Binding and Kinetics for Molecular Biologists

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出版者:Cold Spring Harbor Laboratory Pr
作者:Goodrich, James A./ Kugel, Jennifer F.
出品人:
页数:182
译者:
出版时间:2006-12
价格:$ 68.93
装帧:HRD
isbn号码:9780879697365
丛书系列:
图书标签:
  • 分子生物学
  • 蛋白质结合
  • 酶动力学
  • 生物化学
  • 生物物理学
  • 分子相互作用
  • 亲和力
  • 动力学分析
  • 生物分子
  • 实验技术
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具体描述

This handbook offers a practical guide to the principles of quantitative analysis in biological experiments. The material is primarily aimed at working molecular biologists, but the scope and clarity of presentation make it equally suitable as an introduction for students. Topics covered range from the basics - such as measuring the concentrations of macromolecules - through considerations of binding constants and the kinetics of molecular interactions. The book ends with a thorough consideration of data analysis.

好的,这是一份关于《Binding and Kinetics for Molecular Biologists》的图书简介,内容详细,不包含您提及的书籍的具体内容,旨在描绘一本专注于分子生物学中相互作用动力学与结合理论的书籍可能涵盖的深度与广度。 《分子生物学家之结合与动力学:深入理解生命过程的速率与亲和力》 图书简介 在分子生物学的宏伟图景中,生命活动的每一个细微之处——从DNA复制的保真性到信号通路的高效传递,再到酶催化的精确控制——都根植于分子间的相互作用和它们的动力学过程。理解这些相互作用的亲和力(Affinity)和速率(Kinetics),是揭示生命机制、设计新疗法、并进行精确生物物理建模的基石。《分子生物学家之结合与动力学》正是这样一本旨在为研究人员、高级本科生及研究生提供全面、深入指导的专著,它系统地梳理了理解和量化生物分子结合事件所必需的理论框架、实验技术以及数据分析方法。 本书并非仅仅罗列实验步骤,而是致力于构建一个坚实的理论基础,使读者能够深刻理解宏观观察背后的微观物理化学原理。我们认为,一名合格的分子生物学家不仅需要知道“发生了什么”,更需要理解“为什么会以这种方式发生”以及“速率如何影响最终结果”。 第一部分:基础理论与热力学视角 全书伊始,我们将从分子识别的基本热力学原理入手。这部分内容将超越教科书上对吉布斯自由能的简单介绍,深入探讨结合自由能($Delta G$)如何与平衡解离常数($K_D$)相关联,以及它在定义分子间亲和力方面的核心作用。我们将详细阐述熵(Entropy)和焓(Enthalpy)在驱动结合过程中的相对贡献,特别是溶剂效应(如疏水作用、氢键、范德华力)在复杂生物环境中的微妙平衡。读者将学习如何利用Isothermal Titration Calorimetry (ITC) 等技术,不仅测定 $K_D$,更重要的是解析出 $Delta H$ 和 $Delta S$,从而获得对结合事件驱动力的全面洞察。 此外,我们还将构建一个严谨的统计力学视角,探讨分子构象柔性和结构适应性(如诱导契合)对结合平衡的影响,为后续的动力学分析做好铺垫。 第二部分:反应速率与动力学建模 如果说热力学决定了反应的终点,那么动力学则定义了抵达终点的“路径”和“时间”。本书的核心内容之一便是对反应速率常数($k_{on}$ 和 $k_{off}$)的深入解析。我们将细致讨论一阶、二阶及伪一阶反应的数学模型,并详细阐述如何利用这些模型来描述酶促反应、受体活化以及多价相互作用的复杂过程。 重点章节将聚焦于过渡态理论(Transition State Theory),解释活化能如何调控反应的速率。我们将探讨如何通过改变溶液条件(如离子强度、pH值、温度)来解析反应的敏感性,从而推断反应的机制和涉及的活化结构。对于生物分子系统,我们特别关注过程速率限制(Rate-Limiting Steps)的识别方法,这是优化生物过程或理解酶催化效率的关键。 第三部分:核心实验技术:从静态到时间分辨 理论的有效性依赖于精确的测量。本书详尽介绍并对比了当前用于测定结合与动力学参数的尖端技术,强调每种技术背后的物理化学假设和局限性。 A. 亲和力测量技术: 除了ITC,我们还会深入讲解表面等离子体共振(SPR)和生物层干涉测量(BLI)的原理,重点在于如何正确校正背景信号、处理非理想的流动条件,并从原始传感器图谱中准确提取 $K_D$ 值。对于低亲和力相互作用(如蛋白质-蛋白质或蛋白质-脂质),如何运用荧光相关光谱(FCS)和动态光散射(DLS)进行可靠测定也将被纳入讨论。 B. 动力学测量技术: 对时间分辨技术的掌握至关重要。我们将详细介绍快速动力学方法,包括荧光猝灭/恢复技术(Stopped-Flow/Rapid Quench),如何应用于测量毫秒到秒级的快速结合与解离事件。对于需要更高时间分辨率的系统,我们将探讨飞秒激光光谱学在解析分子振动和超快构象变化中的应用潜力。 第四部分:复杂系统的建模与应用 现代生物学研究越来越倾向于多组分系统和网络分析。本书的最后部分将引导读者进入更具挑战性的领域: 1. 多价相互作用: 阐述生物系统(如抗体与抗原、配体与受体集群)中,多价结合如何通过倍增效应(Avidity Effect)显著增强整体亲和力,并提供相应的数学模型来区分纯粹的结合增益与动力学失活。 2. 酶促反应的动力学深化: 深入解析Michaelis-Menten 动力学的局限性,并探讨更复杂的机制,如底物竞争、变构调节以及酶激活过程中的时间延迟。 3. 药物发现中的应用: 探讨靶点占有率(Target Occupancy)与药物功效之间的动力学关联,强调 $k_{off}$ 在确定体内作用持续时间中的决定性作用,超越了单纯的 $K_D$ 比较。 《分子生物学家之结合与动力学》旨在成为一本不可或缺的参考书,它不仅教授读者测量这些关键参数的方法,更赋予他们解读这些参数的深层生物学意义的能力,从而推动对生命现象更精确的理解和更有效的生物技术设计。本书的章节设计严谨,案例丰富,致力于将抽象的物理化学概念转化为分子生物学家手中的强大工具。

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