Molecular Ecology

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出版者:Wiley-Blackwell
作者:Joanna R. Freeland
出品人:
页数:464
译者:
出版时间:2011-4-25
价格:USD 109.00
装帧:Paperback
isbn号码:9780470748336
丛书系列:
图书标签:
  • 博士
  • 专业
  • 分子生态学
  • 生态学
  • 遗传学
  • 进化生物学
  • 生物多样性
  • 种群遗传学
  • 分子生物学
  • 环境科学
  • 保护生物学
  • 基因组学
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具体描述

Molecular Ecology, 2nd Edition provides an accessible introduction to the many diverse aspects of this subject. The book takes a logical and progressive approach to uniting examples from a wide range of taxonomic groups. The straightforward writing style offers in depth analysis whilst making often challenging subjects such as population genetics and phylogenetics highly comprehensible to the reader. The first part of the book introduces the essential underpinnings of molecular ecology and gives a review of genetics and discussion of the molecular markers that are most frequently used in ecological research, and a chapter devoted to the newly emerging field of ecological genomics. The second half of the book covers specific applications of molecular ecology, covering phylogeography, behavioural ecology and conservation genetics. The new edition provides a thoroughly up-to-date introduction to the field, emphasising new types of analyses and including current examples and techniques whilst also retaining the information-rich, highly readable style which set the first edition apart. Incorporates both theoretical and applied perspectives Highly accessible, user-friendly approach and presentation Includes self-assessment activities with hypothetical cases based on actual species and realistic data sets Uses case studies to place the theory in context Provides coverage of population genetics, genomics, phylogeography, behavioural ecology and conservation genetics.

好的,这是一本名为《宏观生物地理学:全球格局与演化驱动力》的图书简介,旨在详细阐述宏观尺度的生物分布、影响因素及其历史演变,内容与《Molecular Ecology》无关。 --- 宏观生物地理学:全球格局与演化驱动力 导言:超越时空尺度的生命分布 生命在地球上的分布绝非随机。从山巅到深海,从热带雨林到极地苔原,物种的地理格局是地球历史、气候变迁、地质构造与生物自身生态适应性共同作用的宏大剧本。《宏观生物地理学:全球格局与演化驱动力》 是一部系统梳理和深入剖析全球尺度生物分布模式的权威著作。本书聚焦于宏观生物地理学领域,即研究物种、群落和生态系统在广阔地理范围内的空间分布、隔离模式、扩散机制及其驱动力的学科分支。 本书的核心在于揭示 “在哪里” 和 “为什么” 的深层联系。它将传统的物种分布模型与现代的板块构造理论、古气候重建以及辐射适应进化理论相结合,为读者提供一个理解当前生物多样性热点与“遗迹”区域形成机制的全面框架。我们不再局限于局部群落的相互作用,而是将目光投向数百万年乃至数亿年的时间尺度,探讨大陆漂移、冰期旋回、山脉隆升等地球动力学过程如何塑造了今天的生物地理版图。 第一部分:宏观生物地理学的理论基石与方法论 本书的开篇部分为读者奠定了坚实的理论基础和方法论工具箱。宏观生物地理学区别于微观或群落生态学的关键在于其对 空间尺度 和 时间深度 的强调。 1.1 宏观生物地理学的核心概念与历史演进 本章追溯了洪堡特、达尔文以及魏格纳等先驱者如何奠定现代生物地理学的基础。重点阐述了“物种-面积关系”、“纬度多样性梯度”、“隔离与分散”等核心理论的提出与发展。我们探讨了 维管植物区系 和 动物区系 在宏观尺度上的差异性,并强调了地理隔离(Allopatry)作为物种形成主要驱动力的地位。 1.2 地理信息系统(GIS)与空间分析在宏观研究中的应用 在当代研究中,处理海量地理数据是宏观研究的必备技能。本章详细介绍了如何利用高级 GIS 工具来量化和可视化全球尺度的分布模式。内容涵盖: 空间自相关分析(Moran’s I): 判断物种或群落分布是否存在显著的聚集性或分散性。 区域化与界定: 探讨生物地理区域划分的传统方法(如区分界)与基于数据驱动的聚类分析(如最大熵模型)的优劣。 可视图层构建: 如何整合地质图、气候图、古气候重建图等,构建多层级的空间分析环境。 1.3 分支系统地理学(Phylogeography)的宏观视角 本书引入了分支系统地理学作为连接进化历史与空间分布的桥梁。重点探讨了如何利用分子数据来推断物种在过去冰期-间冰期循环中,在山脉或大陆块上的 庇护所(Refugia) 扩散路径。这种方法使我们能够从“当下”的分布格局,回溯到数万年前的生态压力。 第二部分:地球动力学:驱动全球格局的非生物因素 宏观生物地理学的一个重要特征是高度依赖地球科学的发现。本部分深入探讨了地质和气候的巨大力量如何塑造了我们今天所见的生物界。 2.1 板块构造与大陆漂移对生物区系的影响 维加纳(Wegener)的理论 在现代被深化和量化。本章详细分析了泛大陆(Pangaea)的分裂如何导致了现今各大洲生物区系的 分歧(Vicariance)。 冈瓦纳古陆的遗产: 以南半球的动物群(如爬行动物、鸟类)和植物群(如南山毛榉属 Nothofagus)为例,阐释了这种远古联系的遗传证据。 特提斯洋的关闭与生物交流中断: 分析了地中海和中亚地区生物群落的隔离与再连通历史。 2.2 构造抬升与气候变迁的协同作用 山脉的形成不仅是物理屏障,更是气候“泵”的启动器。 山脉的隔离效应: 探讨了安第斯山脉、喜马拉雅山脉的隆升如何创造了新的物种形成区域,并导致了 垂直生物地理梯度 的出现。 冰期旋回(Glacial Cycles)的重塑: 详细分析了更新世的冰川作用,如何通过海平面下降导致的 大陆桥连接 和冰盖扩张造成的 栖息地丧失,剧烈地改变了温带和寒带物种的分布范围,形成了现今的“冰缘物种”。 2.3 气候梯度与生物多样性 本书系统比较了不同气候带对生物多样性的影响,重点关注 纬度多样性梯度(LDG) 的宏观解释。我们批判性地评估了“时间深度的假说”(热带地区更少受到冰期干扰)与“能量-多样性假说”(高能量输入支持高物种丰富度)在不同地理尺度上的适用性。 第三部分:生物过程与扩散机制的宏观解析 在地球环境提供了基础骨架后,生物自身的扩散能力和适应性决定了物种如何填充这些空间。 3.1 远距离扩散与生物地理学中的“移民者” 并非所有物种都遵循缓慢的地理隔离路径。本章聚焦于 长距离扩散事件(Long-Distance Dispersal, LDD),即少数“探险家”如何突破主要的地理障碍,建立新的种群。 海洋介导的扩散: 探讨了洋流、海岛火山喷发对植物种子和无脊椎动物的漂流影响。 生物介导的扩散: 分析了候鸟迁徙和海洋巨型哺乳动物在跨洋传播中的关键作用,尤其是在岛屿生物地理学中解释了 “奇迹般”的定植事件。 3.2 生态位演化与区域填充(Filling Niches) 物种在新的地理区域定植后,它们必须与其先存的物种竞争或适应新的环境条件。 生态等值性(Ecological Equivalence): 讨论了在相似的宏观气候条件下(如温带落叶林在北美和欧亚大陆),不同起源的物种如何趋同演化出相似的生态功能和形态。 入侵物种的宏观背景: 从宏观视角分析了现代人类活动导致的物种大交换(Anthropogenic Biotic Exchange)。解释了为什么某些“机会主义者”能够在全球范围内快速扩散,并讨论了其对原有生物地理格局的冲击。 3.3 岛屿生物地理学:微缩的宏观实验室 达尔文的加拉帕戈斯群岛研究至今仍是宏观生物地理学的核心案例。本章将 麦克阿瑟与威尔逊的平衡理论 置于全球语境下。 隔离度与面积效应的量化: 探讨了岛屿的面积、距离与物种的 灭绝率(Extinction Rates) 和 物种形成率(Speciation Rates) 之间的关系,并将其应用于评估大型大陆性“岛屿”(如孤立的高原或沙漠)的保护价值。 结语:整合与未来展望 《宏观生物地理学:全球格局与演化驱动力》最终呼吁将 地球科学、古生物学、演化生物学 和 空间生态学 更紧密地整合起来。理解生命分布的宏观逻辑,不仅是对过去历史的追溯,更是对未来气候变化下生物多样性重塑的有效预测基础。本书为研究生、科研人员以及所有对地球生命史和空间分布奥秘感兴趣的读者,提供了一部不可或缺的参考巨著。

作者简介

Dr Joanna R Freeland's research career in molecular ecology has embraced aspects of evolution, behavioural ecology, population genetics, and conservation genetics

Heather Kirk writes books for young people and adults. Heather has also written newspaper articles, radio scripts, and scholarly criticism. She has won several awards for her work. Her website is at www.heatherkirk.ca.

Stephen Petersen is an independent scholar and recipient of a Mellon Postdoctoral Fellowship at the Penn Humanities Forum. He has published articles in Art Journal, Art on Paper, Visual Resources, Science in Context, and The Burlington Magazine.

目录信息

读后感

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用户评价

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《Molecular Ecology》这本书,对我这个对古生物学和进化生物学充满好奇的业余爱好者来说,简直是一场知识的盛宴。我一直对地球生命的演化历程着迷,但传统的古生物学研究往往依赖于化石证据,而化石记录的局限性使得我们对很多进化细节知之甚少。直到我接触到《Molecular Ecology》,我才真正领略到分子学技术在揭示生命演化奥秘方面的强大力量。书中关于“分子钟”理论的应用,以及如何利用DNA序列的变异速率来估算物种分化的时间,让我对生命的起源和早期演化有了更深刻的理解。我尤其着迷于书中关于“古代DNA(aDNA)”研究的章节,这些章节详细介绍了如何从古老的生物遗骸中提取和分析DNA,以及如何利用这些信息来重建 extinct 物种的基因组、探究它们的亲缘关系以及了解它们的生活习性。书中对尼安德特人基因组的研究案例,以及如何通过DNA分析揭示现代人类的迁徙历史和基因交流,都让我惊叹不已。这不仅仅是枯燥的理论,而是通过科学的实验和严谨的分析,将我们带回遥远的过去,让我们得以窥见生命的演化之路。此外,书中还探讨了如何利用分子证据来研究物种的适应性进化,例如在不同环境条件下,哪些基因发生了变异,从而赋予了生物体独特的生存优势。这些内容极大地满足了我对生命进化细节的探索欲。这本书让我明白,分子生态学不仅仅是研究当代生物的工具,更是连接过去与现在的桥梁,是理解生命演化历史的钥匙。

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《Molecular Ecology》这本书,我可以说是在一个非常偶然的机会下接触到的,当时我正在为自己的研究项目寻找合适的分子学方法论。我是一名专注于研究生物与微生物相互作用的学者,尤其对共生关系和病原体传播机制感兴趣。在翻阅了大量的文献资料后,我偶然看到了《Molecular Ecology》的目录,并被其中关于宏基因组学、元转录组学以及生物信息学在生态学研究中的应用部分深深吸引。这本书的叙述方式非常独特,它不仅仅是罗列理论和方法,而是通过一系列引人入胜的研究案例,将复杂的分子机制解释得淋漓尽致。例如,书中关于利用宏基因组学来解析土壤微生物群落结构和功能的研究,以及如何通过元转录组学来理解微生物在特定环境下的基因表达模式,都为我提供了极大的启发。我一直试图理解植物根系微生物群落在不同生长阶段的变化,以及这些微生物如何影响植物的生长和对环境胁迫的抵抗力。《Molecular Ecology》中关于如何利用高通量测序技术和先进的生物信息学分析方法,来揭示微生物群落的组成、功能和相互作用,为我的研究打开了新的大门。我开始学习如何使用QIIME2、metaPhlAn等软件来分析宏基因组数据,并尝试使用MEGAN来可视化和解释微生物群落的进化关系。书中对这些工具的介绍虽然不深入到编程细节,但提供了清晰的操作思路和关键概念的解释,让我能够快速上手。这本书就像一座桥梁,连接了我对宏观生态学现象的观察和对微观分子机制的探究,让我能够更全面、更深入地理解生物界复杂的相互作用。

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作为一名在生物多样性保护领域工作多年的研究者,《Molecular Ecology》为我提供了不可或缺的理论指导和实践工具。我长期关注濒危物种的保护,并深知遗传多样性的维持是物种长期生存的关键。在接触这本书之前,我对如何量化和评估遗传多样性,以及如何利用分子标记来识别具有高遗传价值的种群,都感到有些迷茫。然而,《Molecular Ecology》中的章节,特别是关于种群遗传学和保护遗传学的内容,彻底改变了我的认知。书中详细介绍了各种分子标记技术,如RAPD、AFLP、SSR、SNP等,并深入分析了它们在评估物种遗传变异、检测近亲繁殖、以及制定有效的保护策略方面的优势和局限性。我尤其欣赏书中关于“遗传瓶颈”和“ founder effect”的阐述,以及如何通过分析种群的遗传结构来判断其是否濒危以及需要采取何种干预措施。我曾参与过一项针对某地区特有哺乳动物的保护项目,在项目初期,我们面临着如何确定最佳的迁地保护繁殖个体以及如何构建遗传上多样化的繁殖群体的问题。阅读《Molecular Ecology》后,我能够自信地运用书中介绍的分子标记技术,对不同地理区域的该物种进行遗传多样性评估,并据此为繁殖计划提供了科学依据,显著提高了项目的成功率。此外,书中对“基因流”在维持种群遗传多样性中的重要性的强调,也让我认识到构建生态廊道、促进物种间的基因交流对于濒危物种长期生存的必要性。这本书的理论深度和实践指导性,使得它成为我案头必备的参考书籍,也帮助我在生物多样性保护工作中取得了显著的进展。

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当我第一次捧起《Molecular Ecology》时,我并没有想到它会如此深刻地改变我对环境科学的认知。我是一名环境工程师,主要关注污染物的迁移转化和生态修复。在此之前,我主要依赖于化学分析和物理模型来评估环境污染的程度和预测其扩散趋势。然而,《Molecular Ecology》以其独特的视角,让我认识到生物体内部的分子机制在环境问题中扮演着至关重要的角色。书中关于微生物在污染物降解中的作用,以及如何利用基因工程来增强微生物的降解能力,给我留下了深刻的印象。我特别被书中关于“生物修复”的章节所吸引,其中详细介绍了如何通过培养和筛选具有高效降解特定污染物的微生物,并将其应用于实际的污染治理中。书中引用了大量的案例,例如利用特定细菌降解石油烃、农药残留以及重金属的例子,这些案例都极具说服力,让我看到了分子生物学在环境治理方面的巨大潜力。我开始思考,如何将分子生态学的理念融入到我的工作中,例如通过监测污染场地中微生物群落的结构和功能,来评估污染物的生物可利用性,或者通过基因技术来开发更高效的生物修复方案。书中关于“环境DNA(eDNA)”在监测环境污染和评估生态系统健康方面的应用,也让我眼前一亮。这种非侵入性的采样方法,可以让我们在不直接接触生物体的情况下,了解环境中存在的生物种类以及它们的生态习性,这对于评估污染对生物群落的影响具有重要的意义。这本书为我提供了一个全新的思考框架,让我能够从分子层面理解环境问题,并寻求更具创新性和可持续性的解决方案。

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《Molecular Ecology》这本书,为我在农业科学领域的研究提供了源源不断的灵感和方法论。我一直致力于研究作物育种和病虫害防治,并深知遗传改良对于提高农作物产量和抗逆性至关重要。在接触这本书之前,我对如何利用分子技术来加速育种进程,以及如何识别和利用具有优良性状的基因,都感到有些模糊。然而,《Molecular Ecology》中的相关章节,特别是关于“分子标记辅助选择(MAS)”和“基因组选择(GS)”的内容,为我指明了方向。书中详细介绍了如何利用SSR、SNP等分子标记来定位与产量、抗病性等重要农艺性状相关的基因位点,并如何将这些标记应用于大规模的育种材料筛选和杂交后代的鉴定。这极大地提高了育种效率,缩短了育种周期。我尤其被书中关于“基因组学”在作物育种中的应用所吸引。通过分析作物的全基因组数据,我们可以更全面地了解控制重要性状的基因网络,并发现新的抗病基因或抗逆基因。书中对于“基因编辑技术”在作物改良中的应用也进行了深入的探讨,这为开发具有特定优良性状的新品种提供了强大的工具。我记得书中有一个关于利用CRISPR-Cas9技术培育抗虫棉花的案例,这让我看到了分子生物学在解决农业生产挑战方面的巨大潜力。这本书的理论深度和实践指导性,使得它成为我进行作物育种研究的必备参考,也帮助我更有效地为农业发展贡献力量。

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《Molecular Ecology》的出现,无疑为我过去多年在野外进行的生态学研究注入了新的活力。我一直致力于研究不同鸟类种群的迁徙行为,并试图理解气候变化对其迁徙路线和时间的影响。长期以来,我主要依赖于传统的标记和追踪方法,虽然能够获得一些有价值的信息,但总觉得在基因层面上缺乏更深入的解析。阅读《Molecular Ecology》后,我豁然开朗。书中关于微卫星标记、线粒体DNA分析以及核基因组学在种群遗传结构和基因流研究中的应用,为我提供了全新的研究思路。我开始尝试利用这些分子技术来分析不同迁徙地之间鸟类种群的基因交流情况,从而更准确地评估气候变化对它们种群隔离和遗传多样性的影响。令我惊喜的是,书中对于数据分析软件和统计方法的介绍也相当详尽,并且提供了大量的参考文献,使得我可以轻松地将理论知识转化为实际操作。特别是关于群体遗传学统计量(如Fst, Nm)的计算和解释,书中都有非常清晰的说明,帮助我理解了不同基因流水平对种群演化的意义。我还记得,在书中关于群体基因组学在适应性进化研究中的应用部分,我被那些通过比较不同地理区域种群的基因组数据,来识别受选择基因的案例深深吸引。这些研究能够直接揭示生物是如何在面对环境压力时,通过遗传变异实现适应性进化的,这对我理解鸟类种群在气候变化下的生存策略提供了极大的启发。总而言之,《Molecular Ecology》不仅仅是一本书,更是我探索分子世界、理解生命演化的重要伙伴。

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《Molecular Ecology》这本书,不仅仅是一本关于理论的书籍,它更像是一本实践指南,为我提供了许多切实可行的研究思路和技术支持。我是一名海洋生物学家,主要研究珊瑚礁生态系统以及它们对气候变化的响应。长期以来,我对珊瑚与共生藻之间的互利关系,以及这种关系在环境压力下的稳定性感到好奇。阅读《Molecular Ecology》后,我才真正理解了分子学技术在研究这些复杂生态关系中的巨大作用。书中关于“共生体基因组学”和“宏基因组学”在研究珊瑚礁生态系统中的应用,为我提供了全新的视角。我开始尝试利用高通量测序技术来分析珊瑚组织中共生藻的组成和多样性,以及研究不同环境条件下(如温度升高、酸化加剧)的基因表达变化。我尤其被书中关于“基因流”在维持珊瑚种群遗传多样性方面的重要性所吸引。通过分析不同地理区域珊瑚种群的遗传标记,我可以了解它们之间的基因交流情况,从而评估它们对环境变化的潜在适应能力。书中关于“环境DNA(eDNA)”在海洋生物多样性监测中的应用也让我眼前一亮。这种技术能够让我们在不直接接触生物体的情况下,了解珊瑚礁中鱼类、无脊椎动物等生物的组成,从而更全面地评估气候变化对整个生态系统的影响。这本书的理论深度和实践指导性,让我能够更自信地投入到海洋生态学的研究中,并为保护脆弱的珊瑚礁生态系统贡献自己的力量。

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《Molecular Ecology》这本书,为我这个对鸟类行为和迁徙研究充满热情的人,打开了一扇通往全新研究领域的大门。我一直着迷于鸟类如何导航、如何寻找配偶以及它们如何适应不断变化的环境。然而,传统的行为观察和标记方法,虽然能够提供一些线索,但在基因层面上缺乏更深入的解析。当我翻阅《Molecular Ecology》时,书中关于“群体遗传学”和“行为生态学”的结合,让我眼前一亮。书中详细介绍了如何利用分子标记来解析鸟类种群的遗传结构、基因流以及亲缘关系,这些信息对于理解它们的迁徙路线、配偶选择策略以及社会结构至关重要。我尤其欣赏书中关于“分子标记辅助的迁徙研究”的章节,其中介绍了如何通过分析鸟类羽毛、血液或粪便样本中的DNA,来追踪它们的迁徙路线、迁徙距离以及在不同区域的种群组成。我记得书中有一个关于某种候鸟的案例,研究者利用线粒体DNA来分析它们在不同迁徙停歇地之间的基因交流情况,从而揭示了它们迁徙路线的复杂性和变异性。此外,书中关于“亲缘关系鉴定”在社会性鸟类研究中的应用也让我深受启发。通过分析鸟类DNA,我们可以准确地判断它们之间的亲缘关系,从而更好地理解它们的繁殖策略、合作行为以及社会等级。这本书不仅为我提供了理论指导,更重要的是,它激发了我利用分子技术来探索鸟类行为背后遗传机制的强烈愿望,让我能够更深入地理解这些迷人的生命。

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作为一名地理学专业的学生,我对环境的物理和化学特征有着浓厚的兴趣,但一直觉得对生物层面的理解不够深入。《Molecular Ecology》这本书,在我的学习过程中扮演了一个至关重要的角色,它为我打开了生物学与地理学交叉领域的大门。书中关于“生物地理学”和“物种分布模型”的章节,通过分子标记来解析物种的地理隔离、迁徙历史和基因流,使我能够更深入地理解物种在不同地理区域的分布模式和演化原因。我尤其欣赏书中关于“环境DNA(eDNA)”在生物地理学研究中的应用,这种技术能够让我们在不进行大规模采样的情况下,了解某一区域的生物多样性组成,从而更准确地绘制物种分布图,并研究环境变化对物种分布的影响。我记得书中有一个关于喜马拉雅山脉中某种小型哺乳动物的案例,研究者利用分子标记追踪了它们在不同海拔和地理隔离区域的基因分化情况,从而揭示了它们是如何在复杂的地形中传播和演化的。《Molecular Ecology》中的这些案例,不仅丰富了我的地理学知识,也让我认识到生物因素在塑造地表形态和生态格局中的重要作用。它帮助我理解了为什么某些物种会在特定地区繁盛,而另一些物种则难以生存,这背后往往是复杂的分子和遗传因素在起作用。这本书让我学会了如何将地理学的空间分析与分子生态学的遗传学分析相结合,从而更全面地理解地球表面的生态系统。

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在众多生态学著作中,《Molecular Ecology》无疑是一颗璀璨的明珠,它以一种前所未有的视角,将分子生物学的强大工具引入了传统的生态学研究领域,深刻地改变了我们对生物界相互作用、进化过程以及环境适应机制的理解。在我拿到这本书的那一刻,就被其厚重的质感和精美的封面所吸引。翻开第一页,就被作者严谨的逻辑和清晰的阐述深深打动。书中不仅详细介绍了分子标记技术在种群遗传学、系统发育学、行为生态学等方面的广泛应用,还探讨了如何利用DNA序列数据来解析物种的起源、分化、迁徙模式以及基因流动的动态。尤其让我印象深刻的是,作者在论述某些复杂概念时,并没有一味地堆砌专业术语,而是通过生动的案例和形象的比喻,让那些原本晦涩难懂的分子机制变得触手可及。例如,在关于基因组学如何揭示物种间亲缘关系的部分,作者巧妙地引用了不同物种的基因组数据,通过对比分析,生动地展示了进化树是如何构建的,以及遗传变异是如何在不同时间尺度上累积并导致新物种形成的。此外,书中对环境DNA(eDNA)的研究方法进行了深入的探讨,这对于监测生物多样性、评估物种分布以及理解环境变化对生态系统的影响具有极其重要的意义。我曾经在一项关于河流生态系统健康的研究中,尝试过使用eDNA技术来调查水生生物的组成,虽然当时的技术尚不成熟,但《Molecular Ecology》中的相关章节为我提供了宝贵的理论基础和实践指导,让我对未来的研究充满信心。这本书不仅仅是一本教科书,更像是一位循循善诱的导师,引领我一步步深入探索分子生态学的奥秘,激发了我对这个领域无穷的兴趣。

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是我为下一阶段读的第一本书,之前没有这方面知识。这本书不难理解,也很实用。

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