Yeast Gene Analysis

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出版者:Academic Pr
作者:Stansfield, Ian (EDT)/ Stark, Mike (EDT)
出品人:
页数:730
译者:
出版时间:2007-8
价格:$ 200.01
装帧:Pap
isbn号码:9780123694799
丛书系列:
图书标签:
  • 酵母基因组
  • 基因分析
  • 分子生物学
  • 遗传学
  • 基因工程
  • 生物技术
  • 基因表达
  • 基因功能
  • 酵母遗传学
  • 基因组学
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具体描述

Focusing on Saccharomyces cerevisiae, the second edition of "Yeast Gene Analysis" represents a major reworking of the original edition, with many completely new chapters and major revisions to all previous chapters. Originally published shortly after completion of the yeast genome sequence, the new edition covers many of the major genome-wide strategies that have been developed since then such as microarray analysis of transcription, synthetic gene array studies, protein microarrays and chemical genetic approaches. It represents a valuable resource for any research laboratory using budding yeast as their experimental system in which to identify new yeast gene functions. The chapters are written in a readable style with useful background information, technical tips and specific experimental protocols included as appropriate, enabling both the novice and the experienced yeast researcher to adopt new procedures with confidence. It includes new chapters on: strain construction, genome-wide two-hybrid approaches, use of microarrays for transcript analysis, real-time analysis of chromosome behaviour and FRET, synthetic gene array technology and protein arrays, chemical genomics and yeast prions, RNA gene analysis and mitochondrial gene function analysis, phylogenetic footprinting, and discovering human gene function and predicting yeast gene function.

好的,这是一本关于微生物生理学与代谢工程的专著的详细简介,其内容与酵母基因分析无关: --- 《极端环境微生物生理学与生物技术前沿》 第一章:导论——生命的韧性与未知的疆域 本书深入探讨了地球上那些最极端生态系统中微生物的生命策略、生理适应机制以及这些生命形式在现代生物技术中蕴藏的巨大潜力。我们首先勾勒出极端环境的定义与分类,包括但不限于嗜热(Thermophiles)、嗜冷(Psychrophiles)、嗜酸/嗜碱(Acidophiles/Alkaliphiles)、高盐(Halophiles)以及高压(Piezophiles)环境。重点分析了生命体如何应对跨越传统生命界限的物理化学压力,如蛋白质变性、膜流动性丧失、DNA损伤与能量获取的挑战。 本章强调,理解这些极端微生物的生存之道,不仅仅是对生命极限的探索,更是对生命普遍适应性原则的重新认识。我们引入了“生物圈极限理论”,讨论了地球上生命存在的最低和最高温度、pH值和盐度阈值,为后续章节中对具体物种生理机制的剖析奠定理论基础。 第二章:极端微生物的分子与细胞适应机制 本章是全书的核心,详细解析了极端微生物为维持细胞稳态和功能所演化出的独特分子工具箱。 2.1 极端耐热性(Hyperthermophily) 重点剖析了古菌和细菌如何通过增强蛋白质的稳定性和刚性来抵抗高温。具体研究了以下结构性调整: 分子伴侣系统(Chaperone Systems): 探讨了热休克蛋白(HSP)家族,如Hsp70和Hsp60同源物,在防止蛋白质聚集和错误折叠中的作用。 基因组与DNA保护: 分析了超螺旋密度增加、DNA修复酶的高活性,以及耐热的DNA结合蛋白(如Sac7D)如何稳定核酸结构。 细胞膜的重塑: 针对脂质成分的改变,如嗜热古菌中醚键联脂质的双层结构(Bilayer)乃至单层结构(Monolayer)的形成,如何提高膜的刚性和抗融化性。 2.2 嗜冷适应(Psychrophilic Adaptations) 与耐热性相反,嗜冷微生物必须保持细胞组分在低温下的功能性。本章深入探讨了: 酶的“柔性”设计: 阐述了嗜冷酶如何通过降低激活能垒、增加侧链极性与减少疏水核心区域的体积,从而在冰点附近维持高催化效率。 冷适应性膜: 讨论了不饱和脂肪酸比例的增加以及短链脂酸的引入如何保证细胞膜在低温下的必要流动性,这对营养吸收和信号转导至关重要。 抗冻机制: 考察了胞外和胞内抗冻蛋白(AFPs)的结构与功能,它们通过抑制冰晶生长和防止细胞脱水来保护细胞结构。 2.3 渗透压与pH值的调控 详细阐述了高盐和极端酸碱环境下的细胞等渗调节策略。 嗜盐生物(Halophiles): 区分了“盐渍化策略”(Salt-in Strategy,如某些古菌通过积累高浓度胞内盐分)和“相容性溶质策略”(Compatible Solutes Strategy,如合成或积累甘油、海藻糖等对细胞结构无害的有机分子)。 极端酸碱耐受: 重点分析了嗜酸微生物如何通过高效的质子泵(如F-ATP酶的反向运作)来维持接近中性的胞内pH值,以及嗜碱生物如何利用高效的外排系统控制细胞壁的电荷分布。 第三章:极端微生物的生物能源与生物合成 本章聚焦于这些独特生物体在能量代谢和关键生物分子生产中的创新能力。 3.1 极端环境下的能量获取途径 分析了在缺乏光照、氧气或传统电子供体/受体时的化学自养(Chemolithotrophy)和厌氧氧化还原反应。特别关注了基于铁、硫化物或甲烷作为能量来源的微生物群落结构及其代谢途径。 3.2 极端酶的高级应用 极端酶因其在非生理条件(如高温、高有机溶剂浓度)下仍能保持活性的特点,成为工业生物技术的热点。本章系统分类和介绍了: 热稳定蛋白酶与脂肪酶: 在洗涤剂、食品加工和生物燃料生产中的应用案例。 耐酸/耐碱淀粉酶: 在糖化和纸浆工业中的优化潜力。 超低温反应催化剂: 在不对称合成和精细化工中,利用嗜冷酶实现高选择性反应的流程设计。 3.3 新型生物材料的提取与利用 探讨了极端微生物合成的独特聚合物和代谢产物,如: 聚羟基脂肪酸酯(PHAs): 嗜盐菌和嗜热菌合成的PHAs具有不同的分子量和结晶度,有望用于生产高性能生物降解塑料。 生物表面活性剂(Biosurfactants): 嗜盐菌产生的鼠李糖脂等,在环境修复和石油开采中表现出卓越的乳化能力。 第四章:极端微生物群落生态学与环境生物技术 本章将视角从单个细胞扩展到复杂的微生物群落,探讨它们在地球元素循环和生物修复中的作用。 4.1 地下与深海生态系统 研究了深层岩石圈(Deep Biosphere)和海底热液喷口附近的微生物群落结构、物种多样性及其对全球碳、氮、硫循环的贡献。强调了宏基因组学工具在解析这些隔离环境中生物学复杂性的关键作用。 4.2 生物修复(Bioremediation)中的极端策略 极端微生物是处理高污染负荷环境的理想选择。本章详细介绍了: 重金属耐受与固定: 嗜酸菌如何通过细胞表面络合或氧化还原反应将有毒重金属(如铀、砷)转化为低毒或不溶性形态。 难降解污染物降解: 嗜热菌和嗜碱菌对多环芳烃(PAHs)、氯代烃等复杂有机污染物的代谢能力及其应用潜力。 第五章:展望与挑战 本书总结了当前极端微生物研究的前沿方向,包括单细胞组学技术在解析非培养微生物生理学中的应用、合成生物学对极端代谢途径的重构,以及开发高效、低成本的生物反应器以实现极端酶和代谢产物的规模化生产。同时,讨论了从极端环境获取生物资源的伦理、法规和可持续性挑战。 --- 目标读者: 微生物学家、生物化学家、生物工程师、环境科学家以及对生命适应性有浓厚兴趣的研究人员和高年级学生。 本书特点: 内容严谨,基于最新的实验数据和理论模型,强调从基础生理机制到工业应用的转化路径,语言专业且富有洞察力。

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