Genetics and Genomics of Rosaceae

Genetics and Genomics of Rosaceae pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:
作者:Folta, Kevin M. (EDT)
出品人:
页数:654
译者:
出版时间:2009-5
价格:$ 258.77
装帧:
isbn号码:9780387774909
丛书系列:
图书标签:
  • Rosaceae
  • Genetics
  • Genomics
  • Plant Genetics
  • Fruit Genetics
  • Molecular Biology
  • Horticulture
  • Plant Breeding
  • Genome Editing
  • Marker-Assisted Selection
  • Phylogenomics
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具体描述

The Rosaceae Family is represented by approximately 3,000 species of diverse plants, primarily confined to temperate climates. The family has a rich variety of architectural forms and contains herbaceous, tree and shrub species. Many family members are readily recognizable because of their edible seasonal fruits that are prized for their unique flavors, colors and nutritious properties (e.g. apple, strawberry, raspberry, pear, cherry, plum, apricot, pear), as well as familiar ornamentals (e.g. roses) and nuts (e.g. almonds). This book covers progress in recent genomic research among the Rosaceae, grounding this firmly in the historical context of genetic studies and in the application of genomics technologies for crop development. A general introduction precedes summaries of genomics research and applications on a crop by crop basis, each authored by a panel of active researchers in each particular crop. This volume is a considerable value as a resource for workers in the Rosaceae operating at all levels, from research scientists in genetics, genomics and breeding, to graduate and undergraduate students.

植物系统学与进化生物学前沿研究:基于系统发育、基因组与表观遗传学的多尺度解析 本书简介 本书聚焦于植物系统学、进化生物学与群体遗传学的前沿研究领域,旨在为研究人员、研究生及相关领域的专业人士提供一个深入、全面的学术参考。全书内容横跨植物生命史的宏大尺度与分子机制的微观层面,通过整合经典的形态学数据、分子标记以及新兴的基因组学、转录组学和表观遗传学数据,系统阐述了植物多样性起源、物种形成过程、适应性进化机制以及基因组演化规律。 第一部分:植物系统发育与分类学 本部分奠定了理解植物生命树的基础。内容从对传统分类系统的批判性回顾开始,重点阐述了基于分子系统发育(Molecular Phylogenetics)的现代方法论。 第一章:系统发育重建的理论与实践 详细介绍了构建可靠的植物系统发育树所需的基本概念,包括序列数据(核糖体DNA、叶绿体基因、核基因)的选择与处理、进化模型的选择(如GTR、SYM等)、推断方法(如最大简约法、最大似然法、贝叶斯推断)的优势与局限。特别关注了超大型数据集(Phylogenomics)在解决复杂系统发育关系(如早期被子植物分化)中的应用与挑战,包括对基因树与物种树不一致性的处理策略。 第二章:植物界的多样性起源与关键分化事件 本章深入探讨了高等植物(尤其是维管植物)的宏大进化历程。内容涵盖了苔藓植物、蕨类植物、裸子植物和被子植物的系统发育关系。重点分析了被子植物的起源与早期辐射,讨论了对被子植物“隐存期”的系统发育学解释。详细分析了关键的进化节点,如单子叶植物与真双子叶植物的分化、核心真双子叶植物内部的复杂关系,并结合古生物学证据,重建了关键性状(如开花、果实形成)的演化路径。 第三章:核心被子植物的类群分化与分类修订 聚焦于具有重要经济或生态价值的核心被子植物类群,如豆科、菊科、禾本科等。讨论了如何利用多基因组数据解决传统上依赖形态学特征难以区分的近缘类群的分类学难题。本章详细介绍了物种界定的分子证据(如条形码技术在物种识别中的应用),并探讨了不同分类阶元(属、科)的界定标准在现代系统发育学框架下的调整。 第二部分:群体遗传学与物种形成 本部分将研究尺度聚焦于物种内部的遗传变异以及物种形成的驱动力,结合分子数据,揭示隔离与选择如何塑造了当前植物多样性。 第四章:群体遗传学基础与分子标记 系统回顾了群体遗传学的核心理论,包括遗传漂变、基因流、有效群体规模(Ne)的概念。重点介绍了用于群体遗传学分析的分子标记技术,如AFLP、SSR、InDel以及SNP。详述了如何利用这些标记评估群体结构(Structure分析)、检测基因流和隔离机制。 第五章:物种形成模式与生殖隔离机制 本章探讨了植物物种形成的不同路径,包括异域物种形成、同域物种形成以及配子体/孢子体水平的隔离。详细分析了植物特有的生殖隔离机制,如传粉隔离(媒介特化、花粉-柱头不兼容)、合子后隔离。结合群体基因组学数据,识别了驱动隔离的基因组区域(如选择的扫动区域),并讨论了多倍体化在植物快速物种形成中的关键作用。 第六章:适应性进化与环境选择 本部分利用群体基因组学工具(如$d_N/d_S$分析、扫动选择检测、环境关联分析)来解析植物适应特定环境的分子基础。内容涵盖了对气候、海拔梯度、水分胁迫、病原体互作等环境因素的选择信号的识别。重点研究了色素合成、抗逆性相关基因以及次生代谢途径基因的适应性演化。 第三部分:基因组演化与比较基因组学 本部分将视角提升至整个基因组的层面,研究基因组结构的变化、基因家族的扩张与收缩,以及不同植物类群间的比较。 第七章:全基因组重复与基因组重组 详细阐述了植物基因组中普遍存在的全基因组重复(WGD)事件的鉴定、机制及其对植物进化和代谢多样性的影响。讨论了随后的基因丢失、基因对功能化(Neofunctionalization)和亚功能化(Subfunctionalization)的过程。此外,本章还涵盖了转座因子(Transposable Elements, TEs)在驱动基因组大小变化和结构变异中的作用。 第八章:比较基因组学:追踪基因组的演化轨迹 本章的核心在于通过比较不同植物物种的基因组序列,推断保守区域和快速演化区域。内容包括基因组共线性分析、基因家族的扩张与收缩的谱系分析,以及关键功能基因家族(如MADS-box转录因子、抗逆基因)的比较演化研究。通过比较基因组学,重构了关键代谢通路或发育路径的演化历史。 第九章:表观遗传学在植物进化中的角色 本章介绍了植物独特的表观遗传机制,如DNA甲基化、组蛋白修饰和小RNA调控。讨论了表观遗传标记如何在不改变DNA序列的情况下,影响基因表达,并可能导致可遗传的表型变异(表观遗传遗传)。重点关注了表观遗传图谱在不同地理种群间、以及在应对环境胁迫下如何快速响应和固化,从而影响了植物的表观遗传进化。 结论与展望 全书最后总结了当前植物系统学与进化生物学研究的主要成就,并指出了未来研究的方向,包括单细胞组学在解析发育与适应性中的潜力、机器学习在复杂系统发育关系解析中的应用,以及对极端环境植物的基因组学探索。本书旨在激励读者利用跨学科的视角,深入挖掘植物多样性的奥秘。

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