忘的时光。当我翻开它,我仿佛置身于一个陌生的国度,空气中弥漫着一种古老的神秘感。文字并非是那种直白的叙述,而是如同迷雾般的低语,勾勒出遥远的回忆,那些关于过去的情感、经历以及那些早已消逝的风景。我努力去捕捉那些零碎的画面,试图拼凑出一个完整的故事,但它似乎总是在指缝间溜走,留给我无尽的遐想。

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