Introduction to Proteomics

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出版者:
作者:Liebler, Daniel C.
出品人:
页数:220
译者:
出版时间:
价格:$ 44.64
装帧:
isbn号码:9781588297785
丛书系列:
图书标签:
  • 蛋白质组学
  • 生物化学
  • 分子生物学
  • 蛋白质分析
  • 生物技术
  • 生命科学
  • 医学
  • 实验技术
  • 蛋白质功能
  • 生物信息学
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具体描述

好的,以下是一本名为《生物大分子结构与功能》的图书简介,它不包含《Introduction to Proteomics》中的内容,并且力求详细和自然: --- 图书简介:生物大分子结构与功能 书名: 生物大分子结构与功能 (Structure and Function of Biological Macromolecules) 作者: [此处可填写真实的作者姓名或学术团体] 出版社: [此处可填写真实的学术出版社名称] ISBN: [此处可填写真实的ISBN] 导言:生命的基石与信息的载体 生命现象的复杂性植根于其分子层面精确而有序的运作。在所有已知生命形式中,四类核心的生物大分子——核酸、蛋白质、碳水化合物和脂质——构成了生命的结构支架、信息蓝图、催化引擎以及能量储存库。它们不仅是构成细胞的原材料,更是决定生命体活动性、适应性和遗传性的根本要素。 《生物大分子结构与功能》旨在为生命科学、生物化学、分子生物学乃至生物工程领域的研究人员、高级本科生及研究生提供一个全面、深入且侧重于结构-功能关系的参考框架。本书摒弃了对特定分离技术或大规模组学数据的简单罗列,而是将焦点紧密锁定在这些宏观分子如何在原子和亚原子层面实现其生物学使命上。 本书的叙事逻辑遵循从结构到功能、从简单基元到复杂系统的递进路径,旨在揭示自然界在分子层面上所展现出的优雅与效率。 第一部分:遗传信息的存储与传递——核酸的几何学 核酸是生命的遗传物质,其功能紧密依赖于其独特的双螺旋结构以及由碱基对序列决定的信息编码能力。 第一章:核酸的基本化学计量学与拓扑结构 本章深入探讨了核苷酸的结构特征,包括戊糖的构象异构(如C2'-内旋与外旋)如何影响磷酸二酯键的刚性和DNA的整体几何形态。我们将详尽分析A型、B型和Z型DNA在不同水合环境和离子强度下的构象转换,并论述RNA在形成发夹结构、茎环结构及假结结构中对单链缠绕的复杂影响。我们特别关注核酸的二级和三级结构如何影响其与核蛋白复合物的相互作用。 第二章:核酸的结构稳定性与动力学 本章着重于描述核酸双螺旋的熔解与退火过程。通过热力学和光谱学方法(如紫外吸收滴定和圆二色谱),我们将量化碱基堆积力、氢键作用对体系稳定性的贡献。此外,我们将讨论DNA拓扑异构酶(如拓扑异构酶I和II)如何通过精确控制DNA的缠绕度(Linking Number)来解决复制和转录过程中产生的超螺旋应力,并强调这些酶的催化机制依赖于瞬时的共价键断裂和重接。 第三章:核酸的表观遗传修饰与结构重塑 超越经典的Watson-Crick配对,本部分探讨了化学修饰对核酸功能的影响。我们将细致分析DNA甲基化(5-mC)、羟甲基化以及胞嘧啶的脱氨作用如何改变局部结构的柔韧性和染色质的可及性。在RNA领域,我们将聚焦于腺苷到肌苷(A-to-I)的编辑以及假尿嘧啶的形成,阐述这些修饰如何影响tRNA的正确识别和mRNA的翻译效率。 第二部分:催化、运动与识别——蛋白质的折叠与机器 蛋白质作为执行细胞功能的主要分子,其功能性完全取决于其三维结构。本部分将结构解析的视角聚焦于氨基酸序列如何精确地折叠成具有特定活性中心的复杂机器。 第四章:氨基酸残基的化学特性与主链的构象空间 本章从化学角度出发,分类讨论了20种标准氨基酸侧链的极性、电荷、疏水性及其在水溶液中的行为。重点分析了肽键的共振结构对主链构象(Phi和Psi角)的限制,并详细阐述了Alpha螺旋、Beta折叠和无规卷曲的形成驱动力,包括侧链间的范德华作用和主链的氢键网络。 第五章:蛋白质折叠的势能面与分子伴侣的作用 蛋白质的正确折叠是一个受限且快速的过程,本书将从统计力学角度解析折叠的势能面景观,包括中间体(Molten Globules)的性质。我们将深入探讨分子伴侣(如GroEL/GroES系统和Hsp70家族)如何通过特异性识别未折叠或错误折叠的疏水性残基,提供隔离环境(Anfinsen笼)以促进正确折叠,并讨论伴侣蛋白本身ATP水解驱动的循环机制。 第六章:酶促反应的机制与活性中心的几何设计 本章专注于酶的催化效率。我们不进行蛋白质组学分析,而是聚焦于经典酶的模型,如胰蛋白酶原、溶菌酶和碳酸酐酶。我们将细致地分解活性中心的几何排列,讨论酸碱催化、共价催化以及金属离子辅助催化的具体步骤。特别是对金属酶(如锌指结构)中配位几何对氧化还原电位的调控进行深入的结构阐释。 第七章:多蛋白复合体的动态装配与分子开关 生命活动常依赖于大型分子机器的协同作用。本部分将分析肌球蛋白-肌动蛋白相互作用(机械能转化)、核糖体(肽键形成)以及信号转导通路中受体与效应器的衔接。我们将探讨这些复合体如何通过构象耦合(Allosteric Coupling)实现信息的传递和运动的产生,重点关注结构域(Domain)之间的相对运动在分子开关激活中的核心作用。 第三部分:能量的封存与细胞膜的屏障——脂质与碳水化合物的结构角色 生命体的结构和能量储备同样依赖于非聚合物大分子,尽管它们不直接携带遗传信息,但对细胞的完整性与稳态至关重要。 第八章:脂质的双层膜结构与膜蛋白的嵌合 本章详细描述了不同极性头基(如磷脂酰胆碱、磷脂酰丝氨酸)和脂肪酸链长度如何影响脂质双分子层的流动性、曲率和相变温度。我们将分析脂质筏的形成机制,并结合X射线晶体学和冷冻电镜数据,阐述跨膜蛋白如何通过疏水区段与脂质环境精确匹配,实现稳定的嵌入和选择性离子通道的构建。 第九章:碳水化合物的立体化学与糖缀合物的识别功能 碳水化合物的复杂性源于其多羟基结构和成环的多样性。本章侧重于多糖(如糖原、淀粉)的线性/分支结构如何影响其能量储存的效率。更重要的是,我们将探讨糖蛋白和糖脂上寡糖链的非模板化合成如何产生独特的“糖组”(Glycocalyx),以及细胞如何通过C型凝集素等受体识别这些特定的糖结构进行细胞间粘附和免疫应答。 结论:结构生物学的前沿视野 《生物大分子结构与功能》通过严谨的结构分析,为理解生命的分子机制提供了坚实的基础。本书强调,任何生物学功能的解释,最终都必须回归到分子在三维空间中的精确排列与相互作用。本书不涉及后期的蛋白质组学分析方法学,而是专注于解析那些经过数亿年进化筛选而确立的、决定了生命核心功能的经典结构原理。本书旨在培养读者对分子细节的洞察力,为未来在生物物理学和结构生物学领域进行深入研究做好准备。

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