DNA Conformation and Transcription

DNA Conformation and Transcription pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Springer Verlag
作者:Ohyama, Takashi 编
出品人:
页数:223
译者:
出版时间:2005-8
价格:$ 236.17
装帧:HRD
isbn号码:9780387255798
丛书系列:
图书标签:
  • DNA conformation
  • Transcription
  • Molecular biology
  • Genetics
  • Epigenetics
  • Chromatin
  • Gene expression
  • DNA structure
  • Transcription factors
  • Biophysics
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具体描述

Despite remarkable progress in genome science, we are still far from a clear understanding of how genomic DNA is packaged without entanglement into a nucleus, how genes are wrapped up in chromatin, how chromatin structure is faithfully inherited from mother to daughter cells, and how the differential expression of genes is enabled in a given cell type. Exploring and answering these questions constitutes one of the next frontiers in the 21st century. We are just beginning to appreciate how Multifarious DNA structures provide additional structural and functional dimensions to chromatin organization and gene expression. "DNA Conformation and Transcription" is the first book that compiles the fruits of the studies that have been performed to date to solve the riddle written in DNA conformation ("conformation code"). This book provides a comprehensive overview of the field by covering history of the field, up-to-date topics, clarifications of present day research, and future perspective of what is still to be discovered. Thus, it serves as an invaluable source of information on the "conformation code".

好的,这是一份关于一本名为《生命之钥:从结构到功能的多尺度生物物理学探索》的图书简介,该书内容完全独立于“DNA Conformation and Transcription”: --- 图书简介:《生命之钥:从结构到深层功能的多尺度生物物理学探索》 作者: [此处可虚构作者名,例如:张伟, 李明] 出版社: [此处可虚构出版社名,例如:科学前沿出版社] 定价: [此处可虚构定价] 装帧: 精装 / 约 900 页 / 附有大量原创插图和高分辨率模型图 导言:跨越尺度的生命奥秘 生物学的核心魅力在于其固有的复杂性与精妙的组织性。从原子层级的精确排列到宏观细胞器的协同运作,生命现象的展现依赖于结构与动态的完美耦合。然而,理解生命过程——特别是那些快速、瞬时且高度动态的事件——需要一种超越传统化学或分子生物学视角的工具箱。 《生命之钥:从结构到深层功能的多尺度生物物理学探索》正是应运而生的一部里程碑式的著作。本书系统性地整合了当今生物物理学的尖端方法论与理论框架,旨在揭示生命系统如何在其多层次的结构背景下实现其核心功能。我们不再仅仅关注分子本身,而是深入探讨它们如何通过空间构象的变化、能量的传递与耗散,以及在不同时间尺度上的动力学行为,共同编织出生命的宏伟图景。 本书的独特之处在于其多尺度整合的叙事结构。它清晰地描绘了如何运用一套相互关联的技术和模型,从量子力学的预测到细胞内环境的复杂性,来构建一个完整的生物理解模型。 第一部分:结构解析的革命性前沿 本书的开篇聚焦于解析生物大分子和复杂超分子结构的前沿技术。我们详细剖克冷冻电镜(Cryo-EM)的最新发展,特别是对亚纳米分辨率下动态过程捕捉的改进,如何使我们能够“冻结”那些转瞬即逝的酶促活性构象。 随后,章节深入探讨了X射线自由电子激光(XFEL)在时间分辨结构生物学中的应用,展示了如何通过“连拍”的方式,实时追踪光合作用中心、膜蛋白离子通道在光激发后的构象变化轨迹。这不仅仅是静态结构的叠加,而是对结构动力学的实时监控。 我们还专门设立章节阐述核磁共振波谱学(NMR)在溶液中和固态下研究蛋白质折叠、聚集体形成以及膜界面相互作用的最新进展。特别关注了新型弛豫测量技术如何揭示蛋白质内部的微秒到毫秒尺度的运动性,这对于理解功能相关的柔性至关重要。 第二部分:力学与能量的驱动:生物系统的物理基础 生命活动本质上是受力驱动的物理过程。本部分转向研究分子机器如何产生、感知和响应力,以及能量如何在分子间有效传递。 分子马达(Molecular Motors)的剖析是本部分的重点。我们详尽地分析了肌球蛋白、驱动蛋白和ATP合酶的单分子力学研究。通过原子力显微镜(AFM)和光学镊子的结合,读者将学习如何量化这些纳米机器的步进机制、速度调节以及负载容忍度。探讨了非平衡态热力学在描述这些马达运行效率中的核心作用。 能量传递方面,本书详细阐述了电子传递链与质子梯度驱动的机制。重点讨论了线粒体呼吸链中复合体的空间组织与电子隧穿的量子力学模型,以及跨膜质子流动如何转化为机械功的耦合效率问题。此外,我们还探讨了光合作用中激子转移的相干性对效率的贡献,以及生物光子学在理解初级反应中的作用。 第三部分:环境耦合:从溶剂到细胞质的复杂性 生物分子并非存在于真空之中,它们被复杂的水环境、离子背景和高分子浓度的细胞质所包围。本部分强调环境效应对分子功能的决定性影响。 我们系统地分析了水合作用与熵效应在蛋白质折叠和膜蛋白插入中的关键角色。通过分子动力学模拟(MD)的应用,读者将看到如何精确计算特定离子(如锂离子或镁离子)对特定生物反应活性的调节作用。 大分子拥挤(Macromolecular Crowding)效应是理解活细胞内反应速率和结合平衡的关键。本书提供了定量的模型和实验证据,说明在模拟真实细胞质环境(高浓度、异质性)下,酶促反应动力学如何偏离理想溶液中的测量结果。这部分还包含了对细胞骨架网络作为运输和结构支撑系统的生物力学建模。 第四部分:动态系统的建模与预测 理解生命过程的最终目标是预测其行为。本书的最后部分转向理论建模和计算方法,这些方法将实验数据转化为可操作的、具有预测能力的框架。 我们深入探讨了介观(Mesoscale)模拟方法,例如格子玻尔兹曼法(Lattice Boltzmann Method)和粗粒化分子动力学(Coarse-Grained MD),这些方法用于模拟病毒衣壳组装、核孔复合体(NPC)的渗透选择机制等大于10纳米尺度的过程。 最后,本书讨论了网络动力学理论在理解信号转导通路中的应用。通过将分子间的相互作用视为网络节点,我们可以分析突变或药物干预如何通过网络结构的变化导致整体功能的失调或重塑。 读者对象 《生命之钥》面向高年级本科生、研究生、博士后研究人员以及希望拓宽研究视野的资深学者。它要求读者具备扎实的物理化学和分子生物学基础。本书不仅是技术手册,更是一部引导读者进行跨学科思考的指南,旨在培养下一代能够运用物理学原理解决生物学难题的创新型科学家。 ---

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