《生物技术和生物工程专业规划教材•现代微生物生物技术》着重介绍现代生物技术中与微生物应用有关的技术、方法及其原理，其中包括生物技术的定义和范围，微生物分子遗传学的主要概念和研究成果，基因工程中常用的微生物载体和宿主系统，微生物人工诱变及分子育种新技术，现代微生物培养和发酵控制技术，微生物药物筛选及制药技术，微生物应用于环境保护的技术，微生物在农业生产上的应用技术，微生物应用于可再生能源生产的技术，生物催化的相关技术，微生物检测新技术，以及宏基因组及未培养微生物研究技术。
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