《医学有机化学》的特点主要体现在以下几个方面：（1）根据目前各校基础课学时压缩的现实情况，在保证教材完整性、系统性的基础上，精选教材内容，删除了在中学化学和基础化学中已有的部分内容。
（2）各章内容既保持了有机化学的系统性，又突出了医学有机化学的特色。教材内容的选取充分考虑到21世纪医学人才所需要的有机化学知识，也充分考虑到医科学生学习有机化学的实际情况，力求从医学教育的实际出发，深入浅出，对基本概念、基本理论的讲述通俗易懂，每章配置了适当习题以帮助学生加深理解和巩固所学内容。
（3）本教材的编者大多数是从事多年有机化学教学工作的教师，有着丰富的教学经验，对有机化学教学的教育体系和内容有着全面的了解。本教材充分吸收了编者的教学经验和改革成果以及多部优秀教材的精华。
（4）电子效应、反应机理是有机化学的重要基础理论，也是教学的重点、难点。本教材针对医科学生结构化学基础较为薄弱的现实情况，避免单纯罗列抽象概念，注意分散难点，采用深入浅出、通俗易懂的叙述方法，给出清晰明确的概念，简明易懂的实例，通过做习题加深理解。
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