本书以化学信息资源检索和化学结构信息可视化为重点,强调现代数据库检索技术的使用,全面地介绍了化学信息与数据库检索的基础知识、常用文摘数据库、常用全文数据库、常用电子期刊、特种信息资源、常用化学事实数据库及文献数据的管理等内容。
另外,本书重点介绍了化学结构的表示和可视化、分子模型的构建及著名的分子图形软件的使用。为了教学的需要,本书也介绍了重要的印刷类化学文献信息。
本书内容新颖,实用性强,适用面广,可作为高等院校有关专业的本科生、研究生教材,也可作为科学研究工作者、专业技术人员和图书情报工作者了解掌握信息检索与管理的学习参考。
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阅读完这本书的导论部分,我立刻产生了一种豁然开朗的感觉。原以为化学信息学是一个高度依赖计算机编程和复杂算法的“硬核”学科,需要扎实的数学和统计学背景才能入门,但这本书巧妙地构建了一个知识的“缓冲带”。作者非常擅长用类比和比喻来解释复杂的概念。比如,他将化合物的结构描述比作一个DNA序列,将数据库的构建比作建立一个庞大而精密的图书馆,而信息学的任务,就是教会我们如何快速地从这座图书馆中检索到那本“救命稻草”——具有特定功能的分子。这种叙述方式极大地降低了初学者的心理门槛,使得那些原本让人望而却步的图论、拓扑学概念,在具体的化学背景下变得生动起来。全书的行文节奏把握得恰到好处,不会让人感到拖沓,也不会因为信息量过大而产生阅读疲劳。每当引入一个新的工具或方法论时,作者总会贴心地附上一个小小的“历史回顾”,介绍它是如何从最初的设想一步步发展至今的,这种对知识演进历程的尊重和呈现,让读者不仅学会了“是什么”,更理解了“为什么会是这样”。
评分这本书的文字风格,与其说是学术论述,不如说更像是一场与领域内资深专家的深度对话。作者的语言充满了一种老派学者的沉稳与洞察力,但又不失现代研究者的敏锐和前瞻性。他对现有技术的局限性和未来研究的潜在方向,都有着独到且中肯的评价。比如,在讨论到基于密集的量子化学计算来进行大规模分子筛选时,作者没有一味地赞美其精确性,而是坦率地指出了其高昂的计算成本和时间消耗,并巧妙地引出了模型预测的必要性和可行性。这种客观且辩证的分析态度,是我在许多同类著作中很少见到的。更值得称赞的是,书中对数据质量和偏差的强调,作者反复告诫读者:“垃圾进,垃圾出”,提醒我们任何高级算法都无法弥补输入数据本身的缺陷。这种对科学诚信和严谨性的坚持,不仅提升了本书的权威性,更潜移默化地影响着读者的科学观。
评分这本书的编排结构,简直就是一本教科书级别的范本,它体现了作者对化学信息学这个交叉学科深刻的理解。它不是简单地堆砌算法和公式,而是精心设计了一条从基础到高级的、循序渐进的学习路径。开篇对化学信息学的基本概念和历史脉络的梳理,为后续的深入探讨打下了坚实的基础。随后,它花费了大量篇幅讲解如何对化学数据进行标准化处理和表示,这是信息学应用的前提,作者对SMILES、InChI等标准编码格式的讲解细致入微,甚至连编码规则中的细微差别都考虑进去了,显示出极高的专业素养。最精彩的部分在于对化学信息检索系统的介绍,作者没有停留在概念层面,而是深入探讨了不同检索策略(如子结构检索、相似性检索)背后的计算复杂度和效率权衡。这种对底层逻辑的剖析,使得读者在实际应用中,能够根据具体需求选择最恰当的技术,而不是盲目地套用公式。读到这些地方,我常常停下来,反思自己过去在做实验时,如果能早点接触到这些系统化的工具和思维方式,效率可能会提高多少倍。
评分我必须承认,这本书在某些章节的阅读体验是充满挑战的,但这种挑战恰恰是其价值所在。比如,涉及到图神经网络在分子表示学习中的应用时,虽然作者力求简化,但涉及到矩阵运算和高维空间映射时,我还是需要借助外部资源进行反复的理解和消化。然而,正是这种“硬骨头”,激发了我更深层次的学习欲望。作者没有将我们视为被动的知识接收者,而是将我们定位为主动的探索者,他提供的是探索的地图和指南针,但真正穿越密林的路,还需要我们自己用思考去开辟。书中后半部分关于知识图谱在化学发现中的应用案例,尤其令人振奋。它描绘了一幅宏伟的蓝图:未来的化学研究将不再是孤立的实验和理论的碰撞,而是一个由海量信息、智能算法和人类智慧紧密编织的网络。这本书,与其说是一本关于“化学信息学”的书,不如说是一扇通往未来化学研究范式的、无可替代的窗口。
评分这本书的封面设计得非常别致,深蓝色的底色上点缀着跃动的分子结构图,视觉冲击力很强,让人一眼就能感受到它蕴含的深邃与严谨。我原本对“信息学”这个词汇抱有一定的距离感,总觉得是晦涩难懂的抽象概念,但翻开这本书的扉页后,我的顾虑立刻烟消云散了。作者的叙事风格极其平易近人,仿佛一位经验丰富的向导,正带着初入迷宫的旅人,一步步清晰地勾勒出整个领域的宏伟蓝图。他没有一开始就抛出那些佶屈聱牙的专业术语,而是从化学研究中遇到的实际问题入手,比如如何高效地筛选药物先导化合物,如何预测化合物的理化性质,这些都是化学家们日常工作中头疼不已的“老大难”。书中对这些问题的梳理脉络清晰,逻辑性极强,让人很容易跟上作者的思路。尤其让我印象深刻的是,他对数据挖掘和机器学习在化学领域应用的阐述,没有停留在理论的层面,而是穿插了大量的、看似不经意的行业案例,这些案例的细节描述得非常到位,让我真切地感受到了前沿科技如何精准地作用于化学实验的每一个环节,那种将冰冷的数据转化为鲜活的化学洞察力的过程,实在是太迷人了。
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