The Theoretical Biologist's Toolbox

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出版者:Cambridge University Press
作者:Marc Mangel
出品人:
页数:390
译者:
出版时间:2006-8
价格:USD 71.00
装帧:Paperback
isbn号码:9780521537483
丛书系列:
图书标签:
  • MathematicalBiology
  • 理论生物学
  • 生物数学
  • 计算生物学
  • 系统生物学
  • 生物物理学
  • 建模
  • 模拟
  • 数学建模
  • 生物信息学
  • 进化生物学
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具体描述

Mathematical modelling is widely used in ecology and evolutionary biology and it is a topic that many biologists find difficult to grasp. In this new textbook Marc Mangel provides a no-nonsense introduction to the skills needed to understand the principles of theoretical and mathematical biology. Fundamental theories and applications are introduced using numerous examples from current biological research, complete with illustrations to highlight key points. Exercises are also included throughout the text to show how theory can be applied and to test knowledge gained so far. Suitable for advanced undergraduate courses in theoretical and mathematical biology, this book forms an essential resource for anyone wanting to gain an understanding of theoretical ecology and evolution.

- Grounded in real biological problems, this book helps readers see the immediate relevance of mathematics

- Written in a friendly style with exercises interspersed throughout the text

- Contains a mixture of deterministic and stochastic methods

好的,以下是一本图书的简介,内容与《The Theoretical Biologist's Toolbox》无关,且力求详尽、自然。 --- 《星辰下的编码者:量子计算前沿与未来算法的构建》 作者: 艾莉森·韦伯斯特 (Allison Webster) 出版社: 环球科学出版社 页数: 788 页 (精装本) 定价: 398.00 元 --- 导言:算法的黎明与量子革命的低语 自图灵奠定计算理论基石以来,我们对“可计算性”的理解经历了数次翻天覆地的变革。然而,在硅基晶体管的物理极限日益逼近的当下,一个更深层次的范式转变正在酝酿之中——量子计算。本书并非一本面向初学者的科普读物,它是一份面向资深程序员、计算机科学家以及寻求突破计算瓶颈的研究人员的深度技术手册与战略蓝图。 《星辰下的编码者》旨在系统地梳理并剖析当前量子计算领域的核心理论框架、实现路径的工程挑战,以及面向未来应用场景的算法设计哲学。本书的叙事结构遵循“理论奠基—硬件制约—算法创新—未来展望”的逻辑链条,力求为读者提供一个全面、深刻且具备前瞻性的视角。 第一部分:量子力学基石与信息论的重构(理论深度解析) 本部分是理解后续所有量子算法的逻辑起点。我们不再停留在对“叠加态”和“纠缠”的简单类比上,而是深入探究其在信息论层面的严格数学描述。 章节核心内容速览: 1.1 量子态空间与希尔伯特空间几何: 详细阐述了量子比特(Qubit)的代数结构,重点讨论了张量积在描述多体系统时的应用,以及对密度矩阵在处理开放系统时的必要性。我们用数理严谨的方式推导了布洛赫球(Bloch Sphere)的几何意义,并将其与量子相位的物理关联性建立起来。 1.2 量子门集与通用性证明: 对Pauli矩阵、Hadamard门及CNOT门这三大核心操作进行了详尽的代数分解。本书花费大量篇幅讨论了如何使用有限的通用门集(如Toffoli和Hadamard)来构建任意酉变换,并对比了不同量子计算架构(如拓扑量子计算)对“通用门集”的内在要求差异。 1.3 量子信息论的熵与复杂性: 超越经典香农熵,深入探讨冯·诺依曼熵(Von Neumann Entropy)在量化纠缠度中的作用。同时,本书引入了量子相对熵(Quantum Relative Entropy)的概念,用以衡量不同量子态之间的“距离”,这对于优化量子误差修正码至关重要。 第二部分:硬件架构的工程现实与噪声的制约(从理论到物理) 理论上的无限算力必须面对现实世界中物理实现的苛刻约束。本部分着重分析当前主流量子硬件平台的工程瓶颈及其对算法选择的直接影响。 章节核心内容速览: 2.1 超导量子比特(Transmon Qubits): 详细解析了微波脉冲控制的物理机制,并重点剖析了“退相干时间”(Decoherence Time)这一核心指标的物理根源(例如,电荷噪声和磁通噪声)。书中包含了一个完整的电路级仿真模型,用于预测不同耦合结构下的串扰效应。 2.2 离子阱技术(Trapped Ions): 关注其高保真度操作的优势,但更侧重于其扩展性(Scalability)的难题。我们分析了离子阱阵列中激光冷却和多通道传输的复杂度,并讨论了Mølmer-Sørensen门在实现高效率两比特门时的优化策略。 2.3 容错量子计算(FTQC)的挑战: 这一章是本书的工程核心。它系统性地介绍了Shor代码、Steane代码等早期容错机制的局限性,并详细阐述了表面码(Surface Code)的拓扑结构和实现逻辑。书中提供了详细的阈值分析,明确指出当前硬件距离实现逻辑量子比特所需的错误率还有多远。 第三部分:NISQ时代的算法设计哲学与应用探索(算法的创新前沿) 在完全容错的量子计算机(FTQC)实现之前,我们必须利用当前噪声中型量子设备(NISQ)解决实际问题。本部分聚焦于如何“驯服”噪声,设计出在当前硬件上具有实际加速潜力的算法。 章节核心内容速览: 3.1 变分量子本征求解器(VQE): 这是一个混合量子-经典范式。本书摒弃了肤浅的应用介绍,转而深入探讨了Ansatz的构建策略。我们对比了UCCSD(Unitary Coupled Cluster Singles and Doubles)与更灵活的硬件高效Ansatz(Hardware-Efficient Ansatz)在化学模拟中的表现,并提出了基于强化学习来动态优化迭代参数的“自适应VQE”框架。 3.2 量子近似优化算法(QAOA)的局限性与改进: 针对组合优化问题,我们详尽分析了QAOA在寻找最佳“p”层数时的难度。书中提出了一种“多尺度优化策略”,通过引入不同频率的混合器(Mixer)哈密顿量,试图在有限的电路深度内探索更广阔的解空间。 3.3 量子机器学习的嵌入层(Embedding Layer): 在量子支持向量机(QSVM)和量子神经网络(QNN)中,如何将经典数据映射到高维量子态空间(Quantum Feature Map)是性能的关键。本书提供了一套“结构化数据嵌入框架”,该框架旨在最小化特征映射的电路深度,同时最大化数据在量子空间中的可分性。我们展示了如何利用傅里叶基底和特定排列的旋转门来实现高效的特征编码。 结论与展望:超越加速,迈向新计算范式 全书的收尾部分,作者将目光投向更远。我们探讨了量子霸权(Quantum Supremacy)的真正含义——它不是速度的绝对超越,而是对计算范式的根本性重塑。本书最后展望了量子模拟器(Quantum Simulators)在材料科学和高能物理领域中的不可替代性,以及信息不可复制性原理在构建下一代安全通信协议中的潜在影响。 《星辰下的编码者》不是一个终点,而是一张详尽的地图,指引着那些不满足于在现有计算边界内徘徊的思考者,去探索下一代计算领域的星辰与算法的深海。 --- 读者画像建议: 具备扎实的线性代数、概率论基础,并对高阶算法设计有浓厚兴趣的专业人士。建议读者在阅读前对经典复杂性理论有基本了解。

作者简介

目录信息

http://assets.cambridge.org/97805218/30454/toc/9780521830454_toc.pdf
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读后感

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用户评价

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我最近对《The Theoretical Biologist's Toolbox》这本书充满了好奇!我一直在寻找一本能够系统地介绍如何运用数学和计算方法来研究生物学的书籍,而这本书的名字恰好击中了我的痛点。我脑海中勾勒出的这本书,应该是一个循序渐进的指南,从基础的数学概念开始,逐步引导读者掌握更高级的建模和分析技术。我希望它能够清晰地解释不同理论工具的适用范围,以及在面对不同类型的生物学问题时,应该如何选择和运用它们。我尤其关注的是,这本书会不会提供一些关于如何将数据驱动的洞察与模型构建相结合的实践建议。比如,当实验数据不尽如人意时,如何利用理论工具来启发新的实验设计?或者,当模型预测与观察结果存在偏差时,如何反过来优化模型?我期待它能够帮助我培养一种批判性思维,能够审慎地评估理论模型在解释真实世界中的局限性,并能有效地从中提炼出有意义的生物学见解。如果它能让我感觉到,我正在学习一套能够让我“玩转”生物学理论的必备技能,那就太棒了。

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天呐,我简直等不及要拿到《The Theoretical Biologist's Toolbox》了!光是这个名字就勾起了我无限的遐想。想象一下,它就像一位经验丰富的导师,手里提着一个装满各种奇妙工具的箱子,准备好一一向我展示如何用它们来解开生命体的奥秘。我希望这本书能够用一种非常引人入胜的方式来介绍那些听起来可能有些枯燥的数学和计算工具。比如,它会不会用生动的比喻来解释微分方程在描述种群增长中的作用?或者,它会不会通过一个引人入胜的谜题来引出图论在网络生物学中的应用?我非常好奇它会如何处理那些常常让初学者望而却步的统计学概念,希望它能用一种直观易懂的方式呈现,让我不再害怕复杂的公式和假设检验。我期待的是,读完这本书,我不仅能知道“是什么”,更能理解“为什么”和“怎么做”。那种能够将一个看似杂乱无章的生物现象,通过理论工具抽丝剥茧,最终揭示其背后规律的成就感,是我一直追求的。我希望这本书能成为我探索生物学世界最得力的助手,为我的研究提供源源不断的灵感和方法论的支持。

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《The Theoretical Biologist's Toolbox》这本书,光是听名字就让我心潮澎湃!我一直觉得,生物学就像一门宏大的艺术,而理论工具就是我们手中的画笔和调色板,能够帮助我们描绘出这幅波澜壮阔的生命画卷。我期待这本书能带我走进一个全新的视角,让我看到那些隐藏在生命现象背后的数学优雅和逻辑严谨。我希望能在这本书里找到关于如何运用统计力学来理解细胞分子过程的入门指导,或者关于如何构建计算模型来模拟种群演替的详细介绍。我希望它能用一种充满启发性的方式,让我领略到理论生物学不仅仅是枯燥的公式和算法,更是理解生命本质的强大武器。我特别好奇它是否会涉及一些前沿的计算方法,比如机器学习在基因组学或蛋白质组学中的应用,或者网络科学在系统生物学中的潜力。如果这本书能够让我感受到,我正在学习一套可以让我对生命系统进行深度探索和创新的工具,那么它将是我心目中理想的读物。我渴望这本书能够点燃我内心对理论生物学的热情,并赋予我解决复杂生物学问题的信心和能力。

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我真的非常期待能看到《The Theoretical Biologist's Toolbox》这本书!作为一个对生物学理论建模有着浓厚兴趣的读者,我一直在寻找一本能够深入浅出地介绍相关工具和方法的权威读物。从书名来看,它似乎提供了一个全面的工具箱,能够帮助我构建和分析复杂的生物系统。我设想这本书会涵盖从基础数学模型到高级计算方法的广泛内容,并且会详细解释每种工具的应用场景和局限性。我尤其关注它是否会深入探讨诸如动力学系统、统计推断、贝叶斯方法等在现代生物学研究中至关重要的工具。我希望书中能有清晰的案例研究,展示这些理论工具如何被成功应用于解决实际的生物学问题,比如疾病传播模型、基因调控网络分析,甚至是进化生态学的研究。如果这本书能够引导我理解如何将抽象的理论概念转化为可操作的模型,并能有效地解释实验数据,那么它对我来说将是无价的。我对它能否提供关于模型验证和参数估计的实用技巧也抱有极高的期望,因为这通常是理论生物学研究中极具挑战性的环节。我脑海中浮现的是一本内容扎实、逻辑清晰、且能够激发我独立思考和研究的著作。

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这本书《The Theoretical Biologist's Toolbox》听起来简直是为我量身定做的!我一直以来都觉得,要真正理解生物学,光靠观察和实验是远远不够的,还需要一些强有力的理论框架和分析工具来支撑。我设想这本书会是一个宝库,里面装满了各种可以用来构建和测试生物学假设的“秘籍”。我特别想知道它会不会深入讲解一些用于模拟和预测生物系统行为的计算方法,比如蒙特卡洛模拟或者 agent-based modeling。我希望能看到一些关于如何选择最合适的模型来回答特定生物学问题的指导,以及如何评估模型的有效性和鲁棒性。而且,作为一个对生物多样性保护和生态系统动态变化深感兴趣的读者,我非常期待书中能有关于如何利用理论工具来分析和预测这些复杂过程的内容。比如,如何用模型来评估外来物种入侵的影响?如何预测气候变化对生态系统的长期后果?如果这本书能够提供这样的视角和工具,那它绝对是我书架上的必备藏品。我希望它能帮助我从更宏观、更系统化的角度去理解生命现象,而不是仅仅停留在微观的层面。

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