中醫性醫學是一門相對獨立的臨床學科。從學術上判斷一門臨床醫學是否發展成熟成為一門相對獨立的學科，一般看它是否有自己相對獨立的學科基礎理論，二是看它是否有其相對獨立的臨床病種。中醫性醫學作為相對獨立的一門臨床醫學學科，以人類性與生殖及其性關係為研究對象，有中醫自己獨特的基礎醫學理論，臨床中有相對獨立的病種和獨特的診治疾病的方法，所以從這樣一個學術標準說，中醫性醫學是一門相對獨立的臨床醫學。
中醫性醫學與西醫性醫學相比有著自己的學科特點與優勢。有人提齣，性醫學是一個獨立的學科，但是中醫性醫學與西醫性醫學的醫學目的和研究對象都是一緻的，那麼中醫性醫學為什麼要獨立於西醫性醫學成為中國性學中的一個獨立的學科呢？
中醫性醫學不同於西醫性醫學，它有自己的獨特的基礎醫學理論；它以陰陽五行學說為核心，以中醫的基本理論認知和研究人類的性與生殖及兩性的關係變化；它以辨證論治為基本的醫學方法診治性醫學的疾病；它以傳統的中醫中藥為基本手段治療性醫學的疾病；此外，中醫性醫學與西醫性醫學相比，中醫房室養生學、中醫性藥學等更是中醫性醫學特有的內容。
中國性學與世界性醫學相比，中醫性醫學是中國性學的特色與優勢，堅持發展中醫性醫學，纔能更好的突齣中國性學的特點，纔能更好地發展中國性學，纔能更好地進行國際間的性醫學的學術交流。
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