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The Phylogenetic Handbook

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Lemey, Philippe (EDT)/ Salemi, Marco (EDT)/ Vandamme, Anne-Mieke (EDT) 作者
Cambridge University Press
译者
2009-4-20 出版日期
750 页数
USD 58.00 价格
Paperback
丛书系列
9780521730716 图书编码

The Phylogenetic Handbook 在线电子书 图书标签: 进化  Evolution  计算生物学  生物  软件  系统发生分析  研究  手册   


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发表于2024-11-22


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The Phylogenetic Handbook 在线电子书 图书描述

The Phylogenetic Handbook is a broad, hands on guide to theory and practice of nucleotide and protein phylogenetic analysis. This second edition includes six new chapters, covering topics such as Bayesian inference, tree topology testing and the impact of recombination on phylogenies, as well as a detailed section on molecular adaptation. The book has a stronger focus on hypothesis testing than the previous edition, with more extensive discussions on recombination analysis, detecting molecular adaptation and genealogy-based population genetics. Many chapters include elaborate practical sections, which have been updated to introduce the reader to the most recent versions of sequence analysis and phylogeny software, including BLAST, FastA, Clustal, T-coffee, Muscle, DAMBE, Tree-puzzle, Phylip, MEGA, PAUP*, IQPNNI, CONSEL, ModelTest, Prottest, PAML, HYPHY, MrBayes, BEAST, LAMARC, SplitsTree, and RDP. Many analysis tools are described by their original authors, resulting in clear explanations that constitute an ideal teaching guide for advanced-level undergraduate and graduate students.

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