Data Mining, Systems Analysis and Optimization in Biomedicine

Data Mining, Systems Analysis and Optimization in Biomedicine pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Seref, Onur (EDT)
出品人:
页数:328
译者:
出版时间:2007-11
价格:$ 164.98
装帧:
isbn号码:9780735404670
丛书系列:
图书标签:
  • 数据挖掘
  • 生物医学
  • 系统分析
  • 优化
  • 机器学习
  • 人工智能
  • 医疗信息学
  • 生物信息学
  • 算法
  • 数据分析
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具体描述

This book is a collection of a sample of the latest research methods in data mining across diverse fields of biomedicine, neuroscience, engineering, and computer science. The problems and methods discussed in this book will be of great interest to new and established theoreticians and practitioners in these fields and provide them with new directions for research. The book will be required reading for biomedical and industrial engineers, computer scientists, and medical doctors.

生物医学中的数据挖掘、系统分析与优化:理论、方法与实践 图书概述 本书旨在为生物医学领域的研究人员、数据科学家、临床医生以及对交叉学科应用感兴趣的专业人士,提供一个全面、深入且极具实践指导性的参考指南。本书聚焦于生物医学信息学的核心支柱——数据挖掘(Data Mining)、系统分析(Systems Analysis)与优化(Optimization)方法论的融合与应用。我们致力于解析如何利用尖端计算技术和严谨的分析框架,从海量、异构的生物医学数据中提取有意义的知识,构建预测性模型,并设计出高效的干预策略,最终推动精准医疗和生物技术的发展。 本书结构精心设计,从基础理论的奠定,到高级算法的剖析,再到真实的临床与生物学案例研究,层层递进,确保读者不仅掌握“做什么”,更能深刻理解“为什么这样做”以及“如何有效地实施”。我们尤其强调计算模型与生物学现实之间的桥梁构建,力求避免纯粹的理论堆砌,确保每一项技术都有明确的生物医学应用场景。 第一部分:生物医学数据基础与预处理 本部分为后续高级分析奠定坚实的基础,重点在于理解生物医学数据的复杂性、高维度特性以及高质量数据准备的必要性。 第1章:生物医学数据的异构性与挑战 本章详细探讨了当前生物医学数据生态系统的全景,包括基因组学(如全基因组测序数据)、蛋白质组学、代谢组学、电子健康记录(EHRs)、医学影像数据(MRI, CT, 病理切片)以及可穿戴设备产生的时序数据。重点分析了这些数据固有的挑战:稀疏性、噪声、缺失值、批次效应(Batch Effects)以及维度灾难(Curse of Dimensionality)。我们引入了生物统计学视角下的数据质量控制标准,并讨论了在处理这些复杂数据集时需要遵循的伦理和隐私保护法规(如HIPAA和GDPR在数据分析中的体现)。 第2章:数据准备、特征工程与降维技术 高质量的数据分析始于精细的预处理。本章深入讲解了数据清洗、标准化和归一化的技术,特别关注如何处理高通量测序数据的背景校正。核心内容集中在特征工程:如何从原始数据中构建具有生物学意义的特征(例如,从基因表达谱中提取通路富集分数)。随后,系统介绍经典与现代的降维技术,包括主成分分析(PCA)、独立成分分析(ICA)在多组学数据中的应用,以及t-SNE和UMAP在高维可视化中的局限性与优势。 第二部分:生物医学数据挖掘的核心算法 本部分是本书的核心,详细剖析了应用于生物医学领域的数据挖掘算法,强调其在疾病诊断、预后判断和药物发现中的具体应用。 第3章:监督学习:分类与回归在临床决策中的应用 本章聚焦于预测模型构建。详细阐述了逻辑回归在风险评分构建中的基础作用,并深入探讨了支持向量机(SVM)在小样本高维数据分类中的优化策略。重点介绍集成学习方法(Ensemble Methods),包括随机森林(Random Forests)和梯度提升机(Gradient Boosting Machines, GBM),并展示它们如何用于预测肿瘤分级和患者生存期。我们还将讨论神经网络(Neural Networks),特别是多层感知机(MLP)在EHRs数据挖掘中的基础架构。 第4章:无监督学习:聚类与关联规则在表型发现中的作用 无监督学习是探索未知生物学模式的关键工具。本章详细介绍了K-均值聚类(K-Means)和层次聚类(Hierarchical Clustering)在识别疾病亚型(Subtyping)中的应用。深入探讨了高斯混合模型(GMM)在复杂分布数据中的鲁棒性。此外,本书将介绍Apriori算法及其变体,用于发现药物相互作用或临床路径中的关联规则。 第5章:深度学习在复杂生物医学数据处理中的前沿进展 针对医学影像和序列数据的高复杂性,本章专注于深度学习模型的应用。详细解析了卷积神经网络(CNNs)在医学图像分割、病灶检测中的架构(如U-Net在组织病理学中的应用)。对于序列数据,我们探讨了循环神经网络(RNNs)及其变体(LSTM/GRU)在时间序列EHR分析中的潜力。此外,本书将介绍自动编码器(Autoencoders)在特征学习和异常检测方面的应用。 第三部分:系统分析与优化:从模型到干预 本部分将数据挖掘的发现转化为可操作的系统级理解和优化策略,这是实现转化医学的关键环节。 第6章:生物系统建模与网络分析 生物学是一个复杂的相互作用网络。本章侧重于系统生物学的视角,介绍如何构建和分析基因调控网络、蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。讲解图论基础,包括中心性度量(Degree, Betweenness, Eigenvector Centrality)在识别关键生物标志物中的应用。我们将探讨动态系统建模(如常微分方程模型)在模拟细胞信号通路动态行为中的应用。 第7章:优化理论在生物医学资源配置中的应用 优化是提高效率、降低成本的决定性工具。本章将优化理论应用于实际的生物医学场景。重点讲解线性规划(Linear Programming)和整数规划在优化临床试验设计(如样本量分配、受试者招募策略)中的应用。讨论启发式算法,如遗传算法和模拟退火,在解决复杂的、非线性的资源调度问题(如手术室排程、医疗设备维护)中的有效性。 第8章:模型验证、可解释性与临床转化 一个成功的模型必须是可靠且可信的。本章探讨了严格的模型评估框架,包括交叉验证策略、AUC/ROC分析、精确率-召回率曲线的解读。至关重要的是,本书将投入大量篇幅讨论模型可解释性(XAI),介绍LIME和SHAP等技术,如何帮助临床医生理解“黑箱”模型的预测依据,从而建立对AI辅助决策的信任。最后,讨论从实验室发现到临床实践的转化路径(Translation Pathway)中的挑战与机遇。 总结与展望 本书的最终目标是为读者提供一套融汇贯通的知识体系,使他们能够独立设计、执行并评估复杂的生物医学数据分析项目。它不仅是一本算法手册,更是一部连接海量数据与救死扶伤使命的实践指南。通过对数据挖掘、系统分析和优化技术的综合应用,本书力求成为推动下一代精准医疗和生物技术创新的重要参考资料。

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