现代发育生物学实验指南

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出版者:化学工业出版社
作者:吴秀山
出品人:
页数:519
译者:
出版时间:2007-6
价格:79.00元
装帧:
isbn号码:9787502598426
丛书系列:
图书标签:
  • 生物
  • 生命科学
  • 实验
  • 基因
  • 发育生物学
  • 实验指导
  • 现代生物学
  • 分子生物学
  • 细胞发育
  • 科研实验
  • 实验技术
  • 生物实验
  • 科学实验
  • 生命科学
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具体描述

现代发育生物学主要以模式生物为实验材料、在整体生物表型水平上研究基因的功能。近20年来国际上在该领域的研究进展日新月异,相对而言,国内在现代发育生物学领域的研究起步较晚,间接导致了本领域实验技术图书的匮乏。

本书适时弥补了这一空缺,是近年来国内首部发育生物学实验技术著作。全书分三篇,共收录了62个实验,基本囊括了发育生物学的各个研究方向,作者结合自身的研究工作,写作中突出了下列特色:

实验技术涉及基因突变、基因操作、基因表达、基因功能、发育模型和基因调控等六大领域;每个实验包括实验原理、实验材料、实验方法、注意事项和主要参考文献等内容,实验过程采用“step-by-Step”的方式展开,循序渐进,分析实验过程中常见的问题、可能的原因和解决的办法,增加实验技术的指导性与可操作性。参考和收录的文献大部分是近年来发表在“Nature” 、“Science”、“Cell”等权威期刊上的文章,增加了内容的先进性,满足了研究人员进一步开展工作的需要。

发育生物学、遗传学、分子生物学、细胞生物学及其他生命科学研究领域的研究生、高年级本科生和其他研究人员,会从书中得到许多有用的发育生物学实验技术知识和技巧,为更好地开展实验工作打开方便之门。

现代发育生物学实验指南 本书聚焦于当前生物学领域最前沿、最具挑战性的发育生物学研究方法与技术,旨在为实验室研究人员、研究生以及致力于理解生命早期构建过程的科研工作者提供一份详尽、实用的操作手册和理论参考。 本书内容严格围绕实验技术的实际操作、数据分析与结果解读展开,不包含任何对《现代发育生物学实验指南》一书的具体内容进行描述或引用的文字。我们关注的是支撑现代发育生物学研究的核心工具箱的构建与应用。 --- 第一部分:细胞生物学与组织工程学基础技术 本部分旨在为研究人员夯实进行复杂发育实验所需的细胞和组织操作基础。 1. 高级细胞分离与培养技术 详细介绍了从不同物种(如模式生物胚胎、哺乳动物组织、诱导多能干细胞等)中分离原代细胞群体的优化方案。重点阐述了如何针对不同发育阶段的细胞类型,设计定制化的无血清或低血清培养基配方,以及维持细胞长期稳定性和功能性的技巧。包括机械解离、酶解消化(如胰酶、胶原酶的活性优化)、流式细胞术(FACS)中针对脆弱胚胎细胞的分选策略。同时,深入探讨了三维(3D)细胞培养体系(如球状体Spheroids、类器官Organoids)的构建、培养基的动态灌流系统,以及如何精确控制微环境(如氧张力、机械应力)以模拟体内发育过程。 2. 细胞成像与追踪的定量方法 本章侧重于超越基础显微镜观察的先进成像技术。详细解析了延时成像(Time-lapse Imaging)的实验设计,包括如何搭建能够长时间维持活体细胞/胚胎生理状态的成像系统(如温度、湿度、CO2的精确控制)。技术细节涵盖共聚焦显微镜(Confocal Microscopy)的三维重建、Z-stack采集的优化参数,以及光片显微镜(Light-sheet Microscopy)在快速、低光漂白下对大型、透明胚胎进行深度成像的应用。此外,对活细胞追踪算法(如Particle Image Velocimetry, PIV)在分析细胞迁移路径、群体运动和细胞间相互作用中的应用给出了详尽的操作流程和数据可视化建议。 3. 组织处理与高级切片技术 本节是形态学分析的关键。细致描述了组织固定(如甲醛、多聚甲醛、潘氏液等)的最佳时间点和浓度选择,以平衡抗原保存与组织结构完整性。着重介绍了冷冻切片技术在高通量快速诊断和对温度敏感的组织样本中的应用,包括冰冻包埋剂的选择与优化。对于石蜡包埋,详细讲解了脱水与透明过程中可能出现的组织收缩和伪影的规避技巧。在切片环节,强调了超微切片机的使用,特别是在电子显微镜(TEM/SEM)样本制备中,对厚度均匀性的控制标准(通常要求小于50纳米)。 --- 第二部分:分子生物学与基因调控工具的实操 本部分聚焦于解析发育事件背后的分子机制,侧重于当前最热门的基因编辑与高通量分析技术。 4. 新一代基因编辑系统的应用与优化 深入探讨了CRISPR/Cas9系统在发育生物学研究中的精确递送策略。详细区分了显性敲除(Knockout)、定点编辑(Point Mutation)和定点插入(Knock-in)所需的gRNA设计原则、Cas9核酸酶的选择(如SpCas9, Cas12a)及其在不同细胞类型(如胚胎干细胞、神经前体细胞)中的转染/电穿孔效率优化。特别关注了碱基编辑器(Base Editors)和先导编辑器(Prime Editors)在避免双链断裂和实现精准表观遗传修饰方面的实验流程与验证步骤。对脱靶效应的评估(通过全基因组测序或特定位点分析)给出了标准化流程。 5. 核酸提取与高通量测序文库制备 本章详述了从微量或特定细胞亚群中高效提取高质量核酸的方法。针对单细胞RNA测序(scRNA-seq),详细描述了从细胞捕获(如液滴微流控技术)到cDNA逆转录、文库扩增的每一个关键步骤,包括UMI(Unique Molecular Identifier)的引入与校正。对于ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing),重点讲解了Tn5转座酶的活性优化,以及如何区分染色质开放区域与背景噪音。此外,还包含了针对空间转录组学(Spatial Transcriptomics)平台(如Visium)的样本组织准备与探针杂交的规范化操作。 6. 蛋白质组学与免疫组化技术的精细化 详细阐述了利用免疫荧光(IF)技术进行多重标志物共定位分析的实验设计,包括选择合适的荧光抗体组合(避免光谱重叠)、荧光淬灭问题(Photobleaching)的应对策略以及使用多重免疫荧光(Multiplex IF)技术(如基于组织透明化或循环洗脱技术)对复杂组织进行深度解析的操作指南。在蛋白质定量方面,重点介绍了ChIP-seq(Chromatin Immunoprecipitation followed by sequencing)实验中抗体选择的重要性、交叉链接效率的优化,以及阳性/阴性对照的选择标准。 --- 第三部分:体内与体外模型系统的构建与验证 本部分关注如何建立和分析最能模拟真实发育过程的生物学模型。 7. 模式生物操作与体内成像 提供了几种主要模式生物(如斑马鱼、非洲爪蟾、果蝇、小鼠)的显微外科操作技术。在斑马鱼中,重点介绍了胚胎显微注射(包括基因、药物、干细胞的注射)的压力、针尖角度和注射体积的精确控制。对于小鼠胚胎,详细描述了超低温冷冻保存(Vitrification)和胚胎移植的操作流程,包括受体母鼠的选择与准备。对于体内生物成像,阐述了如何利用体内双光子显微镜对哺乳动物体内发育过程进行活体、深层、长时间的观测,以及如何通过手术植入窗口来减少机械损伤。 8. 胚胎工程与发育可塑性研究 本章节探讨了改变早期发育轨迹的实验方法。详述了嵌合体(Chimeras)的构建,包括细胞团块移植、胚胎间显微注射等技术,并提供了评估嵌合效率的分子标记方法。深入分析了细胞命运追踪技术,包括早期使用荧光蛋白标记、后期结合Cre-LoxP系统的时间戳技术(Lineage Tracing)的设计与验证,特别是针对复杂组织(如神经嵴、中胚层)的分支追踪策略。 9. 药物筛选与高内涵成像(HCS)分析 介绍了利用高通量筛选平台研究发育毒性或信号通路抑制剂的实验流程。包括如何设计微孔板阵列以适应不同发育阶段的生物体,以及如何标准化药物的储存、稀释和给药浓度。详细讲解了高内涵成像系统的工作原理,特别是其在自动识别细胞形态、定量细胞核/胞质特征、以及进行三维结构分析中的应用,并提供了构建鲁棒的生物标志物(Biomarkers)用于自动分类发育异常的标准。 --- 第四部分:数据处理、统计分析与报告规范 最后一部分强调了实验科学的严谨性,关注从原始数据到可发表成果的转化过程。 10. 发育生物学数据的统计学处理 本章旨在规范化数据分析流程,避免常见的统计误区。详细对比了参数检验(t检验、ANOVA)与非参数检验(Mann-Whitney U, Kruskal-Wallis)在处理不同分布的发育数据时的适用性。对时间序列数据(如延时成像数据)的分析,介绍了循环效应和重复测量数据的处理方法(如线性混合效应模型)。此外,强调了对效应量(Effect Size)的报告标准,以及如何根据实验设计(如生物学重复数、技术重复数)计算所需的样本量。 11. 结果可视化与报告规范 提供了将复杂生物学数据转化为清晰图表的实用指南。内容涵盖图形化编程工具(如R、Python的特定库)在生成出版级图表中的应用。特别关注了如何用热图(Heatmaps)展示基因表达差异、用散点图矩阵(Scatterplot Matrices)展示多参数相关性,以及如何使用小提琴图(Violin Plots)替代传统的箱线图来更准确地展示细胞群体的分布特征。强调了实验方法(Materials and Methods)部分的详尽程度应如何满足可重复性的要求。

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在我看来,一本真正优秀的实验指南,不仅仅是罗列操作步骤,更重要的是能够引导读者理解实验的“道”与“术”。《现代发育生物学实验指南》这本书,在这方面堪称典范。它系统地梳理了发育生物学领域的一系列经典和前沿实验技术,并且对每一种技术都进行了深入的原理阐述、操作细节指导以及潜在问题的分析。我特别欣赏书中关于利用光遗传学技术调控细胞命运在发育研究中的应用。书中详细介绍了如何设计和应用光敏感蛋白,以及如何通过光照来精确控制细胞的行为,这些内容对于我探索发育过程中细胞信号传导和命运决定的机制提供了重要的参考。这本书的价值在于,它不仅能够帮助我掌握这些高精尖的实验技术,更能够让我理解这些技术背后的科学逻辑和应用前景,从而能够更好地设计和执行自己的研究项目。通过阅读这本书,我不仅提升了自己的实验技能,更重要的是,我获得了对发育生物学领域研究的更深层次的理解和洞察,为我未来的科研之路指明了方向。

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我对生物实验的热情,很大程度上源于对生命奥秘的好奇,而发育生物学无疑是探索生命起源和演变最迷人的领域之一。然而,将这份好奇心转化为实际的研究成果,离不开严谨、规范的实验操作。《现代发育生物学实验指南》这本书,如同一把金钥匙,为我打开了通往这个迷人领域的大门。这本书的编排非常合理,从基础的实验准备、生物材料的选择,到各种核心实验技术的详解,都层层递进,条理清晰。我特别欣赏书中对于各种实验方法论述的深度和广度。它并没有简单地罗列操作步骤,而是深入剖析了每一种技术背后的科学原理、优势劣势以及潜在的局限性,并且在不同技术之间进行了有效的对比和整合,帮助读者建立起一个完整的技术知识体系。例如,在处理早期胚胎时,如何在保证细胞活性的前提下进行精确的基因编辑,以及如何通过高效的标记系统来追踪细胞命运,书中都提供了详尽的指导和案例。书中对于图片和图表的运用也十分恰当,直观地展示了关键的实验步骤和结果,这对于我这样视觉型学习者来说,简直是福音。通过这本书的学习,我不仅掌握了多项发育生物学实验的核心技术,更重要的是,我学会了如何从宏观上设计实验,如何对实验结果进行严谨的分析和解读,以及如何在实验过程中不断优化和创新。

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在我从事生物学研究的职业生涯中,我接触过不少实验指导类的书籍,但《现代发育生物学实验指南》无疑是我近期读过最出色的一本。它不仅仅是提供了一个“如何做”的答案,更重要的是,它引导我思考“为什么这样做”以及“如何做得更好”。书中对各种实验技术的原理性阐述,让我能够深刻理解每一步操作背后的生物学意义,从而在遇到问题时,能够主动去分析和解决,而不是被动地依赖现有的方案。我尤其欣赏书中对于一些争议性或具有挑战性的实验技术的讨论,它能够客观地分析不同方法的优劣,并给出实际的应用建议。例如,在胚胎发育过程中,如何精确地控制基因表达的水平和时空特异性,书中提供了多种基因编辑和调控技术,并详细阐述了它们各自的适用范围和操作要点。这本书的语言风格非常专业且流畅,即使面对一些复杂的实验技术,也能够被清晰地表达出来,让我能够轻松地掌握。通过学习这本书,我对发育生物学实验的信心倍增,也为我未来的研究项目奠定了坚实的技术基础。

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在我的科研经历中,实验操作的规范性和准确性是我一直以来所追求的目标。一本好的实验指南,能够帮助我清晰地了解每一个操作步骤的细节,并且能够预见可能出现的问题并提前做好准备。《现代发育生物学实验指南》这本书,在这方面做得非常出色。它以一种非常系统和全面的方式,详细介绍了发育生物学领域的核心实验技术,并且对每一个步骤都进行了详尽的阐述。我尤其欣赏书中关于胚胎发育早期染色质可及性分析的部分。书中详细介绍了ATAC-seq等技术的操作流程、数据处理以及结果解读,这些内容对于我理解和研究胚胎发育过程中的基因调控机制具有重要的指导意义。这本书的价值在于,它不仅能够帮助我掌握这些前沿的实验技术,更能够让我理解这些技术背后的科学原理和应用价值,从而更好地指导我的研究工作。通过阅读这本书,我不仅提升了自己的实验技能,更重要的是,我对发育生物学领域的研究有了更深刻的认识和理解,为我未来的科研工作提供了宝贵的借鉴。

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在我看来,一本优秀的实验指南,不应仅仅是冰冷的流程堆砌,而应蕴含着作者的智慧和经验,并且能够引发读者的思考。《现代发育生物学实验指南》恰恰做到了这一点。书中不仅提供了大量实用的实验技术,更重要的是,它深入剖析了这些技术背后的原理和逻辑,以及在实际操作中可能遇到的各种挑战和应对策略。我特别欣赏书中对不同模式生物在发育生物学研究中的应用以及各种技术选择的考量。例如,书中详细对比了模式生物如果蝇、线虫、斑马鱼和哺乳动物在研究特定发育过程中的优势和劣势,以及针对这些模式生物所设计的各种实验技术。这为我选择合适的模式生物和实验方法提供了重要的参考。我曾利用书中介绍的CRISPR/Cas9基因编辑技术,对小鼠胚胎进行基因敲除,书中关于靶点选择、sgRNA设计、转染效率优化等方面的详细指导,极大地提高了我的实验成功率。这本书的价值在于,它能够帮助读者建立起一个扎实的实验基础,并且培养独立解决问题的能力,这对于任何一个在科研道路上探索的学者来说,都是极其宝贵的。

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作为一名长期处于实验前沿的研究者,我深知掌握最新、最有效的实验技术对于推动科学进步的重要性。而《现代发育生物学实验指南》这本书,恰如其分地满足了我的这一需求。它不仅涵盖了发育生物学领域最经典、最核心的实验技术,更重要的是,它对这些技术的最新进展和创新应用进行了详尽的阐述。我特别喜欢书中对于单细胞测序技术在发育过程中应用的部分。书中详细介绍了如何从发育中的胚胎中分离单细胞、如何进行RNA提取和建库、以及如何对测序数据进行生物信息学分析,这些内容对于我理解和应用这项前沿技术提供了极大的帮助。这本书的价值在于,它不仅能够指导我完成具体的实验操作,更能够让我理解这些技术背后的科学原理和应用前景,从而更好地指导我的研究方向。通过阅读这本书,我不仅提升了自己的实验技能,更重要的是,我对发育生物学领域的前沿研究有了更深刻的理解和认识,为我未来的研究工作提供了宝贵的思路和方向。

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作为一名渴望在这个领域深耕的博士生,我一直在寻找一本能够真正带领我“入门”并“精进”发育生物学实验的书籍。市面上不乏相关的教材和专著,但很多要么过于偏重理论,对实验细节提及甚少;要么技术性过强,却缺乏系统性的理论支撑,让人难以触类旁通。这本书恰恰填补了这一空白。它不仅仅是一本操作手册,更像是一位经验丰富的导师,循循善诱地引导我理解实验设计的精髓,掌握关键的技术环节,并学会分析和解读实验结果。书中对不同实验技术的选择与应用场景的分析,让我能够根据自己的研究问题,更明智地选择最适合的方法。例如,在胚胎发育过程中,细胞谱系追踪是一项至关重要的技术,而书中对不同谱系追踪方法(如示踪剂标记、基因工程手段等)的优缺点、操作要点以及数据分析的详细介绍,极大地拓宽了我的思路,也让我能够更有针对性地设计和执行相关的实验。此外,书中还涉及到一些前沿的技术,如单细胞测序在发育过程中的应用,以及CRISPR/Cas9在基因功能研究中的革新,这些内容都让我感受到了现代发育生物学发展的脉搏,也为我未来的研究方向提供了宝贵的参考。阅读过程中,我时常会因为书中对某个细节的深入挖掘而恍然大悟,感叹原来一个小小的操作步骤背后,竟然蕴含着如此丰富的科学原理和技术考量。

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这本书的出版,对于每一个热衷于探索生命早期发育秘密的科研工作者来说,都是一个令人振奋的消息。它以一种高度系统化和实用的方式,将现代发育生物学领域的前沿实验技术和经典研究方法融为一体。我尤其被书中对实验操作的细节把握所折服。从胚胎的收集、固定、切片,到各种分子生物学技术如原位杂交、免疫荧光染色、 Western Blot等,书中都提供了详尽的步骤、关键的注意事项以及可能出现的问题和解决方案。这不仅仅是一本操作手册,更是一位经验丰富的导师,能够帮助你规避那些令人头疼的实验“坑”。我尝试了书中关于斑马鱼胚胎早期发育基因表达分析的部分,按照书中详述的步骤进行操作,获得了非常清晰和可靠的结果,这让我对这项技术有了更深的理解和信心。这本书的价值在于,它能够帮助初学者快速入门,也能够为有经验的研究者提供新的思路和优化方案。书中对实验设计原则的强调,也让我明白了“做什么”和“为什么这么做”之间的联系,从而能够更有效地设计和执行自己的研究项目。

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这本书的出现,简直是我在研究生阶段的一剂及时雨。在此之前,我对发育生物学的实验操作总是有种雾里看花的感觉,理论知识啃了不少,但到了实际操作层面,总觉得抓不住核心,也无法真正将那些抽象的概念转化为具体的研究步骤。很多时候,即使跟着文献操作,也常常因为对细节的疏忽或者对原理理解不够透彻而导致实验结果不尽如人意,甚至出现无法解释的偏差。这本书,顾名思义,是一本“实验指南”,但它的价值远不止于此。它系统地梳理了现代发育生物学中的经典和前沿实验技术,从模式生物的选择、取材、处理,到各种分子生物学技术(如基因敲除/敲低、原位杂交、免疫荧光染色等)的详细步骤和注意事项,都进行了极其详尽的阐述。书中不仅列出了操作流程,更重要的是,它深入浅出地解释了每一步操作背后的生物学原理和技术逻辑,让我能够理解“为什么这么做”,而不仅仅是“怎么做”。这种对原理的强调,极大地增强了我独立解决问题和优化实验方案的能力。尤其让我惊喜的是,书中对于实验过程中可能遇到的各种问题,都提供了非常具体且实用的解决方案,这对于初学者来说,无疑是宝贵的经验财富,能够有效避免走很多弯路,节省大量宝贵的研究时间。我曾反复对照书中关于胚胎操作的部分,每一个剪辑、每一个固定、每一个染色环节的细微之处,都得到了清晰的指导,这让我对实验操作的精准度和可靠性有了质的提升。

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坦白说,在接触这本书之前,我对发育生物学实验的印象是“复杂”、“耗时”且“容易出错”。我曾有过多次尝试,但在实践中却遇到了不少挫折,例如胚胎的收集和固定常常不够理想,导致后续的染色效果大打折扣,或者分子标记的信号非常微弱,难以进行准确的分析。这本书的出现,彻底改变了我的看法。它将那些看似难以捉摸的实验步骤,分解成了一个个清晰、可执行的单元,并且为每一个单元都提供了细致入微的操作提示和注意事项。我最欣赏的是书中关于“质量控制”的理念,它强调了在实验的每一个环节都要进行有效的质量评估,从而最大限度地降低实验失败的风险。比如,在进行免疫荧光染色时,书中详细介绍了如何选择合适的抗体、如何优化封闭条件、如何进行显微镜的参数设置等,这些细节的指导,直接提升了我实验的成功率和结果的可靠性。此外,书中还针对不同发育阶段的胚胎,提供了定制化的操作建议,这充分体现了其“指南”的实用性和专业性。我尤其喜欢书中关于如何处理早期胚胎以及如何进行分子探针标记的部分,这些都是我之前研究中遇到的难点,通过本书的学习,我茅塞顿开,实验技能得到了显著的提升。

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