Bioinformatics for Dummies pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026
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具体描述
Were you always curious about biology but were afraid to sit through long hours of dense reading? Did you like the subject when you were in high school but had other plans after you graduated? Now you can explore the human genome and analyze DNA without ever leaving your desktop! Bioinformatics For Dummies is packed with valuable information that introduces you to this exciting new discipline. This easy-to-follow guide leads you step by step through every bioinformatics task that can be done over the Internet. Forget long equations, computer-geek gibberish, and installing bulky programs that slow down your computer. You’ll be amazed at all the things you can accomplish just by logging on and following these trusty directions. You get the tools you need to: Analyze all types of sequences Use all types of databases Work with DNA and protein sequences Conduct similarity searches Build a multiple sequence alignment Edit and publish alignments Visualize protein 3-D structures Construct phylogenetic trees This up-to-date second edition includes newly created and popular databases and Internet programs as well as multiple new genomes. It provides tips for using servers and places to seek resources to find out about what’s going on in the bioinformatics world. Bioinformatics For Dummies will show you how to get the most out of your PC and the right Web tools so you’ll be searching databases and analyzing sequences like a pro!
作者简介
目录信息
读后感
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用户评价
我尝试着跳到关于“基因组组装”的那一章，因为我对宏基因组测序的应用很感兴趣。我本以为可以学到关于De Novo组装和参考序列组装的不同策略，以及它们各自的优缺点和适用场景。结果，这一章的篇幅非常短，主要是在介绍组装的挑战性，而没有深入探讨任何主流的组装工具，比如SPAdes或者Velvet的工作原理概要。更让我失望的是，当涉及到高通量测序数据（如Illumina）的质量控制时，它只是笼统地提到了“需要去除低质量的碱基和接头序列”，但完全没有提及像FastQC或Trimmomatic这样的行业标准工具是如何工作的，更别提如何解读FastQC报告中的那些关键图表了。我买这本书是冲着“Bioinformatics”这个词去的，期待的是能得到一些实用的工具和方法论的指导，而不是一篇关于生物信息学“哲学”的探讨。这本书更像是对该领域的一次概览性介绍，而非一本能够让你真正站稳脚跟的实战指南，对于那些想立刻投身于实际数据分析工作的人来说，它的实用价值非常有限。
评分这本书最大的问题在于，它的“傻瓜”定位似乎更偏向于“智商在平均水平以上，但专业背景欠缺”的那群人。对于我这种需要从零开始理解“什么是序列比对”以及“为什么需要做多重检验校正”的读者来说，它的解释力度远远不够。举个例子，当它讨论到P值和FDR（错误发现率）的区别时，给出的例子非常晦涩，涉及到一个假设的、虚构的实验数据，而不是用一个生活中简单易懂的例子来类比。我感觉作者可能忘了，真的“傻瓜”需要的是用生活中的场景来建立认知模型。我甚至翻到了附录，希望能找到一些常用生物信息学名词的速查表，或者一份推荐的在线学习资源列表。遗憾的是，附录部分异常简陋，只有几个非常基础的术语解释，完全没有提供进一步探索的路径。我更希望看到的是一个“延伸阅读”的章节，里面列出可以下载真实数据集进行练习的网站链接，或者推荐一些优秀的YouTube教程系列。这本书更像是一份理论纲要，而非一份实用的操作手册。
评分这本《生物信息学傻瓜指南》真是让人又爱又恨，爱的是它试图把一个深不见底的领域掰开揉碎了讲给你听，恨的是，说实话，对于一个真正的小白来说，很多地方还是像在听天书。我本来是想找本入门书，了解一下DNA测序数据分析到底是怎么一回事，结果发现，这本书在理论的铺垫上花了大量的篇幅，什么基因组学、蛋白质组学的基本概念，简直恨不得把本科教材的目录搬过来。如果你对生物学背景一窍不通，可能光是理解“什么是生物信息学”的定义，就要查好几个字典。更别提里面那些关于算法和统计学的介绍，虽然作者声称是为了“傻瓜”而简化，但对于我这种文科背景出身的人来说，那些公式和模型推导简直是灾难。我期待的是能有一章专门讲讲目前最火的几款分析软件的界面操作和基本工作流，比如如何用某个常用工具上传数据、运行一个基本的差异表达分析，然后生成一张可读的火山图。但这本书里，这些实操性的内容几乎是付之阙如，更多的是在宏观地描绘这个领域的前景和挑战，这让我感觉自己像是参加了一场高水平的学术讲座，而不是在学习如何动手操作。我更希望看到的是一个手把手的教程，而不是一篇长篇的综述文章。
评分说实话，拿到书后，我花了好几天时间才啃完前三章，感觉收获甚微，主要是内容结构实在有些松散。它似乎想覆盖的知识点太多了，结果就是每个点都蜻蜓点水，没有一个能扎得深下去。比如，它提到了R语言在生物信息学中的重要性，也顺带提了Python的潜力，然后顺理成章地跳到了Linux命令行基础——这几个关键技能点之间缺乏一个清晰的逻辑串联，让我完全不知道应该优先学习哪一个。读到关于数据库检索的部分时，我满心期待能看到PubMed或者NCBI的实际截图和搜索技巧，比如如何用布尔逻辑高效筛选文献，或者如何定位到特定的基因序列文件。结果呢，它只是简单地提了一下这些数据库的存在性，然后就转到了生物信息学伦理的讨论。这对于急于上手做点小项目的人来说，简直是一种折磨。我需要的是那种“拿起鼠标，点击这里，输入这个代码，回车，等待结果”的流程，而不是这种高屋建瓴的叙述。这本书更像是为那些已经有一定编程基础，只是想了解生物信息学“是什么”的人准备的，而不是为我这种想“学着做”的初学者量身定做的。
评分说实话，这本书的排版和视觉设计让我感到非常混乱。信息密度太大了，而且字体和图表的混用显得非常随意。我特别关注图表质量，因为复杂的生物学概念往往需要清晰的示意图来辅助理解。然而，书中关于通路分析的流程图，线条纠缠不清，颜色区分也做得不好，常常需要盯着看了很久才能分辨出各个步骤之间的依赖关系。例如，在介绍差异基因表达分析流程时，原本应该清晰展示“计数-归一化-差异检验”的流程图，看起来更像一团意大利面。而且，很多关键术语在第一次出现时，并没有用粗体或不同的颜色突出显示，导致我阅读时需要不断地在正文和章节开头跳跃查找定义。对于一本旨在降低学习门槛的书籍而言，视觉引导是至关重要的，但这本书在这方面做得非常不到位。我希望看到的是大量清晰、简洁的插图，甚至是使用现代化的、扁平化的设计风格来呈现复杂的生物学网络，而不是这种略显过时的、拥挤的教科书式排版。
评分着实看不下去了……我觉得这个书应该是会者不用看不会者看不懂吧？不过大概对于没有IT能力的生物学者有用。
评分类似于随手翻之类的入门手册.如果想要"行了,别啰嗦那么多,给我一个软件",这本书基本可以满足
评分类似于随手翻之类的入门手册.如果想要"行了,别啰嗦那么多,给我一个软件",这本书基本可以满足
评分大致浏览了一遍，主要是利用网络上的免费工具来进行蛋白质结构的确定。并不是我想要找的内容。
评分类似于随手翻之类的入门手册.如果想要"行了,别啰嗦那么多,给我一个软件",这本书基本可以满足
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