Free Energy Transduction and Biochemical Cycle Kinetics

Free Energy Transduction and Biochemical Cycle Kinetics pdf epub mobi txt 电子书 下载 2026

出版者:Dover Publications
作者:Terrell L. Hill
出品人:
页数:128
译者:
出版时间:2004-12-23
价格:USD 11.95
装帧:Paperback
isbn号码:9780486441948
丛书系列:
图书标签:
  • 自由能
  • 科学
  • 生物能学
  • 生物物理
  • 生化
  • TerrellHill
  • Bioenergetics
  • 自由能转导
  • 生物化学动力学
  • 代谢循环
  • 热力学
  • 酶动力学
  • 生物物理化学
  • 能量代谢
  • 非平衡态热力学
  • 生物化学
  • 动力学
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具体描述

This three-part treatment translates the technical language of research monographs on the theory of free energy transfer in biology, making the subject more accessible to those entering the field. Designed for upper-level classes in biochemistry or biophysics, it can also be used for independent study.

The first chapter presents a self-contained and elementary discussion of the principles of free energy transduction. Its survey encompasses the effects of thermodynamic forces; operation, cycle, and transition fluxes; efficiency and the rate of free energy dissipation; and fluxes and forces near equilibrium. The second chapteris a little more advanced in its examinations of the diagram method for calculating steady-state probabilities and cycle fluxes. The third chapter is increasingly sophisticated, introducing free energy levels of the state in a kinetic diagram. Primarily of conceptual interest, it is also essential in understanding muscle contraction and related mobility systems at the molecular level.

Dover (2005) unabridged republication of the edition published by Springer-Verlag New York, Inc., 1989. 36 figures. Index. 128pp. 5.375 x 8.5. Paperbound.

《化学反应的动力学奥秘:揭示生物化学循环的能量转换》 在这本引人入胜的著作中,我们将踏上一段探索生命体系核心运作机制的旅程。本书深入剖析了化学反应速率背后的奥秘,并聚焦于生物化学循环中能量转换的微妙平衡。我们并非简单地陈述事实,而是致力于揭示驱动这些过程的底层原理,以及这些原理如何在错综复杂的生物网络中得以体现。 第一部分:化学反应动力学的基石 本书的开篇,我们将奠定理解后续内容所需的坚实理论基础。这部分将详细阐述化学反应动力学中的核心概念,为读者构建一个清晰的框架,用以分析和预测化学过程的演变。 反应速率与影响因素: 我们将首先探讨什么是反应速率,以及它是如何被时间和反应物浓度所衡量的。在此基础上,我们将深入研究影响反应速率的关键因素: 浓度效应: 详细解释质量作用定律,以及反应物、产物浓度如何直接影响反应速率。我们将通过数学模型和实例,展示浓度变化如何导致反应向不同方向移动,并考察零级、一级、二级及更高级别反应动力学的特征。 温度的影响: 引入阿伦尼乌斯方程,阐明温度如何通过增加分子碰撞频率和克服活化能的分子比例来加速反应。我们将分析活化能的概念,并解释为何温度的微小变化可能对生物过程产生巨大影响。 催化剂的作用: 深入探讨催化剂如何降低反应活化能,从而显著提高反应速率,而自身在反应前后不发生消耗。我们将区分均相催化和非均相催化,并特别关注酶在生物体系中的催化作用,介绍酶促反应的特点,如底物特异性、米氏方程的推导及其应用。 其他影响因素: 简要提及溶剂效应、表面积(对于多相反应)等对反应速率的影响,并探讨其在特定生物环境中的相关性。 反应机理与中间产物: 反应速率定律并不能完全揭示反应的内在过程。因此,我们将转向反应机理的研究,即反应如何一步一步地进行。 基元反应与复杂反应: 区分基元反应(一步完成)和复杂反应(多步进行)。我们将解释如何从实验数据推断可能的反应机理,并引入速率决定步骤的概念,即整个反应速率由最慢的那个基元步骤决定。 自由基、碳正离子等活性中间体: 介绍在许多有机和生物化学反应中扮演重要角色的活性中间体。我们将分析它们的形成、稳定性和反应性,以及它们如何作为连接反应步骤的桥梁。 稳态近似法: 学习如何应用稳态近似法来简化复杂反应机理的分析,尤其是在中间体浓度很低且变化不大的情况下,这对于理解酶催化循环至关重要。 平衡常数与动力学的关系: 虽然平衡常数描述了反应的最终状态,但动力学则解释了如何达到这个状态。 平衡常数与自由能: 阐述平衡常数 (K) 与标准自由能变化 ($Delta G^0$) 之间的关系,以及它们如何预测反应自发性的方向。 平衡常数与速率常数: 探讨正向速率常数 (kf) 和逆向速率常数 (kb) 如何共同决定平衡常数 ($K = kf / kb$)。我们将强调,反应在达到平衡时,正逆反应速率相等,而不是反应停止。 第二部分:生物化学循环中的能量转换 在掌握了化学动力学的基本原理后,我们将目光转向生物体系,重点关注那些循环往复、维系生命活动的生物化学循环,以及其中能量的巧妙转换。 生物能学的基本概念: 自由能变化 ($Delta G$): 深入理解自由能的概念,区分标准自由能变化 ($Delta G^0$) 和实际自由能变化 ($Delta G$)。我们将解释 $Delta G < 0$ 表示自发过程,$Delta G > 0$ 表示非自发过程,而 $Delta G = 0$ 表示平衡状态。 能量耦合: 重点介绍生物体系如何通过“能量耦合”的方式,将一个自发的放能反应(如 ATP 水解)与一个非自发的吸能反应(如物质合成)联系起来,从而驱动后者发生。我们将详细分析 ATP 的结构和能量传递机制。 氧化还原反应在能量代谢中的作用: 考察细胞呼吸和光合作用等关键过程中,电子的传递如何伴随着能量的释放和储存。我们将介绍辅酶如 NADH 和 FADH2 的作用,以及它们在电子传递链中的角色。 关键的生物化学循环及其动力学特征: 三羧酸循环(柠檬酸循环): 详细解析三羧酸循环的每一个反应步骤,分析其动力学调控机制。我们将考察关键限速酶(如柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、α-酮戊二酸脱氢酶复合体)是如何调节循环的速率,并讨论变构效应、底物诱导和产物抑制等反馈调控机制。我们将分析循环中各个中间产物的浓度变化,以及它们如何影响能量生成。 糖酵解途径: 深入研究葡萄糖转化为丙酮酸的过程,包括其两条主要阶段:能量投资阶段和能量收益阶段。我们将重点关注能量调控的关键酶,如己糖激酶、磷酸果糖激酶-1 (PFK-1) 和丙酮酸激酶。我们将分析 PFK-1 在糖酵解中的核心调控地位,以及它如何受到 ATP、AMP、柠檬酸等变构效应物的调控,从而响应细胞的能量需求。 脂肪酸氧化与合成: 探讨脂肪酸的分解(β-氧化)产生能量,以及脂肪酸的合成储存能量的过程。我们将比较这两个过程的动力学特点和调控方式,并分析它们在不同生理状态下的相互关系。 核酸与蛋白质的生物合成: 简要介绍 DNA 复制、转录和翻译,以及蛋白质合成的动力学过程。我们将触及这些过程的精确性要求,以及调控机制如何确保信息的准确传递和蛋白质的有效合成。 循环动力学中的反馈与前馈控制: 负反馈调节: 强调许多生物化学循环中的产物会抑制该循环的早期步骤,这是一种普遍且至关重要的负反馈机制,用于维持循环稳态和防止能量的浪费。我们将举例说明,如 ATP 对糖酵解的抑制。 正反馈调节: 探讨某些情况下,产物或信号分子会激活该循环的步骤,从而放大信号或加速反应。 前馈控制: 介绍在某些复杂的信号通路中,某个上游的信号分子可能同时影响多个下游通路,这种前馈机制能够提高响应的速度和鲁棒性。 能量转换效率与优化: 热力学效率: 讨论生物化学反应的理论热力学效率上限,以及实际效率可能受到的限制。 动力学优化: 探讨生物体系如何通过精妙的酶促反应设计和调控网络,在有限的时间内以尽可能高的效率完成能量的产生、储存和利用。我们将分析是否存在“最优”的动力学参数组合,以适应不同的环境压力和生理需求。 疾病与代谢失调: 简要提及当生物化学循环的动力学发生异常时,可能导致的疾病,如糖尿病(糖代谢失调)、癌症(能量代谢异常)等,以突出理解这些动力学原理的重要性。 结论 本书旨在为读者提供一个全面而深入的视角,去理解生命体系是如何通过精密的化学反应动力学和高效的能量转换机制来运作的。从微观的分子碰撞到宏观的代谢循环,我们都将探究其背后的驱动力。通过对化学反应速率、机理以及能量转换过程的细致分析,我们希望能激发读者对生命科学更深层次的探索兴趣,并为理解疾病的发生发展以及开发新的治疗策略提供理论基础。这不仅仅是对知识的传授,更是对生命之“动”的深入洞察。

作者简介

目录信息

Preface
Chapter 1. Survey of the Elements of Free Energy Transduction
1. States, Diagrams, Cycles, and Free Energy Transduction
2. Thermodynamic Forces
3. Operational, Cycle, and Transition Fluxes
4. Efficiency and the Rate Free Energy Dissipation
5. Fluxes and Forces Near Equilibrium
Chapter 2. State Probabilities and Fluxes in Terms of the Rate Constants of the Diagram
6. The Diagram Method for State Probabilities
7. The Diagram Method for Cycle Fluxes and Related Topics
8. Recent Advances Concerning Fluxes, Diagrams, and Random Walks
Chapter 3. Free Energy Levels and Application to Muscle Contraction
9. Free Energy Levels in Kinetic Diagrams
10. Kinetic and Thermodynamic Formalism for Muscle Contraction
· · · · · · (收起)

读后感

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用户评价

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总的来说,这本书的气场非常强大,它不迎合任何流行的学术趋势,而是专注于阐述那些基础而永恒的科学原理。我能感受到作者试图建立的,是一种跨越学科壁垒的通用语言体系,旨在让读者能够用统一的视角去审视自然界中所有耗散结构中能量的流动与转化。它需要的不是快速的浏览,而是耐心的沉潜。对于任何一个希望将自己的研究提升到理论高度,而非仅仅停留在现象描述层面的科研工作者来说,这本书无疑是一份沉甸甸的投资。它不是那种读完后可以轻松合上的书,更多的是一本会常年陪伴在案头,需要反复翻阅和参照的工具书,它像一位沉默但极富智慧的导师,在你探索未知领域时提供坚实的理论支撑。

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这本书的装帧设计简直是一场视觉盛宴,硬壳的触感温润而坚实,传递出一种厚重而可靠的专业气息。封面采用了低饱和度的冷色调,搭配上极简的字体排版,立刻让人联想到严谨的科学研究和深邃的理论探讨。我尤其喜欢扉页的设计,那里的留白恰到好处,墨色的插图——几组抽象的分子结构示意图——仿佛在无声地预告着接下来的思维之旅将是何等精妙和引人入胜。虽然我尚未完全深入其核心内容,仅凭这第一印象,它就成功地在我心中树立起一座知识殿堂的形象。它的实体存在感非常强,即便是放在一堆新近购入的书籍中,那种散发出的沉静而强大的学术气场也难以被忽视。翻开书页,纸张的克重和纹理也处理得非常考究,油墨的印刷清晰锐利,即便是复杂的公式和图表也毫无模糊之感,这对于需要长时间阅读和对照参考的专业书籍来说,无疑是极大的加分项,体现了出版方对知识载体的尊重。这种对细节的极致追求,让我对书中内容的质量也充满了高度的期待。

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在阅读的间隙,我偶尔会尝试在脑海中勾勒出作者的写作心境。可以想象,在撰写这些章节时,作者必然经历了无数次的公式演算和模型验证,字里行间流淌着的是经过时间沉淀和反复打磨的真知灼见,而非浅尝辄止的观点堆砌。特别是那些涉及到时间常数和速率限制步骤的讨论部分,其措辞的精准度令人惊叹,仿佛每一个词语都经过了电子显微镜般的审视。这种对精确性的苛求,让这本书不仅仅是一本教材,更像是一部参考手册,未来在进行实验设计或数据解释时,我完全可以信赖书中所提供的理论框架作为锚点。这种深度的积累感,是那些网络资源或快速综述永远无法比拟的。它要求读者投入时间,但也承诺了与之匹配的回报。

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初读目录时,我立刻被其中章节标题的逻辑关联性所吸引。它似乎并非简单地罗列知识点,而更像是在构建一条清晰的推理链条,从宏观的系统层级向下剖析到微观的动力学细节,再层层递进地探讨能量在这些层级间的转换机制。这种结构化的叙述方式,对于那些试图建立完整知识体系的读者来说,简直是福音。我注意到它在开篇部分似乎花费了大量篇幅来铺陈背景知识,这使得即便是对某些前置概念掌握得不够扎实的读者,也能平稳地过渡到核心论题。这种循序渐进的教学节奏,体现了作者深厚的教学功底,他似乎非常善于理解读者的认知负荷,避免了初学者可能遭遇的突兀感。这种对叙事流畅性的重视,使得原本可能枯燥的理论推导过程,也变得更容易被大脑接受和消化。

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这本书的排版和图表设计,如果用一个词来形容,那就是“功能至上”。虽然整体风格保持了严谨的学术调性,但其中的插图并非仅仅是装饰性的点缀,它们是解决问题的关键钥匙。我发现很多复杂的反应网络图,通过巧妙的色彩编码和箭头指向,将原本盘根错节的生化路径梳理得井井有条,即便是那些涉及多步耦合和反馈抑制的环路,也能被清晰地视觉化。比起那些充斥着大量、但缺乏重点的示意图,这里的图表更像是作者亲手绘制的思维导图,每一条线、每一个符号都承载着特定的数学或物理意义。这种对视觉语言的有效运用,极大地降低了理解高维动力学系统的认知门槛,让理论的抽象概念变得触手可及。

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力荐!非常简明清晰的描述在生化反应中自由能流动的过程,并且diagram的方法解释的独特而清楚。对于理解在系统中自由能传递非常有效。

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