Non-Protein Coding Rnas

Non-Protein Coding Rnas pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Springer-Verlag Berlin and Heidelberg GmbH & Co. KG
作者:Batey, Robert T. 编
出品人:
页数:409
译者:
出版时间:
价格:$ 326.57
装帧:
isbn号码:9783540708339
丛书系列:
图书标签:
  • RNA
  • 非编码RNA
  • 基因调控
  • 生物化学
  • 分子生物学
  • 遗传学
  • 表观遗传学
  • 核酸生物学
  • 生物信息学
  • 癌症研究
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具体描述

This book assembles chapters from experts in the Biophysics of RNA to provide a broadly accessible snapshot of the current status of this rapidly expanding field. The 2006 Nobel Prize in Physiology or Medicine was awarded to the discoverers of RNA interference, highlighting just one example of a large number of non-protein coding RNAs. Because non-protein coding RNAs outnumber protein coding genes in mammals and other higher eukaryotes, it is now thought that the complexity of organisms is correlated with the fraction of their genome that encodes non-protein coding RNAs. Essential biological processes as diverse as cell differentiation, suppression of infecting viruses and parasitic transposons, higher-level organization of eukaryotic chromosomes, and gene expression itself are found to largely be directed by non-protein coding RNAs. The biophysical study of these RNAs employs X-ray crystallography, NMR, ensemble and single molecule fluorescence spectroscopy, optical tweezers, cryo-electron microscopy, and other quantitative tools. This emerging field has begun to unravel the molecular underpinnings of how RNAs fulfill their multitude of roles in sustaining cellular life. The physical and chemical understanding of RNA biology that results from biophysical studies is critical to our ability to harness RNAs for use in biotechnology and human therapy, a prospect that has recently spawned a multi-billion dollar industry.

《蛋白质组学:从基因表达到功能机制的深度探索》 简介 在生命科学的宏伟图景中,蛋白质无疑扮演着至关重要的角色。它们是生命活动的基本执行者,负责几乎所有生物过程的运转。从细胞结构的构建,到信号的传递,再到能量的代谢,无一不依赖于蛋白质的精确运作。然而,仅仅认识到蛋白质的重要性是不够的。要真正理解生命的奥秘,我们需要深入探究蛋白质组学的世界——一个研究构成生物体所有蛋白质的完整集合及其相互作用的领域。 《蛋白质组学:从基因表达到功能机制的深度探索》并非一本关于非编码RNA的著作。相反,它是一本致力于全面解析蛋白质组学前沿研究的百科全书式指南。本书深入浅出地揭示了蛋白质组学如何帮助我们理解基因表达的复杂性,以及这些基因表达最终如何转化为具有特定功能的蛋白质。本书旨在为生命科学领域的科研人员、研究生以及对蛋白质科学充满好奇的学习者提供一套系统、深入且具有前瞻性的知识框架。 本书内容概述 本书的写作初衷,是希望能够系统地梳理蛋白质组学研究的最新进展、关键技术和理论模型,并将其应用于阐明生命过程的根本机制。本书将带领读者踏上一段由基因组信息向功能性蛋白质海洋进发的探索之旅,重点关注蛋白质的产生、修饰、定位、相互作用以及它们如何协同工作以驱动生命系统的运行。 第一部分:蛋白质组学的基石与技术革新 本书的开篇,我们将从蛋白质组学的基本概念和发展历程谈起。我们将详细阐述蛋白质组学与基因组学、转录组学的区别与联系,强调蛋白质作为生命活动直接执行者的独特性。 蛋白质组学的定义与范畴: 明确蛋白质组学的研究对象——即在特定时间、特定条件下,细胞、组织或生物体内的所有蛋白质的集合。我们将探讨蛋白质组学研究的层次,包括单蛋白质鉴定、定量分析、翻译后修饰研究、蛋白质-蛋白质相互作用以及蛋白质复合物分析等。 高通量蛋白质鉴定技术: 重点介绍当前最主流的蛋白质鉴定技术——串联质谱(MS/MS)。我们将详细解析质谱仪的工作原理,以及各种数据采集模式(如数据依赖采集 DDA 和数据非依赖采集 DIA)的优劣。此外,还将讨论液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)联用技术在蛋白质组学研究中的核心地位,以及不同的色谱分离策略如何影响鉴定效率和覆盖度。 蛋白质定量策略: 深入探讨蛋白质定量的多种方法,包括同位素标记法(如 SILAC、iTRAQ、TMT)和非标记定量法。我们将分析这些方法的原理、适用场景、优缺点以及数据分析流程。理解精准的蛋白质定量对于揭示生物过程中的动态变化至关重要。 翻译后修饰(PTMs)的探索: 蛋白质的生物学功能很大程度上取决于其发生的翻译后修饰,如磷酸化、糖基化、泛素化、乙酰化等。本书将详细介绍用于鉴定和定量PTMs的先进技术,包括富集策略、质谱分析技巧以及PTM数据库的应用。我们将通过案例研究,展示PTMs在信号转导、细胞周期调控和疾病发生中的关键作用。 蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的研究: 蛋白质很少孤立地发挥功能,它们通常形成复杂的网络来完成特定的生物学任务。本书将全面介绍研究PPIs的技术,包括体外方法(如酵母双杂交 Y2H、体外 pull-down)和体内方法(如 co-immunoprecipitation Co-IP、邻近标记技术 APEX)。我们还将探讨基于质谱的PPIs研究方法,以及如何构建和分析PPI网络。 蛋白质复合物的解析: 许多蛋白质功能是通过组装成稳定的复合物来实现的。本书将介绍解析蛋白质复合物结构和组成的策略,包括低温电子显微镜(Cryo-EM)、质谱辅助的复合物捕获技术(如 Bio-ID)以及多维度蛋白质组学方法。 第二部分:从基因组到蛋白质组的转化过程 本部分将把视角从蛋白质本身扩展到其产生的生物学过程,重点关注基因表达如何转化为蛋白质,以及这一过程中的调控机制。 基因表达调控的层级: 尽管本书聚焦蛋白质组学,但理解基因表达调控是解读蛋白质组学数据的关键。我们将简要回顾染色质重塑、转录因子结合、RNA剪接、mRNA稳定性以及核糖体翻译等不同层级的基因表达调控机制。 翻译调控与蛋白质合成: 详细阐述翻译过程的分子机制,包括起始、延伸和终止。我们将探讨影响翻译效率和精确性的因素,以及翻译后调控对蛋白质丰度的影响。 蛋白质的折叠、降解与质量控制: 蛋白质的正确三维结构是其发挥功能的前提。本书将介绍分子伴侣在蛋白质折叠过程中的作用,以及泛素-蛋白酶体系统(UPS)在降解错误折叠蛋白质中的关键作用。我们将探讨蛋白质质量控制系统如何维持细胞内蛋白质稳态。 蛋白质的定位与转运: 蛋白质在细胞内的正确定位对其功能至关重要。本书将解析蛋白质靶向和转运的分子机制,包括信号肽识别、转运体作用以及各种细胞器之间的蛋白质运输途径。 第三部分:蛋白质组学在生命科学研究中的应用 本书的第三部分将聚焦蛋白质组学的实际应用,展示其如何推动不同生命科学领域的研究。 疾病机制的解析: 疾病往往伴随着蛋白质组学的异常变化。本书将通过大量案例,展示蛋白质组学如何用于识别疾病生物标志物、揭示致病基因的功能以及探索疾病发生发展的分子机制。我们将重点关注癌症、神经退行性疾病、传染病和代谢性疾病等领域的研究进展。 药物研发与靶点发现: 蛋白质组学在药物研发中扮演着越来越重要的角色。本书将讨论如何利用蛋白质组学技术筛选药物靶点,评估药物疗效,以及理解药物作用机制。 发育生物学与细胞分化: 在发育过程中,细胞经历复杂的形态和功能变化,这背后是蛋白质组的动态重塑。本书将展示蛋白质组学如何帮助理解细胞分化、组织形成以及器官发育的分子调控网络。 微生物组学与宏基因组学: 随着宏基因组学的发展,研究微生物群落中的蛋白质组学(宏蛋白质组学)成为揭示微生物功能的重要手段。本书将探讨宏蛋白质组学在理解微生物相互作用、生态功能以及对宿主健康影响方面的应用。 植物科学与农业应用: 蛋白质组学在提高作物产量、抗逆性以及理解植物生理生化过程等方面具有广泛的应用前景。本书将介绍植物蛋白质组学研究的最新进展,包括胁迫响应、营养调控和病虫害抗性等。 第四部分:蛋白质组学数据分析与挑战 蛋白质组学研究产生海量数据,高效准确的数据分析是解读研究结果的关键。 蛋白质组学数据分析流程: 本书将详细介绍蛋白质组学数据的处理流程,包括原始数据处理、峰检测、肽段比对、蛋白质鉴定、定量分析以及统计学分析。 生物信息学工具与数据库: 介绍常用的蛋白质组学数据分析软件和在线数据库,如 MaxQuant, Spectronaut, Proteome Discoverer, UniProt, STRING 等,并指导读者如何有效利用这些工具。 数据整合与多组学研究: 强调将蛋白质组学数据与其他组学数据(如基因组学、转录组学、代谢组学)整合的重要性,以获得更全面的生物学洞察。 当前挑战与未来展望: 尽管取得了巨大成就,蛋白质组学研究仍面临一些挑战,例如低丰度蛋白质的检测、全景式蛋白质组学覆盖的实现、以及跨实验和跨平台的比较研究。本书将对这些挑战进行探讨,并对蛋白质组学未来的发展方向进行展望,包括人工智能在数据分析中的应用、单细胞蛋白质组学的发展以及其在精准医疗中的潜力。 结论 《蛋白质组学:从基因表达到功能机制的深度探索》以其详实的内容、严谨的逻辑和前沿的视角,为读者提供了一个深入理解蛋白质组学世界的宝贵平台。本书不仅仅是一本技术手册,更是一部关于生命分子机器运转机制的精彩故事。通过本书,读者将能够掌握蛋白质组学的前沿技术,理解其在各个生命科学领域的强大应用潜力,并为未来在该领域的研究和创新奠定坚实的基础。本书旨在激发读者对蛋白质科学的深入思考,共同探索生命的无限可能。

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