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The Phylogenetic Handbook

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Lemey, Philippe (EDT)/ Salemi, Marco (EDT)/ Vandamme, Anne-Mieke (EDT) 作者
Cambridge University Press
譯者
2009-4-20 出版日期
750 頁數
USD 58.00 價格
Paperback
叢書系列
9780521730716 圖書編碼

The Phylogenetic Handbook 在線電子書 圖書標籤: 進化  Evolution  計算生物學  生物  軟件  係統發生分析  研究  手冊   


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發表於2024-11-25

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The Phylogenetic Handbook 在線電子書 圖書描述

The Phylogenetic Handbook is a broad, hands on guide to theory and practice of nucleotide and protein phylogenetic analysis. This second edition includes six new chapters, covering topics such as Bayesian inference, tree topology testing and the impact of recombination on phylogenies, as well as a detailed section on molecular adaptation. The book has a stronger focus on hypothesis testing than the previous edition, with more extensive discussions on recombination analysis, detecting molecular adaptation and genealogy-based population genetics. Many chapters include elaborate practical sections, which have been updated to introduce the reader to the most recent versions of sequence analysis and phylogeny software, including BLAST, FastA, Clustal, T-coffee, Muscle, DAMBE, Tree-puzzle, Phylip, MEGA, PAUP*, IQPNNI, CONSEL, ModelTest, Prottest, PAML, HYPHY, MrBayes, BEAST, LAMARC, SplitsTree, and RDP. Many analysis tools are described by their original authors, resulting in clear explanations that constitute an ideal teaching guide for advanced-level undergraduate and graduate students.

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