Essential Bioinformatics

Essential Bioinformatics pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Cambridge Univ Pr
作者:Xiong, Jin
出品人:
页数:352
译者:
出版时间:2006-3
价格:$ 178.54
装帧:HRD
isbn号码:9780521840989
丛书系列:
图书标签:
  • Essential
  • CUP
  • Bioinformatics
  • 生物信息学
  • 计算生物学
  • 基因组学
  • 蛋白质组学
  • 序列分析
  • 算法
  • 数据挖掘
  • 生物统计学
  • 系统生物学
  • 进化生物学
想要找书就要到 图书目录大全
立刻按 ctrl+D收藏本页
你会得到大惊喜!!

具体描述

Essential Bioinformatics is a concise yet comprehensive textbook of bioinformatics, which provides a broad introduction to the entire field. Written specifically for a life science audience, the basics of bioinformatics are explained, followed by discussions of the state-of-the-art computational tools available to solve biological research problems. All key areas of bioinformatics are covered including biological databases, sequence alignment, genes and promoter prediction, molecular phylogenetics, structural bioinformatics, genomics and proteomics. The book emphasizes how computational methods work and compares the strengths and weaknesses of different methods. This balanced yet easily accessible text will be invaluable to students who do not have sophisticated computational backgrounds. Technical details of computational algorithms are explained with a minimum use of mathematical formulae; graphical illustrations are used in their place to aid understanding. The effective synthesis of existing literature as well as in-depth and up-to-date coverage of all key topics in bioinformatics make this an ideal textbook for all bioinformatics courses taken by life science students and for researchers wishing to develop their knowledge of bioinformatics to facilitate their own research.

好的,这是一份针对一本名为《Essential Bioinformatics》的图书所设计的、内容详尽且不提及该书本身的图书简介: --- 深入探索生命数据:生物信息学核心原理与实践 本书旨在为渴望系统掌握生物信息学核心知识与应用技术的读者提供一个全面而深入的指南。在这个数据驱动的生命科学时代,理解如何处理、分析和解释海量的生物学数据已成为科研工作者的必备技能。本书将从基础理论出发,逐步引导读者进入前沿的计算生物学领域,通过严谨的逻辑和丰富的实例,构建起坚实的知识体系。 第一部分:生物信息学基石——数据与算法的融合 本部分是构建生物信息学理解大厦的基石。我们将首先剖析生命科学数据的本质,包括DNA、RNA和蛋白质序列的结构特点,以及高通量测序(NGS)技术如何生成这些海量数据。我们着重探讨数据的标准化、清洗和预处理过程,这是任何成功分析的第一步。 随后,我们将详细介绍生物信息学领域最核心的算法和工具。从最基础的字符串匹配算法——如暴力搜索、KMP算法,到对生物序列比对至关重要的Smith-Waterman和Needleman-Wunsch全局/局部比对算法,本书会以清晰的数学原理和实际应用场景来阐述其工作机制。重点关注BLAST(基础局部比对搜索工具)的工作原理、参数选择及其在快速序列检索中的地位。 此外,序列的统计学基础是理解比对得分和意义的关键。读者将学习到概率模型、隐马尔可夫模型(HMM)的基本概念,这些模型是预测基因结构、识别蛋白质结构域的强大工具。 第二部分:基因组学:从序列到功能图谱 基因组学是生物信息学应用最广泛的领域之一。本书将带领读者系统地处理和解析全基因组数据。 基因组组装与注释: 对于新的或不完整的基因组,如何利用短读长序列进行精准组装是巨大的挑战。我们将深入探讨De Novo组装策略(如重叠群和成对末端信息),以及如何利用参考序列比对进行基因组组装。组装完成后,基因预测是下一步的重点。本书详细介绍了识别编码区(CDS)、内含子/外显子边界预测的统计方法和机器学习模型,并阐述了如何进行基因功能注释,将序列信息转化为具有生物学意义的标签。 比较基因组学: 理解物种间的进化关系和基因组的演化机制,需要依赖于精确的比较分析。本书涵盖了同源基因的识别、基因组共线性分析,以及如何利用系统发育树的构建方法(如NJ、ML、Bayesian方法)来推断进化历史。我们将讨论如何利用差异基因集进行物种分化时间推断。 第三部分:转录组学与蛋白质组学的数据解析 基因表达的动态变化(转录组学)和蛋白质的功能实现(蛋白质组学)是生命活动的核心。本部分聚焦于高通量数据的解析。 转录组数据分析(RNA-Seq): 从原始测序数据(FASTQ文件)开始,本书详细介绍了质量控制、比对到参考基因组的流程。核心内容在于基因表达定量(如TPM、FPKM/RPKM的计算差异),以及如何使用统计模型(如DESeq2、edgeR)进行差异表达基因(DEG)的分析。更进一步,我们将探讨RNA 剪接变体分析和lncRNA、circRNA等非编码RNA的鉴定。 功能富集与通路分析: 识别出成百上千的差异基因后,下一步是理解它们共同参与的生物学过程。本书详尽解释了GO(基因本体论)和KEGG通路分析的统计基础,包括超几何检验在富集分析中的应用,以及如何可视化这些复杂的功能网络。 蛋白质组学基础: 虽然侧重于核酸序列,但本书也触及了从序列预测到蛋白质功能理解的关键环节。这包括蛋白质结构域预测、跨物种的蛋白质同源性预测,以及蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)的构建与分析方法。 第四部分:面向实践的计算方法与工具链 生物信息学工作流的效率和准确性高度依赖于熟练掌握计算环境和编程工具。 编程基础与环境搭建: 本书假定读者具备一定的逻辑思维能力,并重点介绍R和Python在生物信息学中的核心应用。我们将展示如何利用R的Bioconductor生态系统进行复杂的统计分析,以及如何使用Python库(如Biopython)进行序列操作和数据处理。章节中会提供大量的代码片段和可复现的脚本示例。 数据库与资源管理: 熟练使用公共数据库是高效研究的保障。本书系统梳理了NCBI、UniProt、Ensembl等核心数据库的结构和查询策略。重点讲解Entrez编程接口(E-utilities)的使用,使用户能够自动化地从这些巨型数据库中提取所需信息。 大数据处理与高性能计算: 面对TB级别的数据集,传统的单机处理已不再可行。本部分将介绍集群计算环境(如SLURM、LSF)的基本概念,以及如何利用工作流管理系统(如Snakemake或Nextflow)来构建健壮、可重复的分析流程,确保研究结果的科学严谨性。 结语 本书不仅是一本参考手册,更是一条通往自主解决复杂生物学问题的学习路径。通过掌握这些Essential的原理和实践技巧,读者将能够自信地驾驭生命科学前沿研究中的数据挑战,将海量原始数据转化为有力的科学洞见。无论是高校学生、科研人员还是生物技术行业的专业人士,本书都将成为您在计算生物学领域迈向精通的可靠伙伴。 ---

作者简介

目录信息

读后感

评分

评分

评分

评分

评分

用户评价

评分

这本书的封面设计倒是挺吸引人的,淡蓝色的背景,搭配着白色的简洁字体,虽然我还没翻开它,但第一印象就是专业、严谨,给人一种踏实的感觉。我之前对生物信息学一直有点模糊的概念,知道它很重要,但具体是怎么一回事,总觉得隔着一层纱。我希望这本书能像它的名字一样,带我进入生物信息学的核心,让我真正理解这个领域。我最关心的是它会不会太理论化,毕竟我更喜欢动手实践。如果它能提供一些实际的操作案例,或者讲解一些常用的工具和软件,那我会觉得物超所值。我特别希望它能解释清楚生物信息学在基因组学、蛋白质组学等方面的应用,这些都是我一直很感兴趣的领域。如果这本书能把我从一个对生物信息学一无所知的新手,变成一个能初步理解和应用相关概念的人,那我一定会毫不犹豫地推荐它。而且,如果它能讲解一些前沿的研究进展,让我了解到这个领域正在发生什么,那就更好了。总的来说,我期望这本书能有一个清晰的逻辑结构,循序渐进地引导读者,而不是一开始就丢出大量晦涩难懂的术语。它能否让我感受到生物信息学的魅力,能否激发我对这个领域的进一步探索,是我非常期待的。

评分

这本书《Essential Bioinformatics》的名字本身就充满了吸引力,因为它暗示着它将聚焦于生物信息学的核心内容,这对于我这样一个希望快速掌握该领域精髓的学习者来说,无疑具有极大的价值。我目前正在进行一项与基因表达调控相关的研究,迫切需要了解如何利用生物信息学工具来分析RNA测序数据。因此,我特别希望这本书能够深入讲解RNA测序数据的处理流程,包括数据质量评估、比对到参考基因组、基因定量以及差异表达分析等关键步骤。我希望它能详细介绍各种常用的分析软件和算法,并解释它们的工作原理,让我不仅知其然,更能知其所以然。此外,我还对基因功能富集分析和通路分析感兴趣,希望这本书能够清晰地阐述这些方法的原理和应用,帮助我理解基因表达差异背后的生物学意义。如果书中还能包含一些关于如何解读和可视化这些分析结果的指导,以及如何撰写相关的生物信息学分析部分,那将对我大有裨益。

评分

这本《Essential Bioinformatics》给我的感觉,就像是为我量身打造的生物信息学入门指南。我一直觉得自己在这方面是个彻头彻尾的门外汉,虽然对生物学有一定的基础,但谈到数据分析、算法模型,我就感到力不从心。这本书的目录我简单浏览了一下,感觉内容涵盖的范围很广,从基础的生物分子结构到复杂的组学数据分析,似乎都包含在内。我特别关注它在讲解生物信息学算法时,是否能用通俗易懂的语言来阐述,避免过于抽象的数学推导,毕竟我的数学功底也一般。如果它能结合一些生动的比喻或者实际的生物学问题来解释算法原理,那效果肯定会好很多。我希望这本书能让我明白,为什么需要生物信息学,它解决了哪些传统生物学方法无法解决的问题。我希望它能引导我了解一些常用的生物信息学数据库,比如NCBI, Ensembl之类的,并教会我如何有效地检索和利用这些数据。如果书中还能介绍一些基本的命令行操作,比如Linux的基本命令,那对我来说绝对是锦上添花,因为我知道生物信息学领域很多操作都是在命令行下进行的。总而言之,我希望这本书能够成为我进入生物信息学世界的坚实起点,让我能够自信地踏上这条探索之路。

评分

《Essential Bioinformatics》这本书给我一种非常踏实的感觉,仿佛它就像我学习生物信息学道路上的一块垫脚石,能够承载我稳步前行。我一直觉得生物信息学是一个跨学科的领域,它融合了生物学、计算机科学、数学和统计学等多个学科的知识,这让我既感到兴奋又有点不知所措。我希望这本书能够帮助我理清这些学科之间的联系,让我明白生物信息学是如何将这些知识融会贯通,从而解决复杂的生物学问题。我特别关注它在讲解生物统计学在生物信息学中的应用,比如如何进行假设检验,如何理解p值和置信区间,以及如何进行多元统计分析。我希望它能够清晰地阐述这些统计学概念在解读生物学数据时的重要性。同时,我也对如何利用生物信息学来分析和理解复杂的调控网络(如基因调控网络、信号转导通路)充满兴趣,希望书中能够提供一些相关的理论和方法。这本书能否让我对生物信息学有一个更深刻的、更全面的认识,是我非常期待的。

评分

拿到《Essential Bioinformatics》这本书,我首先被它的内容结构所吸引,看起来非常系统和全面。我之前在一些零散的资料中接触过生物信息学的一些概念,但总觉得不成体系,就像是碎片化的知识点。我希望这本书能够帮助我将这些碎片化的知识点串联起来,形成一个完整的知识体系。我特别关注它在讲解生物序列分析方面的深度,例如DNA、RNA和蛋白质序列的比对、搜索、比对算法的原理以及如何解释比对结果。我希望它能详细解释各种算法的优缺点,以及它们在不同场景下的适用性。此外,我对于基因组组装和基因预测也充满了好奇,我希望这本书能够清晰地介绍这些过程的原理和常用方法,让我理解我们是如何从原始测序数据中构建出基因组的。如果书中还能包含一些实际操作的指导,比如如何使用一些免费的在线工具进行序列分析,那对我来说将是非常有价值的。我希望这本书不仅仅是理论的堆砌,更能让我感受到生物信息学在解决实际生物学问题中的强大力量,让我能够真正地 "用起来"。

评分

我之所以选择《Essential Bioinformatics》,很大程度上是因为我目前的研究方向与生物信息学紧密相关,但我在这个领域的知识储备却相对薄弱。我渴望能够通过这本书,系统地学习生物信息学的核心概念和方法,从而更好地指导我的科研工作。我特别希望这本书能够深入讲解生物信息学在疾病研究、药物发现等领域的应用,例如如何利用基因组学数据寻找致病基因,如何利用蛋白质组学数据鉴定药物靶点等。我希望它能介绍一些常用的生物信息学数据库和工具,并给出它们的使用指南,让我能够快速上手。我对于如何从海量的生物数据中提取有价值的信息,进行有效的可视化和解释,也充满了疑问。如果这本书能够提供一些关于数据挖掘、机器学习在生物信息学中的应用,并给出一些实际的案例,那对我来说将是巨大的帮助。我希望这本书能够提升我的数据分析能力,让我能够更自信地处理和解读我的研究数据,从而推动我的科研项目取得突破。

评分

老实说,我对生物信息学一直存在一种既好奇又畏惧的心情。好奇的是,我知道它在现代生物学研究中扮演着至关重要的角色,能够帮助我们解读生命密码;畏惧的是,我总觉得这个领域涉及大量的编程、算法和统计知识,对于我这样非计算机专业背景的人来说,门槛似乎很高。我拿到《Essential Bioinformatics》这本书,最先吸引我的就是它的标题,"Essential"这个词给了我很大的信心,它暗示着这本书会抓住核心,提炼精髓,不会让我迷失在细枝末节中。我希望这本书能够在我刚接触这个领域时,就建立起一个清晰的概念框架,让我明白生物信息学到底是什么,它研究的对象是什么,以及它的主要研究方向有哪些。我希望它能够循序渐进地介绍生物学数据是如何产生、存储和处理的,以及在这个过程中涉及到的关键技术和工具。特别是关于基因组学和蛋白质组学的数据分析,这是我最感兴趣的两个领域,我希望这本书能够详细讲解它们的基本概念、常用的分析方法以及一些经典的案例。如果它还能解释清楚不同类型的数据(如测序数据、表达谱数据等)之间的差异以及如何进行整合分析,那我会觉得收获非常大。

评分

读《Essential Bioinformatics》这本书,我期望它能像一位经验丰富的向导,带领我深入生物信息学这座神秘而广阔的殿堂。我之前对生物信息学仅停留在“高大上”的印象,觉得它充满各种复杂的代码和算法,让我望而却步。我希望这本书能够打破这种刻板印象,用一种清晰、易懂、引人入胜的方式来讲解生物信息学。我特别关注它在讲解生物信息学基础概念时,是否能够深入浅出,例如,如何用形象的比喻来解释基因序列的编码方式,如何理解蛋白质的三维结构是如何影响其功能的。我希望它能够详细介绍生物信息学中的一些关键技术,比如DNA测序技术的发展历程、不同测序平台的优缺点,以及如何对测序数据进行质量控制和预处理。而且,我对于如何进行生物信息学的数据可视化也很有兴趣,我希望书中能够提供一些指导,让我能够将复杂的分析结果以清晰直观的方式呈现出来。这本书能否让我从“小白”蜕变为一个能够理解和运用生物信息学基本工具的人,是我非常期待的。

评分

拿到《Essential Bioinformatics》这本书,我第一眼就觉得它的内容设计非常适合我这种需要快速上手、掌握实用技能的学习者。我之前接触过一些生物信息学的零散教程,但总觉得它们要么过于理论化,要么就只停留在操作层面,缺乏系统性的讲解。我希望这本书能够在这两方面取得很好的平衡。我特别关注它在讲解如何使用各种生物信息学工具时,是否能够提供详细的操作步骤和示例,比如如何使用BLAST进行序列相似性搜索,如何使用Primer3设计引物,如何使用Geneious进行基因组编辑等。我希望它能够涵盖一些在分子生物学实验中经常会用到的生物信息学工具,让我能够立即将学到的知识应用到我的实验设计和数据分析中。此外,我对如何进行基因克隆和基因表达载体构建的生物信息学分析也很有兴趣,希望这本书能够提供相关的指导。总的来说,这本书能否让我成为一个能够独立运用生物信息学工具解决实际分子生物学问题的“能手”,是我最看重的一点。

评分

我对《Essential Bioinformatics》这本书的期待,源于我对生物信息学在理解生命奥秘方面的巨大潜力感到着迷。我总觉得,生命就像一本用DNA和蛋白质写成的复杂书籍,而生物信息学就是我们解读这本书的钥匙。我希望这本书能够帮助我掌握解读这本“生命之书”的基本技能。我特别关注它在介绍生物信息学算法时,是否能够提供清晰的数学背景和逻辑推理,让我理解算法的设计思想,而不是仅仅停留在调用函数层面。我希望它能够涵盖诸如序列比对算法(如Smith-Waterman, BLAST),序列模式发现算法(如隐马尔可夫模型),以及系统发育树构建算法等经典内容。同时,我也对如何利用生物信息学来预测蛋白质结构和功能充满兴趣,希望书中能够介绍相关的理论和方法。总而言之,我希望这本书能够让我对生物信息学的核心理论和算法有一个扎实的理解,为我未来深入研究打下坚实的基础。

评分

评分

评分

评分

评分

本站所有内容均为互联网搜索引擎提供的公开搜索信息,本站不存储任何数据与内容,任何内容与数据均与本站无关,如有需要请联系相关搜索引擎包括但不限于百度google,bing,sogou

© 2026 book.wenda123.org All Rights Reserved. 图书目录大全 版权所有