Sequence Alignment pdf epub mobi txt 电子书下载 2026

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出版者:

作者:Rosenberg, Michael S. 编

出品人:

页数:360

译者:

出版时间:2009-3

价格:$ 67.80

装帧:

isbn号码:9780520256972

丛书系列:

图书标签:

生物信息学
序列比对
算法
生物学
计算机科学
基因组学
分子生物学
数据分析
进化生物学
计算生物学

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具体描述

The sequencing of the human genome involved thousands of scientists but used relatively few tools. Today, obtaining sequences is simpler, but aligning the sequences - making sure that sequences from one source are properly compared to those from other sources - remains a complicated but underappreciated aspect of comparative molecular biology. This volume, the first to focus on this crucial step in analyzing sequence data, is about the practice of alignment, the procedures by which alignments are established, and more importantly, how the outcomes of any alignment algorithm should be interpreted. Edited by Michael S. Rosenberg with essays by many of the field's leading experts, "Sequence Alignment" covers molecular causes, computational advances, approaches for assessing alignment quality, and philosophical underpinnings of the algorithms themselves.

探索未知：历史长河中的文明交响本书并非一本讲述生物序列比对的学术专著，而是致力于揭示人类文明发展脉络中那些鲜为人知却至关重要的“交汇点”与“共振”。我们旨在超越宏大叙事，深入剖析不同文明、不同时代、不同思想体系之间，那些如同基因序列般潜移默化、深刻影响彼此的联系、碰撞与融合。引言：隐匿的连接，文明的呼吸历史的长河并非由孤立的岛屿组成，而是由无数纵横交错的河流汇聚而成。我们常常关注某个文明的兴衰、某个帝国的崛起，却忽略了在那些波澜壮阔的背后，隐藏着更为精妙的联系。正如生物学家研究DNA序列的相似性来追溯物种的演化关系，本书将以一种全新的视角，去“对齐”人类文明的“序列”，寻找那些在时空中看似遥远，实则血脉相连的印记。我们并非要讲述一个关于“序列”或“对齐”的具体方法论，而是要探讨一种观察历史、理解人类文化基因的方式。那些思想的火花，技术的革新，艺术的表达，甚至习俗的变迁，都在跨越地理、文化、宗教的藩篱时，留下了难以磨灭的痕迹。这些痕迹，如同基因中的突变与同源，共同谱写了人类文明复杂而迷人的交响曲。第一章：思想的基因重组——哲学、宗教与观念的跨文化传播人类的哲学思想和宗教信仰，是塑造文明性格的基石。本书将追溯那些跨越欧亚大陆，甚至远至美洲和非洲的深刻思想的流动。我们不会去分析某一本具体哲学著作的论证过程，也不会对某种宗教教义进行教条式的解读。相反，我们将聚焦于这些思想是如何以一种“基因片段”的形式，在不同文化土壤中落地生根、变异、重组，并催生出新的思想体系。 “东方智慧”的西渐与“西方理性”的东传：探讨古希腊哲学思想对印度哲学、佛教的间接影响，以及佛教思想在传播过程中如何与中国本土哲学（如道家、儒家）相互渗透，催生了禅宗等独具特色的思想流派。同样，我们将审视文艺复兴时期欧洲对古希腊罗马思想的重新发现，以及这种“复兴”背后，可能存在的、更为早期跨文化交流的“基因印记”。宗教的“原型”与“变体”：审视不同宗教在核心叙事、道德准则、宇宙观等方面的相似性，探讨这些相似性是源于人类共同的心理需求，还是早期普世性信仰的遗留。例如，关于创世神话、洪水灭世、救赎与轮回等主题，在不同文明中以何种“序列”出现，又以何种方式“对齐”。启蒙思想的传播与本土化：分析18世纪启蒙思想在中国的传播，以及这些思想如何与中国传统的政治文化相结合，催生出维新变法、辛亥革命等历史事件。我们将关注的是思想传播的“模式”，而非具体文献的翻译与阐释。第二章：技艺的血脉传承——科学、技术与工艺的交流互鉴技术的进步是文明发展的直接动力。本书将不再罗列具体的科学发明或技术突破，而是关注技术知识和工艺诀窍是如何以一种“可遗传”的方式，在不同文明之间流转、学习、模仿与创新。四大发明的跨洋之旅：纸张、印刷术、火药、指南针这四项中国古代的伟大发明，其传播过程及其对世界文明的深远影响，早已是公众熟知。但本书将更侧重于分析，这些技术在传播过程中，是如何被不同文明的社会结构、经济需求和文化背景所“改编”和“重构”的。例如，火药在欧洲如何从炼丹术的副产品，演变为改变战争形态的关键力量。丝绸之路上的“技术基因”交换：除了物质商品的交换，丝绸之路更是重要的技术交流通道。我们将考察古代金属冶炼、纺织、造船、建筑等技艺如何在东西方之间传播，以及这些技术的“组合”与“变异”如何在不同地区催生出新的技术形态。工业革命的“基因图谱”：审视工业革命的发生，并非孤立的欧洲事件。我们将探讨早期科学知识的积累，以及不同文明在应用和发展技术方面的“互补性”。例如，中国古代的某些观察和记录，虽然未直接催生近代科学，却可能为后来的科学发展提供了潜在的“基因素材”。第三章：艺术的共同语言——文学、音乐、绘画与建筑的风格融合艺术是人类情感和精神的独特表达。本书将跳出对具体艺术作品的鉴赏，而是探索艺术风格、表现手法、审美观念在跨文化交流中的“序列比对”与“基因突变”。佛教艺术的“在地化”变奏：探讨佛教造像从印度到中国，再到日本、东南亚的演变过程。佛像的形态、服饰、神态如何随着地域文化的不同而产生“序列上的变异”，但又保留着某种“原型”的特征。东西方绘画技法的“借用”与“创新”：分析中国画的写意精神与欧洲油画的写实技巧在近代艺术中的相互影响。例如，印象派画家如何从日本浮世绘中汲取灵感，以及中国画的笔墨韵味如何渗透到某些西方现代画家的作品中。建筑风格的“混血”与“新生”：审视世界各地的历史建筑，会发现许多“混血”的风格。例如，伊斯兰建筑的拱券与中国传统建筑的斗拱如何在某些地区巧妙结合；西方古典建筑风格如何在殖民时期影响了亚洲和非洲的城市景观。本书将关注这些风格融合背后的“基因”交换与“重组”过程。第四章：社会生活的“模式”识别——习俗、制度与生活方式的相互影响人类社会的组织形式、生活习惯和价值观念，同样存在着跨文化的“模式”和“序列”。本书将侧重于识别和分析这些社会层面的“基因”交换，而非对具体历史事件进行详细描述。 “礼”与“法”的变奏：探讨中国古代的“礼”在中国历史不同时期以及对周边文化的影响，以及西方“法治”思想在中国近代社会的引入和本土化过程。这些看似不同的社会规范，在人类社会治理的“基因层面”是否存在某种共通性。饮食、服饰与节日文化的“流变”：观察不同文化背景下，食物的搭配、服装的款式、节日的庆祝方式如何相互影响。例如，香料之路如何改变了欧洲的饮食习惯；丝绸如何改变了世界的服饰风貌。城市规划与社区生活的“基因”痕迹：审视不同文明的城市布局、街道设计、公共空间的使用方式，以及这些模式是如何在跨文化交流中被借鉴、改造和传播的。结论：文明的DNA，未来发展的密码通过这种“序列比对”的视角，我们得以窥见人类文明发展背后更为深层、更为精妙的逻辑。那些看似独立的文明，实际上共享着一套复杂而动态的“基因库”。理解这些“基因”的起源、传播、变异与重组，对于我们认识当下、展望未来，具有至关重要的意义。本书的价值不在于提供一套解决具体历史谜题的“工具”，而在于启发一种看待历史、理解人类群体的方式。我们相信，通过挖掘和解读这些隐匿的连接，我们可以更深刻地理解人类文明的韧性、创造力与多样性，并从中汲取智慧，去应对未来可能出现的挑战。这并非对“序列”或“对齐”方法的具体阐述，而是对文明本身“基因”层面的探索与思考。本书邀您一同踏上一场跨越时空的思想之旅，去发现那些连接你我、连接过去与未来的，看不见的“文明DNA”。