医学文献检索(第二版) pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

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出版者:科学

作者:仇晓春

出品人:

页数:0

译者:

出版时间:2006-9

价格:35.00

装帧:平装

isbn号码:9787030178572

丛书系列:

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《生物信息学基础与应用》 本书简介 随着基因组学、蛋白质组学和系统生物学等前沿科学的蓬勃发展，海量的生物学大数据对传统的研究方法提出了严峻的挑战。为了有效地处理、分析和解释这些复杂的数据集，生物信息学作为一门交叉学科应运而生，并日益成为现代生命科学研究不可或缺的核心工具。《生物信息学基础与应用》（第三版）旨在系统、深入地介绍生物信息学的基本原理、核心算法和前沿技术，为生命科学研究人员、生物信息学专业学生以及相关领域的技术人员提供一本全面且实用的参考书。 本书内容涵盖了从基础数据结构到复杂系统建模的全过程，力求将理论深度与实际应用紧密结合。全书共分为六个主要部分，共十六章，结构清晰，逻辑严密。 第一部分：生物信息学导论与数据基础 本部分首先界定了生物信息学的范畴、历史沿革及其在当前生命科学研究中的战略地位。详细阐述了生物学数据（如核酸序列、蛋白质结构、基因表达谱、代谢通路数据等）的来源、特征和标准化的重要性。重点介绍了国际上主要的生物信息学数据库，如GenBank, PDB, UniProtKB, KEGG等，并指导读者如何高效地进行数据检索、获取与初步处理。着重讲解了FASTA、GenBank等常见文件格式的解析方法，为后续的序列分析奠定坚实的数据基础。 第二部分：序列分析的核心技术 序列分析是生物信息学的基石。本部分深入探讨了核酸和蛋白质序列比对的理论基础与实用工具。 基础比对算法： 详尽解析了点阵图、Needleman-Wunsch（全局比对）和Smith-Waterman（局部比对）算法的原理，特别是得分矩阵（如BLOSUM、PAM系列）的构建和应用机制。 启发式搜索： 重点介绍 BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）系列算法的工作流程，包括种子区域的选取、扩展策略和统计显著性评估（如E-value的含义）。 多序列比对（MSA）： 阐述了构建高质量多序列比对的方法，如ClustalW/X、T-Coffee等算法如何平衡准确性与计算效率，以及如何利用MSA进行保守性分析和构建系统发育树。 第三部分：基因组学与功能注释 随着高通量测序技术（NGS）的普及，基因组学数据分析已成为主流。本部分聚焦于从原始测序数据到功能性基因组信息的转化过程。 测序数据预处理： 讲解了Illumina、PacBio等不同测序平台数据的质量控制（QC）、低质量序列的过滤、序列的组装（De novo assembly与Reference-guided assembly）以及Contig的评估。 基因结构预测： 详细介绍了从头法、同源搜索法在原核生物和真核生物基因预测中的应用，包括外显子/内含子边界的识别、开放阅读框（ORF）的确定。 功能注释： 探讨了如何利用GO（Gene Ontology）、KEGG、InterPro等知识库对预测的基因或蛋白质进行功能归类，并介绍了基于序列和结构的功能预测方法。 第四部分：系统发育与进化分析 本部分构建了理解生命演化历史的计算框架。 进化模型： 阐述了核苷酸替换模型（如Jukes-Cantor, Kimura 2-parameter, GTR）和蛋白质替换模型（如WAG, JTT）的数学基础，以及最大似然法和贝叶斯方法在模型选择中的应用。 系统发育树的构建： 详细对比了距离法（如UPGMA, Neighbor-Joining）和基于字符的优化方法（如最大简约法、最大似然法、贝叶斯推断）的优缺点和适用场景。讨论了树的评估，如自举法（Bootstraping）的意义。 第五部分：结构生物信息学与蛋白质折叠 理解蛋白质的三维结构是解析其功能的关键。本部分深入探究了蛋白质结构预测与分析的技术。 二级结构预测： 介绍了Chou-Fasman、GOR方法以及基于深度学习的方法（如PSIPRED）在预测α螺旋、β折叠和无规则卷曲中的进展。 三维结构预测： 详细解析了同源建模（Homology Modeling）、蛋白质折叠识别（Threading）和从头预测（Ab Initio）的基本流程和挑战。重点讨论了AlphaFold2等基于深度神经网络的突破性进展及其原理。 结构比对与可视化： 介绍了RMSD计算、TM-score等结构相似性度量标准，并指导读者使用PyMOL、VMD等工具进行蛋白质结构的可视化与分析。 第六部分：高通量组学数据分析实例 本部分将前述理论应用于当前热门的高通量实验数据分析，展示生物信息学的实际生产力。 转录组学（RNA-Seq）： 涵盖了从原始reads计数、标准化（如TPM, FPKM）、差异表达基因（DEG）筛选，到通路富集分析（GSEA）的完整流程。 表观遗传学（ChIP-Seq/ATAC-Seq）： 介绍了如何识别结合位点、分析染色质开放区域，并结合基因组信息进行功能关联。 单细胞测序分析（scRNA-Seq）： 重点讲解了数据降噪、细胞类型聚类（Clustering）、细胞轨迹推断（Trajectory Inference）等关键步骤和常用算法包（如Seurat, Scanpy）。 适用读者与特色 本书不仅提供了丰富的算法介绍，更强调了实际操作能力。每章均配有清晰的算法流程图和必要的数学推导。为了方便读者上手，书中穿插了大量基于Python/R语言的实例代码片段，并推荐了主流的开源软件工具集。本书的语言力求严谨又不失流畅，避免了过于晦涩的术语堆砌，旨在成为生命科学领域研究人员和高年级学生的必备工具书和自学良伴。它将帮助读者跨越数据鸿沟，将海量的生物学数据转化为有意义的科学发现。

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**初识《医学文献检索(第二版)》：打开学术新视界** 作为一个临床医生，我深知信息爆炸时代里，掌握高效获取和利用医学文献的能力是多么关键。我一直想找到一本能够系统梳理医学文献检索方法和技巧的书籍，以便在繁杂的数据库中游刃有余。在朋友的推荐下，我入手了《医学文献检索(第二版)》。这本书的封面设计简洁大气，散发着严谨的学术气息，让我对它充满了期待。翻开第一页，我就被其清晰的逻辑和详实的案例所吸引。书中的内容并非枯燥的理论堆砌，而是结合了大量实际操作的步骤和技巧，从基础的数据库选择、关键词构建，到高级的文献筛选、信息整合，都进行了深入浅出的讲解。特别值得一提的是，书中针对不同医学领域文献检索的特点进行了细致的分析，为我这样的跨学科研究者提供了极大的便利。它不仅仅是一本工具书，更像是一位经验丰富的导师，循循善诱地引导我掌握医学文献检索的精髓。每一次阅读，都感觉自己离学术前沿又近了一步，解决临床问题的思路也变得更加开阔。这本书让我意识到，医学研究的深度和广度，很大程度上取决于我们能否有效地挖掘和利用现有知识。

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**《医学文献检索(第二版)》：实用为王，解决了我大难题** 长期以来，我在科研工作中遇到的最大瓶颈之一就是文献检索。虽然接触过一些数据库，但总感觉效率不高，筛选出的文献也往往不够精准，耗费了大量时间和精力。这次阅读《医学文献检索(第二版)》，简直如同拨云见日。这本书的语言非常接地气，没有太多晦涩的专业术语，即使是初学者也能轻松理解。它详尽地介绍了PubMed、Embase、Web of Science等主流医学数据库的使用方法，并通过大量的图文并茂的实例，手把手地教你如何构建高效的检索式，如何利用布尔算符、截词符等进行精准匹配。我尤其欣赏书中关于“同义词和近义词的运用”以及“主题词与关键词的区别”的讲解，这让我终于明白了为什么之前很多时候检索结果要么过于宽泛，要么遗漏重要文献。通过书中提供的策略，我尝试着改进了我的检索方式，惊奇地发现，搜索效率和文献质量都得到了显著提升。过去需要几天才能完成的文献梳理工作，现在可能只需要半天就能搞定。这本书真正做到了“实用为王”，解决了困扰我多年的实际问题，让我能更专注于研究本身。

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**《医学文献检索(第二版)》：为我打开了国际视野** 作为一名在基层医院工作的医生，接触到的信息和资源相对有限，常常感到学术视野不够开阔。阅读《医学文献检索(第二版)》的过程，就像是一次高质量的“国际会议”体验。书中详细介绍了如何利用PubMed、Scopus等国际主流数据库，以及如何理解和运用这些数据库中的英文文献。这对于我们接触海外前沿研究成果至关重要。过去，我对英文文献的阅读和理解存在一定障碍，总觉得文献数量庞大，语言障碍又是一道坎。然而，这本书提供了许多实用的技巧，例如如何利用翻译工具辅助阅读，如何关注文献的摘要和结论来快速判断其价值，以及如何通过文献的引用关系来发现更多相关研究。它让我认识到，全球的医学研究都在不断发展，而掌握高效的国际文献检索能力，能够让我及时了解最新的诊断和治疗方法，从而更好地服务于我的患者。这本书不仅提升了我的检索技能，更重要的是，它极大地拓宽了我的学术视野，让我对接下来的学习和研究充满了信心。

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**读《医学文献检索(第二版)》：学术思维的启蒙者** 在我看来，《医学文献检索(第二版)》不仅仅是一本关于技能的书，更是一本关于学术思维的书。在阅读过程中，我不仅仅学习了如何“找”文献，更重要的是，它引导我思考“为什么”要找文献，以及如何“用”好文献。书中在介绍检索技巧的同时，也穿插了许多关于如何评价文献质量、如何批判性地阅读文献、以及如何将文献中的信息转化为自己的学术观点的内容。这让我深刻体会到，医学文献检索并非仅仅是技术操作，而是一个贯穿整个学术研究过程的思维训练。它培养了我对信息敏锐的洞察力，以及严谨求实的学术态度。通过学习书中的方法，我开始能够更有条理地组织我的研究思路，能够更清晰地辨别信息的价值，也能够更有底气地进行学术交流。这本书让我明白，成为一名优秀的医学研究者，不仅需要扎实的专业知识，更需要一套高效、科学的学术工作方法。《医学文献检索(第二版)》无疑为我的学术之路注入了强大的动力，它是我在学术探索道路上不可多得的启蒙者。

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**《医学文献检索(第二版)》：细致入微，处处是惊喜** 我是一个比较注重细节的人，在学习新知识的时候，尤其希望能够了解每一个步骤背后的逻辑和原理。《医学文献检索(第二版)》在这方面做得非常出色。书中对于每一个数据库的操作界面、每一个检索选项的功能，都进行了非常细致的讲解，甚至会提示一些隐藏的小技巧。例如，在介绍PubMed的MeSH词时，它不仅解释了MeSH词的重要性，还详细演示了如何通过PubMed的MeSH数据库来查找最恰当的主题词，这让我一下子就明白了之前在使用MeSH时存在的困惑。此外，书中还提供了很多关于如何利用文献管理软件（如EndNote、Mendeley）来组织和管理检索到的文献的建议，这对于管理大量文献的研究者来说，无疑是福音。它让我看到了文献检索的“终极形态”，不仅仅是找到文献，更是如何高效地利用和管理文献。每次翻阅这本书，都能发现一些新的亮点，一些之前我可能忽略但却非常重要的小细节。《医学文献检索(第二版)》是一本真正“耐读”的书，它的价值会随着我检索经验的丰富而不断显现，我十分庆幸能拥有这样一本优秀的书籍。

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