Using Health Data

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出版者:
作者:Grain, Heather/ Procter, Paula
出品人:
页数:304
译者:
出版时间:2009-7
价格:$ 84.69
装帧:
isbn号码:9780729538893
丛书系列:
图书标签:
  • 健康数据
  • 数据分析
  • 医疗信息学
  • 公共卫生
  • 数据科学
  • 电子健康记录
  • 健康信息技术
  • 生物统计学
  • 数据隐私
  • 医疗大数据
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具体描述

《医健数据:挖掘、应用与未来展望》 内容概述: 本书是一部深入探讨医疗健康数据(Health Data)的综合性著作,旨在为读者提供一个全面而系统的理解。从数据的来源、收集、清洗、存储,到先进的分析技术、隐私保护机制,再到数据在临床实践、公共卫生、药物研发、个性化医疗等领域的广泛应用,本书层层递进,脉络清晰。本书不仅涵盖了传统的数据分析方法,更重点关注了机器学习、深度学习等新兴技术在医疗健康领域的突破性应用,如疾病预测、影像诊断、基因组学分析等。同时,本书也深刻剖析了数据应用过程中面临的伦理、法律和社会挑战,并对未来医健数据的发展趋势进行了前瞻性探讨。 第一部分:医健数据的基石——采集、整合与管理 第一章:医健数据的多元维度与采集渠道 本章将详细阐述“医健数据”这一概念的广度和深度。我们将首先界定医健数据的范畴,它远不止是传统的电子病历(EHR)和医学影像,还包括但不限于: 临床数据: 电子病历(EHR/EMR): 涵盖患者的既往病史、现病史、诊断、治疗方案、用药记录、手术记录、生命体征(血压、心率、体温等)、过敏史、家族史等。我们将深入探讨EHR的数据结构、标准化(如HL7、FHIR)的重要性及其面临的挑战,如数据录入的非结构化、信息孤岛等。 实验室检测数据: 包括血液、尿液、组织等的各项生化指标、微生物学检查、病理学报告等。我们将讨论这些数据的格式、质量控制以及如何将其转化为可分析的结构化信息。 医学影像数据: 如X光、CT、MRI、PET、超声等图像数据,以及相关的影像报告。我们将探讨DICOM标准,以及影像数据在AI辅助诊断中的潜力。 出院小结与手术记录: 这些非结构化文本信息往往包含着丰富的临床决策和过程细节。 处方与药物记录: 详细记录患者用药信息,对于药物依从性、药物相互作用研究至关重要。 护理记录: 包含患者的日常护理、康复情况、心理状态等,提供更全面的患者画像。 基因组学与蛋白质组学数据: 基因测序数据(DNA/RNA): 包括全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)、转录组测序(RNA-Seq)等,为理解疾病的遗传基础、识别潜在的药物靶点提供关键信息。 蛋白质组学数据: 分析蛋白质表达水平、修饰等,揭示疾病发生发展的分子机制。 可穿戴设备与移动健康(mHealth)数据: 可穿戴设备: 如智能手表、健康手环,实时监测心率、睡眠模式、活动量、血氧饱和度、心电图(ECG)等。 移动健康应用: 用户主动记录的饮食、运动、体重、情绪等数据,以及通过智能手机摄像头、麦克风采集的健康相关信息。 公共卫生数据: 疾病监测与流行病学数据: 如传染病报告、慢性病发病率、死亡率、疫苗接种率等,用于疾病防控和政策制定。 人口健康普查数据: 了解特定人群的健康状况和风险因素。 环境暴露数据: 空气质量、水质、地理位置等,分析环境因素与健康的关系。 社会经济与行为数据: 社会经济地位(SES): 如收入、教育程度、职业等,与健康结果密切相关。 生活方式信息: 烟酒习惯、饮食偏好、体育活动频率、睡眠习惯等。 地理信息系统(GIS)数据: 分析健康热点区域、医疗资源分布等。 医疗保险与支付数据: 理赔数据: 记录医疗服务的使用情况、费用支出等,可用于欺诈检测、成本效益分析。 我们将深入探讨这些数据来源的特点、采集方法、潜在的偏倚,以及如何通过多源异构数据的整合来构建更完整、更准确的患者画像。 第二章:数据质量与治理:构建可信的医健数据基础 本章聚焦于医健数据生命周期中至关重要的一个环节——数据质量。高质量的数据是所有后续分析和应用的前提。我们将深入探讨: 数据清洗与预处理: 缺失值处理: 识别、量化和处理缺失数据,包括删除、插补(均值、中位数、模型预测等)等方法。 异常值检测与处理: 识别并处理不符合逻辑或超出合理范围的数据点,如基于统计学方法(Z-score, IQR)、可视化方法、机器学习算法(Isolation Forest, DBSCAN)等。 数据标准化与归一化: 将不同量纲的数据转换到统一的尺度,以避免某些特征对模型产生过大的影响,如Min-Max Scaling, Standardization (Z-score normalization)。 数据转换: 对数据进行必要的转换,如对数转换、多项式特征生成等,以满足模型假设或提高模型性能。 重复数据处理: 识别并合并重复的记录,确保数据的一致性。 格式统一: 将不同来源、不同格式的数据统一为标准化的格式,便于后续处理。 数据集成与互操作性: 数据模型设计: 如何设计统一的数据模型,以整合来自不同系统的数据。 标准与协议: 强调HL7(Health Level Seven)、FHIR(Fast Healthcare Interoperability Resources)、DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)等标准在实现数据互操作性中的作用。 ETL(Extract, Transform, Load)流程: 设计和实现高效的数据提取、转换和加载流程,以将分散的数据整合到数据仓库或数据湖中。 元数据管理: 数据字典与数据目录: 建立完善的元数据管理体系,清晰记录数据的来源、定义、业务规则、质量指标等,提高数据的可理解性和可追溯性。 数据血缘(Data Lineage): 追踪数据从源头到最终应用的完整路径,对于审计、故障排查和合规性至关重要。 数据治理框架: 数据所有权与责任: 明确数据的拥有者和管理者,以及各方的职责。 数据安全与访问控制: 制定严格的数据访问策略和权限管理机制,确保数据安全。 数据质量监控与评估: 建立持续的数据质量监控机制,定期评估数据质量,并采取纠正措施。 合规性要求: 遵守相关的法律法规,如HIPAA(Health Insurance Portability and Accountability Act)在美国,GDPR(General Data Protection Regulation)在欧洲等。 第三章:安全、隐私与伦理:医健数据应用的生命线 本章将深入探讨医健数据应用中最为敏感和关键的维度:安全、隐私和伦理。忽视这些将可能导致严重的法律后果和信任危机。 数据安全保障: 加密技术: 传输加密: 使用TLS/SSL等协议保护数据在网络传输过程中的安全。 静态加密: 对存储在数据库、文件系统中的敏感数据进行加密。 同态加密(Homomorphic Encryption): 允许在加密数据上进行计算,而无需解密,是未来隐私计算的重要方向。 访问控制与身份认证: 实施多因素认证(MFA)、基于角色的访问控制(RBAC)、最小权限原则,确保只有授权人员才能访问敏感数据。 数据脱敏与匿名化: 去标识化(De-identification): 移除或修改直接和间接识别信息的步骤,如删除姓名、地址、身份证号等。 假名化(Pseudonymization): 用假名替换真实身份信息,当需要关联时,可以通过密钥恢复真实身份。 数据泛化(Generalization): 将具体数值替换为范围,如年龄替换为年龄段。 差分隐私(Differential Privacy): 在数据集中添加少量噪声,使得攻击者难以通过查询数据集来推断特定个体的信息。 安全审计与日志记录: 详细记录所有数据访问和操作日志,用于事后追溯和安全审计。 漏洞管理与入侵检测: 定期进行安全漏洞扫描,部署入侵检测/防御系统(IDS/IPS)。 隐私保护法规与合规性: 全球主要法规解析: 深入解读HIPAA、GDPR、中国《个人信息保护法》等关键法规的要求,包括数据主体的权利(知情权、访问权、更正权、删除权等)、数据处理的原则(合法、正当、必要、诚信)、数据跨境传输的规定等。 隐私影响评估(PIA): 在新系统或新应用上线前,进行隐私风险评估,识别和缓解潜在的隐私泄露风险。 知情同意机制: 如何设计和实施有效的知情同意流程,确保患者充分理解其数据的收集、使用和共享方式。 伦理考量与社会责任: 公平性与偏见: 算法偏见: 分析数据和算法可能存在的偏见,如基于种族、性别、社会经济地位的偏差,可能导致不公平的医疗决策。 数据代表性: 讨论数据集中不同人群的代表性不足问题,如何影响模型的泛化能力和公平性。 透明度与可解释性(Explainability): 黑箱模型问题: 为什么AI模型会做出某个预测?如何向患者和医生解释AI的决策过程。 可解释AI(XAI)技术: LIME, SHAP等方法在医疗领域的应用。 数据所有权与自主权: 患者对其个人健康数据是否拥有最终的控制权?如何实现患者对数据的真正掌控? 数据商业化与利益分配: 在利用数据创造商业价值的同时,如何公平地回馈数据贡献者(患者)? 算法的误用与滥用: 警惕AI技术在医疗领域被用于歧视、不当推销等负面用途。 第二部分:医健数据的智能驱动——分析、洞察与预测 第四章:医健数据的传统分析方法与统计建模 本章将回顾和介绍在医健数据分析领域长期发挥作用的经典统计方法,这些方法仍然是理解数据、发现模式的基础。 描述性统计: 集中趋势度量: 均值、中位数、众数,用于描述数据的中心位置。 离散程度度量: 方差、标准差、极差、四分位数,用于度量数据的分散程度。 分布特征: 偏度、峰度,用于描述数据的形状。 频率分布与百分位数: 用于理解数据的分布情况。 推断性统计: 假设检验: t检验(t-test): 比较两组均值是否存在显著差异。 方差分析(ANOVA): 比较三组或更多组均值是否存在显著差异。 卡方检验(Chi-squared test): 分析分类变量之间的关联性。 置信区间(Confidence Interval): 估计总体参数的范围。 回归分析: 线性回归(Linear Regression): 预测连续型因变量与一个或多个自变量之间的关系,如预测血压与年龄、体重之间的关系。 逻辑回归(Logistic Regression): 预测二元或多元分类结果,如预测患病风险(是/否),是临床风险预测的基石。 泊松回归(Poisson Regression): 适用于计数数据,如预测某个时间段内的就诊次数。 关联性分析: 相关系数(Correlation Coefficient): 度量两个变量之间线性关系的强度和方向(如Pearson相关系数)。 列联表分析(Contingency Table Analysis): 用于分析两个或多个分类变量之间的关系。 生存分析(Survival Analysis): Kaplan-Meier曲线: 估计生存概率随时间变化的函数。 Cox比例风险模型(Cox Proportional Hazards Model): 分析影响生存时间(如疾病复发、死亡)的协变量。 聚类分析(Clustering Analysis): K-Means算法: 将数据点分成k个簇,使簇内方差最小化。 层次聚类(Hierarchical Clustering): 构建数据点的层次结构,可用于识别患者亚群。 降维技术(Dimensionality Reduction): 主成分分析(PCA): 识别数据中最具变异性的方向,将高维数据映射到低维空间。 因子分析(Factor Analysis): 探索潜在的隐藏因子。 本章将通过具体的医学案例,演示如何应用这些统计方法来回答临床问题,例如研究某种治疗方法的有效性,识别疾病的危险因素等。 第五章:人工智能驱动的医健数据分析:机器学习与深度学习 本章是本书的重中之重,将聚焦于如何利用人工智能,特别是机器学习和深度学习,来解锁医健数据的巨大潜能。 机器学习基础: 监督学习(Supervised Learning): 分类算法: 支持向量机(SVM): 用于分类和回归,在高维空间寻找最优分类超平面。 决策树(Decision Trees): 直观易懂,可用于分类和回归,易于解释。 随机森林(Random Forest): 集成学习方法,通过构建多个决策树并投票来提高预测精度和鲁棒性。 梯度提升(Gradient Boosting, 如XGBoost, LightGBM): 序列化模型,通过迭代地纠正前一模型的错误来提升性能。 回归算法: (在前一章已介绍,此处强调AI应用) 无监督学习(Unsupervised Learning): 聚类算法: (在前一章已介绍,此处强调AI应用,如客户细分、患者分型) 关联规则挖掘(Association Rule Mining): (如Apriori算法),发现数据项之间的有趣关联,用于分析药物联合使用、疾病共发现等。 降维算法: (如PCA,t-SNE用于可视化) 半监督学习(Semi-Supervised Learning): 在少量标记数据和大量未标记数据上进行训练,适用于医疗数据标注成本高昂的情况。 强化学习(Reinforcement Learning): (在特定场景,如个性化治疗方案优化、机器人手术导航等)。 深度学习在医健领域的革命性应用: 卷积神经网络(CNN): 医学影像分析: 自动识别和分割病灶(如肺结节、肿瘤),辅助医生进行诊断,如在放射学、病理学中的应用。 医学图像生成: 如生成合成医学图像以扩充训练数据集。 循环神经网络(RNN)与长短期记忆网络(LSTM): 电子病历(EHR)序列分析: 预测疾病进展、患者状态变化、药物反应等。 自然语言处理(NLP): 从非结构化的临床文本(如病程记录、报告)中提取关键信息、生成摘要、实现智能问答。 Transformer模型(如BERT, GPT系列): 更强大的NLP能力: 在医学文本理解、摘要生成、信息抽取等方面取得突破。 多模态学习: 结合文本、影像、基因组学等多种数据类型进行联合分析。 特征工程与模型优化: 领域知识的融合: 如何将医学专家的知识融入特征工程。 自动化特征工程(AutoFE): 利用算法自动生成和选择特征。 模型评估与选择: 关注医疗领域的特定评估指标(如敏感性、特异性、AUC、F1-score),以及模型的可解释性。 超参数调优: 网格搜索、随机搜索、贝叶斯优化等。 第六章:自然语言处理(NLP)在医健数据中的深度挖掘 本章将专门探讨自然语言处理(NLP)技术如何从海量的非结构化文本数据中提取有价值的信息,这些信息往往是结构化数据无法完全捕捉的。 NLP基础技术: 分词(Tokenization): 将文本分割成词语或词组。 词性标注(Part-of-Speech Tagging, POS): 识别词语的语法类别(名词、动词、形容词等)。 命名实体识别(Named Entity Recognition, NER): 识别文本中的特定实体,如疾病名称、药物、症状、解剖部位、医生姓名等。 关系抽取(Relation Extraction): 识别实体之间的关系,如“药物A用于治疗疾病B”。 情感分析(Sentiment Analysis): 分析文本表达的情感倾向,可用于分析患者的反馈。 医学NLP的挑战与解决方案: 医学术语的复杂性: 同义词、缩写、术语变体、专业领域语言。 上下文依赖性: 相同词语在不同语境下意义不同。 文本的结构化: 如何处理非标准化的病历格式。 医学本体(Medical Ontologies)与知识图谱(Knowledge Graphs): 利用UMLS、SNOMED CT等医学本体来规范医学术语,构建医学知识图谱,增强NLP模型的理解能力。 NLP在医健领域的具体应用: 电子病历(EHR)信息抽取: 自动化提取患者的既往病史、家族史、过敏史、家族史、用药情况、诊断结果等,形成结构化的患者画像。 报告自动化生成与摘要: 自动生成医学报告的初稿,或对长篇报告进行摘要。 临床决策支持: 从文献、病历中提取相关信息,为医生提供诊疗建议。 药物警戒(Pharmacovigilance): 从社交媒体、不良事件报告中发现潜在的药物不良反应。 患者反馈分析: 分析患者在论坛、社交媒体上的评论,了解其对治疗、服务的满意度。 编码辅助: 辅助编码员进行疾病和操作的编码(如ICD编码)。 文献挖掘与知识发现: 从大量医学文献中发现新的疾病关联、治疗方法、药物靶点。 第三部分:医健数据的落地实践——应用、挑战与未来 第七章:医健数据在临床决策与精准医疗中的应用 本章将详细阐述医健数据如何赋能临床实践,提升医疗质量,迈向更加精准的医疗时代。 临床决策支持系统(CDSS): 早期预警系统: 通过分析患者实时数据,预测病情恶化风险(如败血症、急性肾损伤),及时发出警报。 诊断辅助: 利用AI模型分析患者症状、体征、检验结果,提供可能的诊断列表。 治疗方案推荐: 基于患者个体情况和循证医学证据,推荐最佳治疗方案。 药物相互作用与过敏预警: 自动检测潜在的药物相互作用和药物过敏风险。 精准医疗(Precision Medicine): 基因组学与个体化治疗: 癌症基因组学: 分析肿瘤的基因突变,指导靶向治疗和免疫治疗。 罕见病诊断: 利用全基因组测序识别罕见遗传病的根源。 基于大数据的个体化风险评估: 综合考虑基因、环境、生活方式等因素,评估个体患某种疾病的风险,并制定预防策略。 药物反应预测: 基于个体基因组、生理特征,预测患者对特定药物的反应(疗效与副作用),实现个体化用药。 个性化健康管理: 根据个体的健康状况和风险,提供定制化的健康建议和生活方式指导。 医学影像AI的应用: 疾病筛查: 自动识别X光片、CT、MRI中的异常病灶,提高筛查效率。 定量分析: 对病灶进行精确测量和量化,辅助评估病情发展。 三维重建与可视化: 帮助医生更直观地理解解剖结构和病灶。 远程医疗与虚拟健康: 远程监测: 通过可穿戴设备和远程传感器,持续监测患者的健康状况,实现居家康复和慢病管理。 虚拟诊疗: 利用视频、AI问诊等方式,提供便捷的医疗服务。 第八章:医健数据在公共卫生与流行病学中的作用 本章将探讨医健数据如何帮助我们更好地理解和应对公共健康挑战。 疾病监测与预警: 疫情追踪与预测: 分析社交媒体、搜索趋势、医疗记录等数据,实时监测传染病的传播,预测疫情发展趋势。 慢性病管理: 识别慢性病的高危人群,监测疾病负担,评估干预措施的效果。 疫苗接种效力评估: 分析疫苗接种数据与疾病发病率,评估疫苗的真实世界效果。 流行病学研究: 危险因素识别: 利用大数据分析,发现新的疾病危险因素,如环境污染、职业暴露、生活习惯等。 疾病传播模型构建: 结合人口流动、社交网络等数据,构建更精确的疾病传播模型。 健康公平性研究: 分析不同社会经济群体、地理区域的健康差异,揭示健康不平等的原因。 政策制定与资源分配: 医疗资源规划: 基于人口健康需求和疾病分布,优化医疗资源的配置,如医院床位、医护人员的分配。 公共卫生干预效果评估: 科学评估健康教育、疾病预防项目等公共卫生干预措施的成效。 健康经济学分析: 利用数据进行成本效益分析,指导公共卫生投资决策。 第九章:医健数据在药物研发与生命科学领域的贡献 本章将重点介绍医健数据如何加速药物研发进程,推动生命科学研究的创新。 新药发现与靶点识别: 基因组学与药物靶点: 分析基因数据,识别与疾病相关的潜在药物靶点。 药物重定位(Drug Repurposing): 利用现有药物数据,发现其治疗其他疾病的潜力。 文献挖掘与知识图谱: 从海量文献中发现药物-疾病-基因之间的潜在关联。 临床试验优化: 患者招募: 利用EHR数据,快速、精准地识别符合临床试验要求的患者。 试验设计: 基于历史数据,优化试验方案,提高成功率。 疗效与安全性评估: 实时监测临床试验数据,评估药物的有效性和安全性。 真实世界证据(RWE)的应用: 将真实世界数据(如EHR、保险理赔数据)用于支持药物的上市申请和上市后研究。 药物不良反应监测(Pharmacovigilance): 主动监测: 利用NLP技术分析电子病历、社交媒体、不良事件报告等,主动发现潜在的药物不良反应。 风险评估: 对已知的药物风险进行量化评估,并制定相应的管理策略。 生物标记物发现: 液体活检: 利用血液、尿液等体液中的生物标志物,实现早期诊断、预后评估和疗效监测。 多组学整合分析: 结合基因组学、蛋白质组学、代谢组学等数据,发现更全面的生物标记物。 第十章:医健数据应用的挑战、伦理困境与未来展望 本章将总结前文讨论的挑战,并对医健数据的未来发展进行展望。 当前面临的挑战: 技术壁垒: 数据集成难度大、算法的复杂性、计算资源需求。 数据孤岛: 不同医疗机构、不同系统之间数据难以共享。 数据标准化与互操作性: 缺乏统一的数据标准和接口。 人才短缺: 缺乏既懂医学又懂数据科学的复合型人才。 高昂的实施成本: 数据基础设施建设、AI模型的开发与部署。 监管与合规性: 复杂的法律法规需要持续关注和适应。 深入探讨伦理困境: 算法的黑箱问题与责任归属: 当AI出错时,谁来承担责任? 数据滥用与商业化: 如何平衡数据价值挖掘与个人隐私保护? 数字鸿沟与医疗公平: 如何确保所有人都能够从医健数据驱动的医疗进步中受益? AI在伦理敏感领域的应用: 如基因编辑、生命延续技术等。 未来展望: 联邦学习(Federated Learning): 在不共享原始数据的情况下,进行分布式模型训练,有效解决数据隐私问题。 可信AI(Trustworthy AI): 关注AI的安全性、公平性、透明度、可解释性。 知识图谱的深入应用: 构建更全面、动态的医学知识图谱,赋能更智能的决策。 AI驱动的自动化诊断与治疗: 实现更高程度的医疗自动化,解放医护人员。 个性化健康管理与疾病预防: 从“治已病”向“治未病”转变。 人机协作的新模式: AI成为医生的智能助手,而非替代者。 全球数据共享与协同创新: 建立国际合作框架,共同应对全球健康挑战。 数据驱动的医疗生态系统: 构建集数据、技术、应用、服务于一体的智慧医疗生态。 本书旨在为研究人员、医疗从业者、政策制定者、科技开发者以及任何对医健数据感兴趣的读者提供一个全面、深入的学习平台,共同探索医健数据的无限可能,为构建更健康、更公平的未来贡献力量。

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