Free Energy Transduction and Biochemical Cycle Kinetics

Free Energy Transduction and Biochemical Cycle Kinetics pdf epub mobi txt 電子書 下載2026

出版者:Dover Publications
作者:Terrell L. Hill
出品人:
頁數:128
译者:
出版時間:2004-12-23
價格:USD 11.95
裝幀:Paperback
isbn號碼:9780486441948
叢書系列:
圖書標籤:
  • 自由能
  • 科學
  • 生物能學
  • 生物物理
  • 生化
  • TerrellHill
  • Bioenergetics
  • 自由能轉導
  • 生物化學動力學
  • 代謝循環
  • 熱力學
  • 酶動力學
  • 生物物理化學
  • 能量代謝
  • 非平衡態熱力學
  • 生物化學
  • 動力學
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具體描述

This three-part treatment translates the technical language of research monographs on the theory of free energy transfer in biology, making the subject more accessible to those entering the field. Designed for upper-level classes in biochemistry or biophysics, it can also be used for independent study.

The first chapter presents a self-contained and elementary discussion of the principles of free energy transduction. Its survey encompasses the effects of thermodynamic forces; operation, cycle, and transition fluxes; efficiency and the rate of free energy dissipation; and fluxes and forces near equilibrium. The second chapteris a little more advanced in its examinations of the diagram method for calculating steady-state probabilities and cycle fluxes. The third chapter is increasingly sophisticated, introducing free energy levels of the state in a kinetic diagram. Primarily of conceptual interest, it is also essential in understanding muscle contraction and related mobility systems at the molecular level.

Dover (2005) unabridged republication of the edition published by Springer-Verlag New York, Inc., 1989. 36 figures. Index. 128pp. 5.375 x 8.5. Paperbound.

《化學反應的動力學奧秘:揭示生物化學循環的能量轉換》 在這本引人入勝的著作中,我們將踏上一段探索生命體係核心運作機製的旅程。本書深入剖析瞭化學反應速率背後的奧秘,並聚焦於生物化學循環中能量轉換的微妙平衡。我們並非簡單地陳述事實,而是緻力於揭示驅動這些過程的底層原理,以及這些原理如何在錯綜復雜的生物網絡中得以體現。 第一部分:化學反應動力學的基石 本書的開篇,我們將奠定理解後續內容所需的堅實理論基礎。這部分將詳細闡述化學反應動力學中的核心概念,為讀者構建一個清晰的框架,用以分析和預測化學過程的演變。 反應速率與影響因素: 我們將首先探討什麼是反應速率,以及它是如何被時間和反應物濃度所衡量的。在此基礎上,我們將深入研究影響反應速率的關鍵因素: 濃度效應: 詳細解釋質量作用定律,以及反應物、産物濃度如何直接影響反應速率。我們將通過數學模型和實例,展示濃度變化如何導緻反應嚮不同方嚮移動,並考察零級、一級、二級及更高級彆反應動力學的特徵。 溫度的影響: 引入阿倫尼烏斯方程,闡明溫度如何通過增加分子碰撞頻率和剋服活化能的分子比例來加速反應。我們將分析活化能的概念,並解釋為何溫度的微小變化可能對生物過程産生巨大影響。 催化劑的作用: 深入探討催化劑如何降低反應活化能,從而顯著提高反應速率,而自身在反應前後不發生消耗。我們將區分均相催化和非均相催化,並特彆關注酶在生物體係中的催化作用,介紹酶促反應的特點,如底物特異性、米氏方程的推導及其應用。 其他影響因素: 簡要提及溶劑效應、錶麵積(對於多相反應)等對反應速率的影響,並探討其在特定生物環境中的相關性。 反應機理與中間産物: 反應速率定律並不能完全揭示反應的內在過程。因此,我們將轉嚮反應機理的研究,即反應如何一步一步地進行。 基元反應與復雜反應: 區分基元反應(一步完成)和復雜反應(多步進行)。我們將解釋如何從實驗數據推斷可能的反應機理,並引入速率決定步驟的概念,即整個反應速率由最慢的那個基元步驟決定。 自由基、碳正離子等活性中間體: 介紹在許多有機和生物化學反應中扮演重要角色的活性中間體。我們將分析它們的形成、穩定性和反應性,以及它們如何作為連接反應步驟的橋梁。 穩態近似法: 學習如何應用穩態近似法來簡化復雜反應機理的分析,尤其是在中間體濃度很低且變化不大的情況下,這對於理解酶催化循環至關重要。 平衡常數與動力學的關係: 雖然平衡常數描述瞭反應的最終狀態,但動力學則解釋瞭如何達到這個狀態。 平衡常數與自由能: 闡述平衡常數 (K) 與標準自由能變化 ($Delta G^0$) 之間的關係,以及它們如何預測反應自發性的方嚮。 平衡常數與速率常數: 探討正嚮速率常數 (kf) 和逆嚮速率常數 (kb) 如何共同決定平衡常數 ($K = kf / kb$)。我們將強調,反應在達到平衡時,正逆反應速率相等,而不是反應停止。 第二部分:生物化學循環中的能量轉換 在掌握瞭化學動力學的基本原理後,我們將目光轉嚮生物體係,重點關注那些循環往復、維係生命活動的生物化學循環,以及其中能量的巧妙轉換。 生物能學的基本概念: 自由能變化 ($Delta G$): 深入理解自由能的概念,區分標準自由能變化 ($Delta G^0$) 和實際自由能變化 ($Delta G$)。我們將解釋 $Delta G < 0$ 錶示自發過程,$Delta G > 0$ 錶示非自發過程,而 $Delta G = 0$ 錶示平衡狀態。 能量耦閤: 重點介紹生物體係如何通過“能量耦閤”的方式,將一個自發的放能反應(如 ATP 水解)與一個非自發的吸能反應(如物質閤成)聯係起來,從而驅動後者發生。我們將詳細分析 ATP 的結構和能量傳遞機製。 氧化還原反應在能量代謝中的作用: 考察細胞呼吸和光閤作用等關鍵過程中,電子的傳遞如何伴隨著能量的釋放和儲存。我們將介紹輔酶如 NADH 和 FADH2 的作用,以及它們在電子傳遞鏈中的角色。 關鍵的生物化學循環及其動力學特徵: 三羧酸循環(檸檬酸循環): 詳細解析三羧酸循環的每一個反應步驟,分析其動力學調控機製。我們將考察關鍵限速酶(如檸檬酸閤酶、異檸檬酸脫氫酶、α-酮戊二酸脫氫酶復閤體)是如何調節循環的速率,並討論變構效應、底物誘導和産物抑製等反饋調控機製。我們將分析循環中各個中間産物的濃度變化,以及它們如何影響能量生成。 糖酵解途徑: 深入研究葡萄糖轉化為丙酮酸的過程,包括其兩條主要階段:能量投資階段和能量收益階段。我們將重點關注能量調控的關鍵酶,如己糖激酶、磷酸果糖激酶-1 (PFK-1) 和丙酮酸激酶。我們將分析 PFK-1 在糖酵解中的核心調控地位,以及它如何受到 ATP、AMP、檸檬酸等變構效應物的調控,從而響應細胞的能量需求。 脂肪酸氧化與閤成: 探討脂肪酸的分解(β-氧化)産生能量,以及脂肪酸的閤成儲存能量的過程。我們將比較這兩個過程的動力學特點和調控方式,並分析它們在不同生理狀態下的相互關係。 核酸與蛋白質的生物閤成: 簡要介紹 DNA 復製、轉錄和翻譯,以及蛋白質閤成的動力學過程。我們將觸及這些過程的精確性要求,以及調控機製如何確保信息的準確傳遞和蛋白質的有效閤成。 循環動力學中的反饋與前饋控製: 負反饋調節: 強調許多生物化學循環中的産物會抑製該循環的早期步驟,這是一種普遍且至關重要的負反饋機製,用於維持循環穩態和防止能量的浪費。我們將舉例說明,如 ATP 對糖酵解的抑製。 正反饋調節: 探討某些情況下,産物或信號分子會激活該循環的步驟,從而放大信號或加速反應。 前饋控製: 介紹在某些復雜的信號通路中,某個上遊的信號分子可能同時影響多個下遊通路,這種前饋機製能夠提高響應的速度和魯棒性。 能量轉換效率與優化: 熱力學效率: 討論生物化學反應的理論熱力學效率上限,以及實際效率可能受到的限製。 動力學優化: 探討生物體係如何通過精妙的酶促反應設計和調控網絡,在有限的時間內以盡可能高的效率完成能量的産生、儲存和利用。我們將分析是否存在“最優”的動力學參數組閤,以適應不同的環境壓力和生理需求。 疾病與代謝失調: 簡要提及當生物化學循環的動力學發生異常時,可能導緻的疾病,如糖尿病(糖代謝失調)、癌癥(能量代謝異常)等,以突齣理解這些動力學原理的重要性。 結論 本書旨在為讀者提供一個全麵而深入的視角,去理解生命體係是如何通過精密的化學反應動力學和高效的能量轉換機製來運作的。從微觀的分子碰撞到宏觀的代謝循環,我們都將探究其背後的驅動力。通過對化學反應速率、機理以及能量轉換過程的細緻分析,我們希望能激發讀者對生命科學更深層次的探索興趣,並為理解疾病的發生發展以及開發新的治療策略提供理論基礎。這不僅僅是對知識的傳授,更是對生命之“動”的深入洞察。

作者簡介

目錄資訊

Preface
Chapter 1. Survey of the Elements of Free Energy Transduction
1. States, Diagrams, Cycles, and Free Energy Transduction
2. Thermodynamic Forces
3. Operational, Cycle, and Transition Fluxes
4. Efficiency and the Rate Free Energy Dissipation
5. Fluxes and Forces Near Equilibrium
Chapter 2. State Probabilities and Fluxes in Terms of the Rate Constants of the Diagram
6. The Diagram Method for State Probabilities
7. The Diagram Method for Cycle Fluxes and Related Topics
8. Recent Advances Concerning Fluxes, Diagrams, and Random Walks
Chapter 3. Free Energy Levels and Application to Muscle Contraction
9. Free Energy Levels in Kinetic Diagrams
10. Kinetic and Thermodynamic Formalism for Muscle Contraction
· · · · · · (收起)

讀後感

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用戶評價

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在閱讀的間隙,我偶爾會嘗試在腦海中勾勒齣作者的寫作心境。可以想象,在撰寫這些章節時,作者必然經曆瞭無數次的公式演算和模型驗證,字裏行間流淌著的是經過時間沉澱和反復打磨的真知灼見,而非淺嘗輒止的觀點堆砌。特彆是那些涉及到時間常數和速率限製步驟的討論部分,其措辭的精準度令人驚嘆,仿佛每一個詞語都經過瞭電子顯微鏡般的審視。這種對精確性的苛求,讓這本書不僅僅是一本教材,更像是一部參考手冊,未來在進行實驗設計或數據解釋時,我完全可以信賴書中所提供的理論框架作為錨點。這種深度的積纍感,是那些網絡資源或快速綜述永遠無法比擬的。它要求讀者投入時間,但也承諾瞭與之匹配的迴報。

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這本書的裝幀設計簡直是一場視覺盛宴,硬殼的觸感溫潤而堅實,傳遞齣一種厚重而可靠的專業氣息。封麵采用瞭低飽和度的冷色調,搭配上極簡的字體排版,立刻讓人聯想到嚴謹的科學研究和深邃的理論探討。我尤其喜歡扉頁的設計,那裏的留白恰到好處,墨色的插圖——幾組抽象的分子結構示意圖——仿佛在無聲地預告著接下來的思維之旅將是何等精妙和引人入勝。雖然我尚未完全深入其核心內容,僅憑這第一印象,它就成功地在我心中樹立起一座知識殿堂的形象。它的實體存在感非常強,即便是放在一堆新近購入的書籍中,那種散發齣的沉靜而強大的學術氣場也難以被忽視。翻開書頁,紙張的剋重和紋理也處理得非常考究,油墨的印刷清晰銳利,即便是復雜的公式和圖錶也毫無模糊之感,這對於需要長時間閱讀和對照參考的專業書籍來說,無疑是極大的加分項,體現瞭齣版方對知識載體的尊重。這種對細節的極緻追求,讓我對書中內容的質量也充滿瞭高度的期待。

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初讀目錄時,我立刻被其中章節標題的邏輯關聯性所吸引。它似乎並非簡單地羅列知識點,而更像是在構建一條清晰的推理鏈條,從宏觀的係統層級嚮下剖析到微觀的動力學細節,再層層遞進地探討能量在這些層級間的轉換機製。這種結構化的敘述方式,對於那些試圖建立完整知識體係的讀者來說,簡直是福音。我注意到它在開篇部分似乎花費瞭大量篇幅來鋪陳背景知識,這使得即便是對某些前置概念掌握得不夠紮實的讀者,也能平穩地過渡到核心論題。這種循序漸進的教學節奏,體現瞭作者深厚的教學功底,他似乎非常善於理解讀者的認知負荷,避免瞭初學者可能遭遇的突兀感。這種對敘事流暢性的重視,使得原本可能枯燥的理論推導過程,也變得更容易被大腦接受和消化。

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總的來說,這本書的氣場非常強大,它不迎閤任何流行的學術趨勢,而是專注於闡述那些基礎而永恒的科學原理。我能感受到作者試圖建立的,是一種跨越學科壁壘的通用語言體係,旨在讓讀者能夠用統一的視角去審視自然界中所有耗散結構中能量的流動與轉化。它需要的不是快速的瀏覽,而是耐心的沉潛。對於任何一個希望將自己的研究提升到理論高度,而非僅僅停留在現象描述層麵的科研工作者來說,這本書無疑是一份沉甸甸的投資。它不是那種讀完後可以輕鬆閤上的書,更多的是一本會常年陪伴在案頭,需要反復翻閱和參照的工具書,它像一位沉默但極富智慧的導師,在你探索未知領域時提供堅實的理論支撐。

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這本書的排版和圖錶設計,如果用一個詞來形容,那就是“功能至上”。雖然整體風格保持瞭嚴謹的學術調性,但其中的插圖並非僅僅是裝飾性的點綴,它們是解決問題的關鍵鑰匙。我發現很多復雜的反應網絡圖,通過巧妙的色彩編碼和箭頭指嚮,將原本盤根錯節的生化路徑梳理得井井有條,即便是那些涉及多步耦閤和反饋抑製的環路,也能被清晰地視覺化。比起那些充斥著大量、但缺乏重點的示意圖,這裏的圖錶更像是作者親手繪製的思維導圖,每一條綫、每一個符號都承載著特定的數學或物理意義。這種對視覺語言的有效運用,極大地降低瞭理解高維動力學係統的認知門檻,讓理論的抽象概念變得觸手可及。

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力薦!非常簡明清晰的描述在生化反應中自由能流動的過程,並且diagram的方法解釋的獨特而清楚。對於理解在係統中自由能傳遞非常有效。

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